[][] ath   AT3G47950 Gene
functional annotation
Function   H[+]-ATPase 4
GO BP
GO:0120029 [list] [network] proton export across plasma membrane  (11 genes)  IEA  
GO:0051453 [list] [network] regulation of intracellular pH  (24 genes)  IBA  
GO:1902600 [list] [network] proton transmembrane transport  (66 genes)  IBA  
GO:0009651 [list] [network] response to salt stress  (485 genes)  IMP  
GO CC
GO:0005886 [list] [network] plasma membrane  (3771 genes)  IDA ISM  
GO:0016021 [list] [network] integral component of membrane  (4803 genes)  IEA  
GO MF
GO:0008553 [list] [network] proton-exporting ATPase activity, phosphorylative mechanism  (22 genes)  IBA ISS  
GO:0016887 [list] [network] ATPase activity  (507 genes)  ISS  
GO:0005524 [list] [network] ATP binding  (2003 genes)  IEA  
GO:0046872 [list] [network] metal ion binding  (3180 genes)  IEA  
KEGG ath00190 [list] [network] Oxidative phosphorylation (142 genes)
Protein NP_001325714.1  NP_190378.2 
BLAST NP_001325714.1  NP_190378.2 
Orthologous [Ortholog page] LOC542048 (zma)LOC542052 (zma)LOC542303 (zma)LHA2 (sly)LHA1 (sly)LOC547525 (gma)HA6 (ath)HA1 (ath)HA5 (ath)HA8 (ath)HA7 (ath)HA2 (ath)HA3 (ath)HA11 (ath)AHA10 (ath)HA9 (ath)LOC4331015 (osa)LOC4331281 (osa)LOC4331853 (osa)LOC4333770 (osa)LOC4337257 (osa)LOC4338405 (osa)LOC4340312 (osa)LOC4342621 (osa)LOC4345039 (osa)LOC4352910 (osa)LOC7455665 (ppo)LOC7458476 (ppo)LOC7458740 (ppo)LOC7471648 (ppo)LOC7489469 (ppo)LOC11436640 (mtr)LOC11439650 (mtr)LOC11445796 (mtr)LOC25481869 (mtr)LOC25487966 (mtr)LOC25488288 (mtr)LOC25493803 (mtr)LOC25493981 (mtr)LOC25495267 (mtr)LOC25499747 (mtr)LOC25500040 (mtr)LOC25501294 (mtr)LOC100216710 (zma)LOC100241576 (vvi)LOC100242786 (vvi)LOC100246249 (vvi)LOC100249749 (vvi)LOC100254244 (vvi)LOC100257762 (vvi)LOC100265284 (vvi)LOC100267065 (vvi)LOC100383137 (zma)LOC100383411 (zma)LOC100383860 (zma)LOC100383904 (zma)LOC100501185 (zma)LOC100502231 (zma)LOC100778065 (gma)LOC100782329 (gma)LOC100782459 (gma)LOC100785442 (gma)LOC100791692 (gma)LOC100794372 (gma)LOC100795836 (gma)LOC100796240 (gma)LOC100796279 (gma)LOC100798717 (gma)LOC100802859 (gma)LOC100804422 (gma)LOC100805218 (gma)LOC100806187 (gma)LOC100806580 (gma)LOC100816905 (gma)LOC100818043 (gma)LOC100818268 (gma)LOC100818997 (gma)LOC100819324 (gma)LOC101247697 (sly)LOC101249063 (sly)LHA4 (sly)LOC101266320 (sly)LOC101267257 (sly)LOC102668626 (gma)LOC103629702 (zma)LOC103631462 (zma)LOC103638716 (zma)LOC103828351 (bra)LOC103830447 (bra)LOC103832468 (bra)LOC103834686 (bra)LOC103835963 (bra)LOC103837929 (bra)LOC103841882 (bra)LOC103842249 (bra)LOC103845176 (bra)LOC103851779 (bra)LOC103852852 (bra)LOC103853056 (bra)LOC103855020 (bra)LOC103860344 (bra)LOC103861934 (bra)LOC103861935 (bra)LOC103862889 (bra)LOC103874056 (bra)
Subcellular
localization
wolf
plas 9,  cyto 1,  vacu 1  (predict for NP_001325714.1)
plas 9,  cyto 1,  vacu 1  (predict for NP_190378.2)
Subcellular
localization
TargetP
other 8  (predict for NP_001325714.1)
other 8  (predict for NP_190378.2)
Gene coexpression
Network*for
coexpressed
genes
LCNloc
[Cytoscape]
Genes directly connected with HA4 on the network
coex z* Locus Function* Coexpression
detail
Entrez Gene ID*
5.6 AT1G49960 Xanthine/uracil permease family protein [detail] 841419
4.7 AT4G24140 alpha/beta-Hydrolases superfamily protein [detail] 828514
4.6 AT5G37690 SGNH hydrolase-type esterase superfamily protein [detail] 833748
Coexpressed
gene list
[Coexpressed gene list for HA4]
Gene expression
All samples [Expression pattern for all samples]
AtGenExpress*
(Development)
252395_at
252395_at.png

X axis is samples (pdf file), and Y axis is log2-expression.
"1st Q", "mean" and "3rd Q" indecate the values for all genes on a GeneChip. Q: quartile.

AtGenExpress*
(Stress)
252395_at
252395_at.png

X axis is samples (pdf file), and Y axis is log2-expression.

AtGenExpress*
(Hormone)
252395_at
252395_at.png

X axis is samples (xls file), and Y axis is log-expression.

Link to other DBs
Entrez Gene ID 823950    
Refseq ID (protein) NP_001325714.1 
NP_190378.2 


The preparation time of this page was 0.2 [sec].