[][] ath   AT5G38940 Gene
functional annotation
Function   RmlC-like cupins superfamily protein
GO BP
GO CC
GO:0048046 [list] [network] apoplast  (443 genes)  IEA  
GO:0005618 [list] [network] cell wall  (685 genes)  IBA IDA  
GO:0005576 [list] [network] extracellular region  (3363 genes)  ISM  
GO MF
GO:0030145 [list] [network] manganese ion binding  (47 genes)  IEA  
GO:0045735 [list] [network] nutrient reservoir activity  (55 genes)  IEA  
KEGG
Protein NP_001330896.1  NP_198710.2 
BLAST NP_001330896.1  NP_198710.2 
Orthologous [Ortholog page] AT3G04200 (ath)AT3G05950 (ath)GLP9 (ath)AT5G38910 (ath)AT5G38930 (ath)AT5G38960 (ath)GLP6 (ath)AT5G39110 (ath)AT5G39120 (ath)AT5G39130 (ath)AT5G39150 (ath)AT5G39160 (ath)AT5G39180 (ath)GER2 (ath)LOC4329389 (osa)LOC4329390 (osa)LOC4329391 (osa)LOC4337008 (osa)LOC4344837 (osa)LOC4344838 (osa)LOC4344841 (osa)LOC4344843 (osa)LOC4344844 (osa)LOC4344846 (osa)LOC4344999 (osa)LOC4351537 (osa)LOC4351538 (osa)LOC4351539 (osa)LOC7480416 (ppo)LOC7487706 (ppo)LOC9272376 (osa)LOC11412593 (mtr)LOC11414422 (mtr)LOC11414568 (mtr)LOC11419235 (mtr)LOC11422481 (mtr)LOC11424098 (mtr)LOC11425078 (mtr)LOC11425316 (mtr)LOC11426661 (mtr)LOC11429372 (mtr)LOC11433625 (mtr)LOC11433956 (mtr)LOC11434895 (mtr)LOC11439325 (mtr)LOC25486309 (mtr)LOC25486310 (mtr)LOC25486313 (mtr)LOC100232941 (vvi)GER1 (vvi)GER4 (vvi)GER7 (vvi)GER5 (vvi)LOC100240807 (vvi)LOC100240839 (vvi)LOC100242546 (vvi)LOC100242782 (vvi)LOC100243126 (vvi)LOC100243864 (vvi)LOC100243981 (vvi)LOC100244270 (vvi)LOC100244552 (vvi)LOC100245589 (vvi)LOC100247597 (vvi)LOC100247931 (vvi)LOC100249403 (vvi)LOC100249435 (vvi)LOC100251041 (vvi)LOC100251187 (vvi)LOC100252737 (vvi)LOC100252783 (vvi)LOC100254415 (vvi)LOC100254460 (vvi)LOC100254770 (vvi)LOC100256198 (vvi)LOC100256308 (vvi)LOC100258077 (vvi)LOC100258094 (vvi)LOC100259518 (vvi)LOC100260968 (vvi)LOC100261293 (vvi)LOC100261880 (vvi)LOC100264708 (vvi)LOC100264862 (vvi)LOC100265074 (vvi)LOC100266609 (vvi)LOC100273345 (zma)LOC100286113 (zma)LOC100306389 (gma)GER3 (gma)GER12 (gma)GER2 (gma)GER13 (gma)GER14 (gma)LOC100780252 (gma)LOC100780789 (gma)LOC100782768 (gma)LOC100783871 (gma)LOC100786576 (gma)GER4 (gma)LOC100788721 (gma)GER11 (gma)LOC100797415 (gma)GER6 (gma)LOC100803440 (gma)LOC100814242 (gma)GER20 (gma)LOC100818120 (gma)LOC100820481 (gma)LOC100853010 (vvi)LOC100853695 (vvi)LOC100853730 (vvi)LOC101249492 (sly)LOC101253136 (sly)LOC101253431 (sly)LOC101253729 (sly)LOC101253951 (sly)LOC101254252 (sly)LOC102660582 (gma)LOC103626662 (zma)LOC103641112 (zma)LOC103641113 (zma)LOC103641117 (zma)LOC103641119 (zma)LOC103641518 (zma)LOC103653008 (zma)LOC103653009 (zma)LOC103653010 (zma)LOC103653011 (zma)LOC103653012 (zma)LOC103653013 (zma)LOC103653014 (zma)LOC103653015 (zma)LOC103653016 (zma)LOC103653018 (zma)LOC103653019 (zma)LOC103653021 (zma)LOC103653022 (zma)LOC103653023 (zma)LOC103653024 (zma)LOC103653025 (zma)LOC103654664 (zma)LOC103833457 (bra)LOC103838740 (bra)LOC103850001 (bra)LOC103850135 (bra)LOC103850187 (bra)LOC103854691 (bra)LOC103863820 (bra)LOC103864164 (bra)LOC103864208 (bra)LOC104882055 (vvi)LOC109121459 (vvi)LOC109121478 (vvi)LOC109121479 (vvi)LOC109121491 (vvi)LOC109123824 (vvi)LOC109123856 (vvi)LOC109123878 (vvi)LOC109123887 (vvi)LOC109123892 (vvi)LOC109123900 (vvi)LOC109123939 (vvi)LOC109945489 (zma)LOC112935981 (osa)LOC112935992 (osa)LOC112936027 (osa)
Subcellular
localization
wolf
chlo 4,  extr 3,  cyto 1,  mito 1  (predict for NP_001330896.1)
extr 4,  chlo 1,  mito 1,  vacu 1,  chlo_mito 1  (predict for NP_198710.2)
Subcellular
localization
TargetP
other 3  (predict for NP_001330896.1)
scret 9  (predict for NP_198710.2)
Gene coexpression
Network*for
coexpressed
genes
LCNloc
[Cytoscape]
Genes directly connected with AT5G38940 on the network
coex z* Locus Function* Coexpression
detail
Entrez Gene ID*
9.8 AT4G22513 Bifunctional inhibitor/lipid-transfer protein/seed storage 2S albumin superfamily protein [detail] 5008158
9.3 AT4G22517 Bifunctional inhibitor/lipid-transfer protein/seed storage 2S albumin superfamily protein [detail] 5008159
8.8 AT5G64110 Peroxidase superfamily protein [detail] 836532
6.4 AT2G30670 NAD(P)-binding Rossmann-fold superfamily protein [detail] 817617
Coexpressed
gene list
[Coexpressed gene list for AT5G38940]
Gene expression
All samples [Expression pattern for all samples]
Link to other DBs
Entrez Gene ID 833886    
Refseq ID (protein) NP_001330896.1 
NP_198710.2 


The preparation time of this page was 0.2 [sec].