[][] ath   AT2G33160 Gene
functional annotation
Function   glycoside hydrolase family 28 protein / polygalacturonase (pectinase) family protein
GO BP
GO:0080159 [list] [network] zygote elongation  (2 genes)  IMP  
GO:0010098 [list] [network] suspensor development  (12 genes)  IMP  
GO:0071555 [list] [network] cell wall organization  (538 genes)  IEA  
GO:0009793 [list] [network] embryo development ending in seed dormancy  (547 genes)  IMP  
GO:0005975 [list] [network] carbohydrate metabolic process  (995 genes)  IEA  
GO CC
GO:0005618 [list] [network] cell wall  (685 genes)  IDA  
GO:0005576 [list] [network] extracellular region  (3363 genes)  IEA ISM  
GO MF
GO:0004523 [list] [network] RNA-DNA hybrid ribonuclease activity  (39 genes)  IEA  
GO:0004650 [list] [network] polygalacturonase activity  (52 genes)  IEA  
GO:0003676 [list] [network] nucleic acid binding  (4187 genes)  IEA  
KEGG
Protein NP_180874.1 
BLAST NP_180874.1 
Orthologous [Ortholog page] LOC542387 (zma)LOC732772 (zma)AT2G15450 (ath)AT2G15460 (ath)AT2G15470 (ath)AT2G26620 (ath)AT2G40310 (ath)AT3G07820 (ath)AT3G07830 (ath)AT3G07840 (ath)AT3G07850 (ath)AT3G14040 (ath)AT4G13760 (ath)AT4G18180 (ath)AT5G48140 (ath)AT1G17150 (ath)AT1G43080 (ath)AT1G43090 (ath)AT1G43100 (ath)AT1G78400 (ath)LOC4323970 (osa)LOC4328617 (osa)LOC4341242 (osa)LOC4341243 (osa)LOC4341514 (osa)LOC4341515 (osa)LOC4345285 (osa)LOC7468605 (ppo)LOC7477987 (ppo)LOC7481681 (ppo)LOC7491350 (ppo)LOC11415149 (mtr)LOC11422898 (mtr)LOC11427911 (mtr)LOC11434881 (mtr)LOC25490499 (mtr)LOC25500883 (mtr)LOC100191230 (zma)LOC100242022 (vvi)LOC100242658 (vvi)LOC100243609 (vvi)LOC100247162 (vvi)LOC100247792 (vvi)LOC100251285 (vvi)LOC100254136 (vvi)LOC100259750 (vvi)LOC100264306 (vvi)LOC100264944 (vvi)LOC100267512 (vvi)LOC100273711 (zma)LOC100273946 (zma)LOC100285881 (zma)LOC100779447 (gma)LOC100779556 (gma)LOC100780097 (gma)LOC100780628 (gma)LOC100784156 (gma)LOC100788863 (gma)LOC100795460 (gma)LOC100810484 (gma)LOC100812594 (gma)LOC100819348 (gma)LOC101244096 (sly)LOC101245486 (sly)LOC101248339 (sly)LOC101248624 (sly)LOC101249384 (sly)LOC101249539 (sly)LOC101268588 (sly)LOC103626843 (zma)LOC103626848 (zma)LOC103629730 (zma)LOC103629733 (zma)LOC103629734 (zma)LOC103629735 (zma)LOC103629743 (zma)LOC103631311 (zma)LOC103639332 (zma)LOC103653359 (zma)LOC103828990 (bra)LOC103831485 (bra)LOC103832320 (bra)LOC103849010 (bra)LOC103849020 (bra)LOC103849039 (bra)LOC103854518 (bra)LOC103857474 (bra)LOC103857926 (bra)LOC103858095 (bra)LOC103858475 (bra)LOC103859243 (bra)LOC103859244 (bra)LOC103859245 (bra)LOC103860974 (bra)LOC103863172 (bra)LOC103865247 (bra)LOC103865787 (bra)MF16 (bra)LOC103872502 (bra)LOC103874929 (bra)LOC109121790 (vvi)LOC109123473 (vvi)
Subcellular
localization
wolf
vacu 6,  plas 1,  E.R. 1,  golg 1,  golg_plas 1,  E.R._plas 1  (predict for NP_180874.1)
Subcellular
localization
TargetP
scret 9  (predict for NP_180874.1)
Gene coexpression
Network*for
coexpressed
genes
Coexpressed
gene list
[Coexpressed gene list for AT2G33160]
Gene expression
All samples [Expression pattern for all samples]
AtGenExpress*
(Development)
245157_at
245157_at.png

X axis is samples (pdf file), and Y axis is log2-expression.
"1st Q", "mean" and "3rd Q" indecate the values for all genes on a GeneChip. Q: quartile.

AtGenExpress*
(Stress)
245157_at
245157_at.png

X axis is samples (pdf file), and Y axis is log2-expression.

AtGenExpress*
(Hormone)
245157_at
245157_at.png

X axis is samples (xls file), and Y axis is log-expression.

Link to other DBs
Entrez Gene ID 817877    
Refseq ID (protein) NP_180874.1 


The preparation time of this page was 0.2 [sec].