[][] ath   AT3G07840 Gene
functional annotation
Function   Pectin lyase-like superfamily protein
GO BP
GO:0071555 [list] [network] cell wall organization  (538 genes)  IEA  
GO:0005975 [list] [network] carbohydrate metabolic process  (995 genes)  IEA  
GO CC
GO:0005576 [list] [network] extracellular region  (3363 genes)  IEA ISM  
GO MF
GO:0004650 [list] [network] polygalacturonase activity  (52 genes)  IEA  
GO:0016829 [list] [network] lyase activity  (412 genes)  IEA  
KEGG
Protein NP_187441.1 
BLAST NP_187441.1 
Orthologous [Ortholog page] LOC542387 (zma)LOC732772 (zma)AT2G15450 (ath)AT2G15460 (ath)AT2G15470 (ath)AT2G26620 (ath)AT2G33160 (ath)AT2G40310 (ath)AT3G07820 (ath)AT3G07830 (ath)AT3G07850 (ath)AT3G14040 (ath)AT4G13760 (ath)AT4G18180 (ath)AT5G48140 (ath)AT1G17150 (ath)AT1G43080 (ath)AT1G43090 (ath)AT1G43100 (ath)AT1G78400 (ath)LOC4323970 (osa)LOC4328617 (osa)LOC4341242 (osa)LOC4341243 (osa)LOC4341514 (osa)LOC4341515 (osa)LOC4345285 (osa)LOC7468605 (ppo)LOC7477987 (ppo)LOC7481681 (ppo)LOC7491350 (ppo)LOC11415149 (mtr)LOC11422898 (mtr)LOC11427911 (mtr)LOC11434881 (mtr)LOC25490499 (mtr)LOC25500883 (mtr)LOC100191230 (zma)LOC100242022 (vvi)LOC100242658 (vvi)LOC100243609 (vvi)LOC100247162 (vvi)LOC100247792 (vvi)LOC100251285 (vvi)LOC100254136 (vvi)LOC100259750 (vvi)LOC100264306 (vvi)LOC100264944 (vvi)LOC100267512 (vvi)LOC100273711 (zma)LOC100273946 (zma)LOC100285881 (zma)LOC100779447 (gma)LOC100779556 (gma)LOC100780097 (gma)LOC100780628 (gma)LOC100784156 (gma)LOC100788863 (gma)LOC100795460 (gma)LOC100810484 (gma)LOC100812594 (gma)LOC100819348 (gma)LOC101244096 (sly)LOC101245486 (sly)LOC101248339 (sly)LOC101248624 (sly)LOC101249384 (sly)LOC101249539 (sly)LOC101268588 (sly)LOC103626843 (zma)LOC103626848 (zma)LOC103629730 (zma)LOC103629733 (zma)LOC103629734 (zma)LOC103629735 (zma)LOC103629743 (zma)LOC103631311 (zma)LOC103639332 (zma)LOC103653359 (zma)LOC103828990 (bra)LOC103831485 (bra)LOC103832320 (bra)LOC103849010 (bra)LOC103849020 (bra)LOC103849039 (bra)LOC103854518 (bra)LOC103857474 (bra)LOC103857926 (bra)LOC103858095 (bra)LOC103858475 (bra)LOC103859243 (bra)LOC103859244 (bra)LOC103859245 (bra)LOC103860974 (bra)LOC103863172 (bra)LOC103865247 (bra)LOC103865787 (bra)MF16 (bra)LOC103872502 (bra)LOC103874929 (bra)LOC109121790 (vvi)LOC109123473 (vvi)
Subcellular
localization
wolf
extr 6,  cyto 2,  cysk 2  (predict for NP_187441.1)
Subcellular
localization
TargetP
scret 9  (predict for NP_187441.1)
Gene coexpression
Network*for
coexpressed
genes
Coexpressed
gene list
[Coexpressed gene list for AT3G07840]
Gene expression
All samples [Expression pattern for all samples]
AtGenExpress*
(Development)
258686_at
258686_at.png

X axis is samples (pdf file), and Y axis is log2-expression.
"1st Q", "mean" and "3rd Q" indecate the values for all genes on a GeneChip. Q: quartile.

AtGenExpress*
(Stress)
258686_at
258686_at.png

X axis is samples (pdf file), and Y axis is log2-expression.

AtGenExpress*
(Hormone)
258686_at
258686_at.png

X axis is samples (xls file), and Y axis is log-expression.

Link to other DBs
Entrez Gene ID 819975    
Refseq ID (protein) NP_187441.1 


The preparation time of this page was 0.1 [sec].