[][] ath   AT3G07850 Gene
functional annotation
Function   Pectin lyase-like superfamily protein
GO BP
GO:0071555 [list] [network] cell wall organization  (538 genes)  IEA  
GO:0005975 [list] [network] carbohydrate metabolic process  (995 genes)  IEA  
GO CC
GO:0005618 [list] [network] cell wall  (685 genes)  IEA  
GO:0005576 [list] [network] extracellular region  (3363 genes)  IEA ISM  
GO MF
GO:0047911 [list] [network] galacturan 1,4-alpha-galacturonidase activity  (2 genes)  IEA  
GO:0004650 [list] [network] polygalacturonase activity  (52 genes)  IEA  
KEGG ath00040 [list] [network] Pentose and glucuronate interconversions (96 genes)
Protein NP_187442.1 
BLAST NP_187442.1 
Orthologous [Ortholog page] LOC542387 (zma)LOC732772 (zma)AT2G15450 (ath)AT2G15460 (ath)AT2G15470 (ath)AT2G26620 (ath)AT2G33160 (ath)AT2G40310 (ath)AT3G07820 (ath)AT3G07830 (ath)AT3G07840 (ath)AT3G14040 (ath)AT4G13760 (ath)AT4G18180 (ath)AT5G48140 (ath)AT1G17150 (ath)AT1G43080 (ath)AT1G43090 (ath)AT1G43100 (ath)AT1G78400 (ath)LOC4323970 (osa)LOC4328617 (osa)LOC4341242 (osa)LOC4341243 (osa)LOC4341514 (osa)LOC4341515 (osa)LOC4345285 (osa)LOC7468605 (ppo)LOC7477987 (ppo)LOC7481681 (ppo)LOC7491350 (ppo)LOC11415149 (mtr)LOC11422898 (mtr)LOC11427911 (mtr)LOC11434881 (mtr)LOC25490499 (mtr)LOC25500883 (mtr)LOC100191230 (zma)LOC100242022 (vvi)LOC100242658 (vvi)LOC100243609 (vvi)LOC100247162 (vvi)LOC100247792 (vvi)LOC100251285 (vvi)LOC100254136 (vvi)LOC100259750 (vvi)LOC100264306 (vvi)LOC100264944 (vvi)LOC100267512 (vvi)LOC100273711 (zma)LOC100273946 (zma)LOC100285881 (zma)LOC100779447 (gma)LOC100779556 (gma)LOC100780097 (gma)LOC100780628 (gma)LOC100784156 (gma)LOC100788863 (gma)LOC100795460 (gma)LOC100810484 (gma)LOC100812594 (gma)LOC100819348 (gma)LOC101244096 (sly)LOC101245486 (sly)LOC101248339 (sly)LOC101248624 (sly)LOC101249384 (sly)LOC101249539 (sly)LOC101268588 (sly)LOC103626843 (zma)LOC103626848 (zma)LOC103629730 (zma)LOC103629733 (zma)LOC103629734 (zma)LOC103629735 (zma)LOC103629743 (zma)LOC103631311 (zma)LOC103639332 (zma)LOC103653359 (zma)LOC103828990 (bra)LOC103831485 (bra)LOC103832320 (bra)LOC103849010 (bra)LOC103849020 (bra)LOC103849039 (bra)LOC103854518 (bra)LOC103857474 (bra)LOC103857926 (bra)LOC103858095 (bra)LOC103858475 (bra)LOC103859243 (bra)LOC103859244 (bra)LOC103859245 (bra)LOC103860974 (bra)LOC103863172 (bra)LOC103865247 (bra)LOC103865787 (bra)MF16 (bra)LOC103872502 (bra)LOC103874929 (bra)LOC109121790 (vvi)LOC109123473 (vvi)
Subcellular
localization
wolf
extr 6,  E.R. 1,  chlo 1,  cyto 1,  golg 1,  E.R._vacu 1,  E.R._plas 1  (predict for NP_187442.1)
Subcellular
localization
TargetP
scret 9  (predict for NP_187442.1)
Gene coexpression
Network*for
coexpressed
genes
LCNloc
[Cytoscape]
KEGG* ID Title #genes Link to the KEGG* map
(Multiple genes)
ath00040 Pentose and glucuronate interconversions 2
ath00053 Ascorbate and aldarate metabolism 2
Genes directly connected with AT3G07850 on the network
coex z* Locus Function* Coexpression
detail
Entrez Gene ID*
17.0 AT3G14040 Pectin lyase-like superfamily protein [detail] 820618
14.0 AT5G07410 Pectin lyase-like superfamily protein [detail] 830632
13.3 sks12 SKU5 similar 12 [detail] 842006
13.2 AT3G28790 transmembrane protein, putative (DUF1216) [detail] 822511
Coexpressed
gene list
[Coexpressed gene list for AT3G07850]
Gene expression
All samples [Expression pattern for all samples]
Link to other DBs
Entrez Gene ID 819976    
Refseq ID (protein) NP_187442.1 


The preparation time of this page was 0.3 [sec].