[][] ath   At3g09480 Gene
functional annotation
Function   Histone superfamily protein
GO BP
GO CC
GO:0005829 [list] [network] cytosol  (2559 genes)  HDA  
GO:0005634 [list] [network] nucleus  (10305 genes)  ISM  
GO MF
KEGG
Protein NP_187559.1 
BLAST NP_187559.1 
Orthologous [Ortholog page] LOC543183 (tae)LOC543184 (tae)H2B-1 (sly)H2B-2 (sly)AT2G28720 (ath)AT2G37470 (ath)HTB9 (ath)HTB11 (ath)AT5G02570 (ath)HTB2 (ath)HTB4 (ath)HTB1 (ath)AT1G08170 (ath)LOC4324495 (osa)LOC4324500 (osa)LOC4324502 (osa)LOC4324504 (osa)LOC4324510 (osa)LOC4324512 (osa)LOC4327384 (osa)LOC4339681 (osa)LOC4345904 (osa)LOC7463471 (ppo)LOC7468455 (ppo)LOC9268195 (osa)LOC11416780 (mtr)LOC11417139 (mtr)LOC11426605 (mtr)LOC11431194 (mtr)LOC11432921 (mtr)LOC11442767 (mtr)LOC18099399 (ppo)LOC18101340 (ppo)LOC18101345 (ppo)LOC18101997 (ppo)LOC25484839 (mtr)LOC25485824 (mtr)LOC25492478 (mtr)LOC25492530 (mtr)LOC25492533 (mtr)LOC25492556 (mtr)LOC25492748 (mtr)LOC25493050 (mtr)AT3G53650 (ath)LOC100305731 (gma)LOC100305866 (gma)LOC100499734 (gma)LOC100500314 (gma)LOC100789702 (gma)LOC100793796 (gma)LOC100805396 (gma)LOC100806140 (gma)LOC100817849 (gma)LOC100820177 (gma)LOC101244346 (sly)LOC101245134 (sly)LOC101252186 (sly)LOC101253792 (sly)H2B-3 (sly)LOC101261496 (sly)LOC101264987 (sly)LOC101267024 (sly)LOC103829764 (bra)LOC103829945 (bra)LOC103841289 (bra)LOC103845413 (bra)LOC103845511 (bra)LOC103851535 (bra)LOC103856534 (bra)LOC103856593 (bra)LOC103858282 (bra)LOC103863386 (bra)LOC103864913 (bra)LOC103871565 (bra)LOC103873395 (bra)LOC104648016 (sly)LOC111828532 (gma)LOC123058767 (tae)LOC123060157 (tae)LOC123062534 (tae)LOC123065905 (tae)LOC123065907 (tae)LOC123067631 (tae)LOC123071359 (tae)LOC123071360 (tae)LOC123074963 (tae)LOC123077165 (tae)LOC123079622 (tae)LOC123079691 (tae)LOC123079692 (tae)LOC123085475 (tae)LOC123090912 (tae)LOC123092567 (tae)LOC123097871 (tae)LOC123123408 (tae)LOC123130073 (tae)LOC123131716 (tae)LOC123131742 (tae)LOC123131994 (tae)LOC123135599 (tae)LOC123135602 (tae)LOC123136072 (tae)LOC123143166 (tae)LOC123143167 (tae)LOC123143170 (tae)LOC123145258 (tae)LOC123149322 (tae)LOC123161516 (tae)LOC123182269 (tae)LOC123403140 (hvu)LOC123403540 (hvu)LOC123405990 (hvu)LOC123406969 (hvu)LOC123409969 (hvu)LOC123409970 (hvu)LOC123409971 (hvu)LOC123410923 (hvu)LOC123426815 (hvu)LOC123435801 (hvu)LOC123435817 (hvu)LOC123439792 (hvu)LOC123440449 (hvu)LOC123440491 (hvu)LOC123440547 (hvu)LOC123442703 (hvu)LOC123442706 (hvu)LOC123443358 (hvu)LOC123443409 (hvu)LOC123444939 (hvu)LOC123445412 (hvu)LOC123447601 (hvu)LOC123449496 (hvu)LOC123449853 (hvu)LOC123451652 (hvu)LOC123452195 (hvu)
Subcellular
localization
wolf
nucl 10  (predict for NP_187559.1)
Subcellular
localization
TargetP
other 9  (predict for NP_187559.1)
Gene coexpression
Network*for
coexpressed
genes
LCNloc
[Cytoscape]
Genes directly connected with AT3G09480 on the network
coex z* Locus Function* CoexViewer Entrez Gene ID*
9.8 AT2G37470 Histone superfamily protein [detail] 818324
8.6 HTA13 histone H2A 13 [detail] 821614
8.4 AT3G53650 Histone superfamily protein [detail] 28719403
Coexpressed
gene list
[Coexpressed gene list for AT3G09480]
Gene expression
All samples [Expression pattern for all samples]
AtGenExpress*
(Development)
258707_at
258707_at.png

X axis is samples (pdf file), and Y axis is log2-expression.
"1st Q", "mean" and "3rd Q" indecate the values for all genes on a GeneChip. Q: quartile.

AtGenExpress*
(Stress)
258707_at
258707_at.png

X axis is samples (pdf file), and Y axis is log2-expression.

AtGenExpress*
(Hormone)
258707_at
258707_at.png

X axis is samples (xls file), and Y axis is log-expression.

Link to other DBs
Entrez Gene ID 820105    
Refseq ID (protein) NP_187559.1 


The preparation time of this page was 0.1 [sec].