[][] ath   At4g27290 Gene
functional annotation
Function   S-locus lectin protein kinase family protein Plant GARDENPlant GARDEN JBrowse
GO BP
GO CC
GO:0005576 [list] [network] extracellular region  (3154 genes)  ISM  
GO MF
GO:0005516 [list] [network] calmodulin binding  (128 genes)  ISS  
GO:0004674 [list] [network] protein serine/threonine kinase activity  (454 genes)  ISS  
KEGG
Protein NP_001329181.1  NP_194459.4 
BLAST NP_001329181.1  NP_194459.4 
Orthologous [Ortholog page] LOC4333240 (osa)LOC4337118 (osa)LOC7454383 (ppo)LOC7454386 (ppo)LOC7454387 (ppo)LOC7454388 (ppo)LOC7460865 (ppo)LOC7461173 (ppo)LOC7462372 (ppo)LOC7462377 (ppo)LOC7475946 (ppo)LOC7475947 (ppo)LOC7497006 (ppo)LOC7497015 (ppo)LOC7497957 (ppo)LOC7498011 (ppo)LOC9271091 (osa)LOC11405755 (mtr)LOC11406881 (mtr)LOC11406953 (mtr)LOC11407683 (mtr)LOC11408437 (mtr)LOC11409005 (mtr)LOC11411770 (mtr)LOC11411809 (mtr)LOC11412687 (mtr)LOC11412707 (mtr)LOC11416195 (mtr)LOC11416281 (mtr)LOC11417318 (mtr)LOC11417718 (mtr)LOC11418307 (mtr)LOC11418536 (mtr)LOC11419710 (mtr)LOC11421613 (mtr)LOC11422950 (mtr)LOC11424236 (mtr)LOC11429525 (mtr)LOC11435592 (mtr)LOC18095677 (ppo)LOC18095678 (ppo)LOC18095679 (ppo)LOC18095681 (ppo)LOC18095682 (ppo)LOC18095686 (ppo)LOC18095690 (ppo)LOC18095694 (ppo)LOC18095699 (ppo)LOC18095700 (ppo)LOC18095701 (ppo)LOC18095703 (ppo)LOC18095705 (ppo)LOC18095707 (ppo)LOC18095709 (ppo)LOC18095859 (ppo)LOC18095861 (ppo)LOC18095906 (ppo)LOC18098593 (ppo)LOC18102283 (ppo)LOC18102284 (ppo)LOC18102285 (ppo)LOC18102287 (ppo)LOC18102288 (ppo)LOC18103392 (ppo)LOC18103394 (ppo)LOC18103395 (ppo)LOC18103396 (ppo)LOC18103397 (ppo)LOC18103404 (ppo)LOC18103410 (ppo)LOC18103412 (ppo)LOC18110381 (ppo)LOC18110798 (ppo)LOC18110799 (ppo)LOC18110804 (ppo)LOC18110810 (ppo)LOC25480228 (mtr)LOC25492953 (mtr)LOC25492954 (mtr)LOC25492955 (mtr)LOC25493235 (mtr)LOC25498365 (mtr)LOC25502606 (mtr)LOC25502607 (mtr)LOC25502611 (mtr)LOC25502630 (mtr)LOC25502631 (mtr)LOC100775648 (gma)LOC100776310 (gma)LOC100776389 (gma)LOC100776576 (gma)LOC100778155 (gma)LOC100782811 (gma)LOC100784066 (gma)LOC100786000 (gma)LOC100786180 (gma)LOC100786515 (gma)LOC100786696 (gma)LOC100787059 (gma)LOC100790261 (gma)LOC100790436 (gma)LOC100794112 (gma)LOC100795006 (gma)LOC100796821 (gma)LOC100801916 (gma)LOC100802416 (gma)LOC100802443 (gma)LOC100802962 (gma)LOC100803275 (gma)LOC100804024 (gma)LOC100804557 (gma)LOC100807167 (gma)LOC100807748 (gma)LOC100808227 (gma)LOC100809353 (gma)LOC100810407 (gma)LOC100810955 (gma)LOC100812007 (gma)LOC100812022 (gma)LOC100812200 (gma)LOC100814745 (gma)LOC100815430 (gma)LOC100817558 (gma)LOC100819141 (gma)LOC100819157 (gma)LOC100819820 (gma)LOC101244232 (sly)LOC101244394 (sly)LOC101244686 (sly)LOC101244973 (sly)LOC101245411 (sly)LOC101248670 (sly)LOC101251977 (sly)LOC101263283 (sly)LOC101264093 (sly)LOC101264400 (sly)LOC102663080 (gma)LOC102667134 (gma)LOC103861685 (bra)LOC103867012 (bra)LOC104644323 (sly)LOC104647166 (sly)LOC104647168 (sly)LOC104648558 (sly)LOC106794307 (gma)LOC106798964 (gma)LOC106799097 (gma)LOC109120785 (sly)LOC109120786 (sly)LOC109121373 (sly)LOC112323240 (ppo)LOC112325489 (ppo)LOC112325492 (ppo)LOC112328926 (ppo)LOC112328985 (ppo)LOC112328988 (ppo)LOC112941852 (sly)LOC112997759 (gma)LOC112998545 (gma)LOC112998744 (gma)LOC112998788 (gma)LOC120580145 (mtr)LOC123042567 (tae)LOC123055045 (tae)LOC123056074 (tae)LOC123186227 (tae)LOC123186460 (tae)LOC123428251 (hvu)
Subcellular
localization
wolf
plas 6,  E.R. 1,  nucl 1,  extr 1,  vacu 1,  cyto_E.R. 1  (predict for NP_001329181.1)
plas 4,  E.R._plas 4,  E.R. 2,  nucl 1,  chlo 1,  cyto 1,  mito 1,  chlo_mito 1,  cysk_nucl 1  (predict for NP_194459.4)
Subcellular
localization
TargetP
scret 9  (predict for NP_001329181.1)
scret 9  (predict for NP_194459.4)
Gene coexpression
Network*for
coexpressed
genes
LCNloc
[Cytoscape]
Genes directly connected with AT4G27290 on the network
coex z* Locus Function* Coexpression
detail
Entrez Gene ID*
5.7 AT4G11230 Riboflavin synthase-like superfamily protein [detail] 826725
4.8 SDH1-2 succinate dehydrogenase 1-2 [detail] 816359
4.7 AT5G61350 Protein kinase superfamily protein [detail] 836256
Coexpressed
gene list
[Coexpressed gene list for AT4G27290]
Gene expression
All samples [Expression pattern for all samples]
AtGenExpress*
(Development)
253910_at
253910_at.png

X axis is samples (pdf file), and Y axis is log2-expression.
"1st Q", "mean" and "3rd Q" indecate the values for all genes on a GeneChip. Q: quartile.

AtGenExpress*
(Stress)
253910_at
253910_at.png

X axis is samples (pdf file), and Y axis is log2-expression.

AtGenExpress*
(Hormone)
253910_at
253910_at.png

X axis is samples (xls file), and Y axis is log-expression.

Link to other DBs
Entrez Gene ID 828837    
Refseq ID (protein) NP_001329181.1 
NP_194459.4 


The preparation time of this page was 0.1 [sec].