[][] ath   At5g04370 Gene
functional annotation
Function   S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferases superfamily protein Plant GARDENPlant GARDEN JBrowse
GO BP
GO:1901847 [list] [network] nicotinate metabolic process  (3 genes)  IMP  
GO:0032259 [list] [network] methylation  (179 genes)  IDA  
GO CC
GO:0005634 [list] [network] nucleus  (10305 genes)  ISM  
GO MF
GO:0008757 [list] [network] S-adenosylmethionine-dependent methyltransferase activity  (96 genes)  IDA  
GO:0008168 [list] [network] methyltransferase activity  (136 genes)  IMP  
KEGG
Protein NP_001031831.1  NP_001331549.1  NP_196057.1 
BLAST NP_001031831.1  NP_001331549.1  NP_196057.1 
Orthologous [Ortholog page] AT2G14060 (ath)BSMT1 (ath)AT3G21950 (ath)AT5G04380 (ath)AT5G38020 (ath)AT5G66430 (ath)JMT (ath)LOC4330542 (osa)LOC4340627 (osa)LOC4340632 (osa)LOC4350224 (osa)LOC7454371 (ppo)LOC7480140 (ppo)LOC7487202 (ppo)LOC9266985 (osa)LOC9267163 (osa)LOC9269912 (osa)LOC9272356 (osa)LOC11406635 (mtr)LOC11409228 (mtr)LOC11411327 (mtr)LOC11415340 (mtr)LOC11416968 (mtr)LOC11422017 (mtr)LOC11424347 (mtr)LOC11437529 (mtr)LOC11442443 (mtr)LOC18098896 (ppo)LOC18105361 (ppo)LOC18108184 (ppo)LOC18108185 (ppo)LOC25482171 (mtr)LOC25482172 (mtr)LOC25491087 (mtr)LOC25491104 (mtr)LOC25495384 (mtr)LOC25496561 (mtr)SABATH2 (gma)SAMT (sly)LOC100776956 (gma)LOC100777559 (gma)LOC100783664 (gma)LOC100790489 (gma)LOC100793348 (gma)LOC100793878 (gma)LOC100794392 (gma)LOC100794757 (gma)LOC100795434 (gma)LOC100802033 (gma)LOC100803105 (gma)LOC100813166 (gma)LOC100814233 (gma)LOC100815647 (gma)LOC100819585 (gma)LOC100819588 (gma)LOC101254028 (sly)LOC101254332 (sly)LOC101256808 (sly)LOC101257111 (sly)LOC101258646 (sly)LOC101259194 (sly)LOC101260776 (sly)LOC101264819 (sly)LOC102660621 (gma)LOC103829478 (bra)LOC103829888 (bra)LOC103835835 (bra)LOC103837152 (bra)LOC103847295 (bra)LOC103847297 (bra)LOC103847298 (bra)LOC103847299 (bra)LOC103848483 (bra)LOC103855566 (bra)LOC103859391 (bra)LOC103870342 (bra)LOC103870344 (bra)LOC103872765 (bra)LOC106796370 (gma)LOC107275457 (osa)LOC107276025 (osa)LOC107276057 (osa)LOC107276406 (osa)LOC107277462 (osa)LOC107278528 (osa)LOC107281249 (osa)LOC112422562 (mtr)LOC121172705 (gma)LOC123040025 (tae)LOC123040034 (tae)LOC123048907 (tae)LOC123048908 (tae)LOC123051059 (tae)LOC123090401 (tae)LOC123128684 (tae)LOC123138786 (tae)LOC123145814 (tae)LOC123146969 (tae)LOC123150588 (tae)LOC123151583 (tae)LOC123152626 (tae)LOC123154493 (tae)LOC123154778 (tae)LOC123155970 (tae)LOC123157742 (tae)LOC123163020 (tae)LOC123163932 (tae)LOC123168010 (tae)LOC123169982 (tae)LOC123170055 (tae)LOC123170506 (tae)LOC123170646 (tae)LOC123176530 (tae)LOC123176825 (tae)LOC123176992 (tae)LOC123181680 (tae)LOC123181690 (tae)LOC123184275 (tae)LOC123410281 (hvu)LOC123410729 (hvu)LOC123412337 (hvu)LOC123412873 (hvu)LOC123425504 (hvu)LOC123429607 (hvu)
Subcellular
localization
wolf
chlo 5,  nucl 4,  chlo_mito 4  (predict for NP_001031831.1)
cyto 4,  nucl 4,  mito 1,  extr 1,  golg 1  (predict for NP_001331549.1)
cyto 6,  nucl 2,  pero 1  (predict for NP_196057.1)
Subcellular
localization
TargetP
other 5  (predict for NP_001031831.1)
other 5  (predict for NP_001331549.1)
other 9  (predict for NP_196057.1)
Gene coexpression
Network*for
coexpressed
genes
LCNloc
[Cytoscape]
Genes directly connected with NAMT1 on the network
coex z* Locus Function* Coexpression
detail
Entrez Gene ID*
6.0 AT1G14120 2-oxoglutarate (2OG) and Fe(II)-dependent oxygenase superfamily protein [detail] 837971
5.9 AT5G37990 S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase superfamily protein [detail] 833778
5.6 AT5G38020 S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferases superfamily protein [detail] 833781
Coexpressed
gene list
[Coexpressed gene list for NAMT1]
Gene expression
All samples [Expression pattern for all samples]
AtGenExpress*
(Development)
245713_at
245713_at.png

X axis is samples (pdf file), and Y axis is log2-expression.
"1st Q", "mean" and "3rd Q" indecate the values for all genes on a GeneChip. Q: quartile.

AtGenExpress*
(Stress)
245713_at
245713_at.png

X axis is samples (pdf file), and Y axis is log2-expression.

AtGenExpress*
(Hormone)
245713_at
245713_at.png

X axis is samples (xls file), and Y axis is log-expression.

Link to other DBs
Entrez Gene ID 830316    
Refseq ID (protein) NP_001031831.1 
NP_001331549.1 
NP_196057.1 


The preparation time of this page was 0.5 [sec].