[][] ath   At5g20620 Gene
functional annotation
Function   ubiquitin 4
GO BP
GO:0006511 [list] [network] ubiquitin-dependent protein catabolic process  (230 genes)  TAS  
GO CC
GO MF
GO:0003729 [list] [network] mRNA binding  (1535 genes)  IDA  
KEGG ath04120 [list] [network] Ubiquitin mediated proteolysis (155 genes)
Protein NP_001332370.1  NP_568397.1 
BLAST NP_001332370.1  NP_568397.1 
Orthologous [Ortholog page] UBQ11 (ath)UBQ10 (ath)UBQ14 (ath)UBQ3 (ath)UBQ9 (ath)UBQ12 (ath)UBQ13 (ath)LOC4328390 (osa)LOC4337080 (osa)LOC4341860 (osa)LOC7454416 (ppo)LOC7479088 (ppo)LOC7480065 (ppo)LOC7485436 (ppo)LOC9272016 (osa)LOC11421243 (mtr)LOC11422346 (mtr)LOC11429621 (mtr)LOC11431263 (mtr)LOC11434120 (mtr)LOC11443904 (mtr)LOC18095912 (ppo)LOC18100211 (ppo)LOC18100858 (ppo)LOC18106588 (ppo)LOC18106976 (ppo)LOC25492931 (mtr)LOC25501783 (mtr)LOC25502891 (mtr)LOC100127086 (tae)LOC100782546 (gma)LOC100791065 (gma)LOC100799042 (gma)LOC100800638 (gma)LOC100815545 (gma)LOC100817214 (gma)LOC100819694 (gma)LOC101256039 (sly)LOC101258282 (sly)ubq1-1 (sly)LOC103834437 (bra)LOC103838224 (bra)LOC103839752 (bra)LOC103839755 (bra)LOC103847397 (bra)LOC103858685 (bra)LOC103869289 (bra)LOC103874046 (bra)SUBI-2 (gma)LOC121173310 (gma)LOC121173311 (gma)LOC123046348 (tae)LOC123060969 (tae)LOC123102438 (tae)LOC123110611 (tae)LOC123114227 (tae)LOC123132003 (tae)LOC123132008 (tae)LOC123132200 (tae)LOC123132258 (tae)LOC123136238 (tae)LOC123136303 (tae)LOC123136436 (tae)LOC123136437 (tae)LOC123137854 (tae)LOC123138110 (tae)LOC123143542 (tae)LOC123143545 (tae)LOC123143811 (tae)LOC123143944 (tae)LOC123143945 (tae)LOC123143946 (tae)LOC123148995 (tae)LOC123149000 (tae)LOC123156106 (tae)LOC123162179 (tae)LOC123162180 (tae)LOC123162684 (tae)LOC123162685 (tae)LOC123164414 (tae)LOC123166192 (tae)LOC123182480 (tae)LOC123190093 (tae)LOC123190097 (tae)LOC123401164 (hvu)LOC123401278 (hvu)LOC123401304 (hvu)LOC123401361 (hvu)LOC123404241 (hvu)LOC123405651 (hvu)LOC123406377 (hvu)LOC123406997 (hvu)LOC123407022 (hvu)LOC123412478 (hvu)LOC123413120 (hvu)LOC123413417 (hvu)LOC123445590 (hvu)LOC123450040 (hvu)LOC123452560 (hvu)
Subcellular
localization
wolf
cyto 6,  cyto_nucl 5,  chlo 2  (predict for NP_001332370.1)
cyto 6,  cyto_nucl 5,  chlo 1,  nucl 1  (predict for NP_568397.1)
Subcellular
localization
TargetP
other 8  (predict for NP_001332370.1)
other 8  (predict for NP_568397.1)
Gene coexpression
Network*for
coexpressed
genes
LCNloc
[Cytoscape]
KEGG* ID Title #genes Link to the KEGG* map
(Multiple genes)
ath04120 Ubiquitin mediated proteolysis 7
Genes directly connected with UBQ4 on the network
coex z* Locus Function* CoexViewer Entrez Gene ID*
10.5 UBQ3 polyubiquitin 3 [detail] 831899
9.7 UBQ14 Ubiquitin family protein [detail] 828148
6.3 UBQ10 polyubiquitin 10 [detail] 825880
Coexpressed
gene list
[Coexpressed gene list for UBQ4]
Gene expression
All samples [Expression pattern for all samples]
AtGenExpress*
(Development)
245989_s_at
245989_s_at.png

X axis is samples (pdf file), and Y axis is log2-expression.
"1st Q", "mean" and "3rd Q" indecate the values for all genes on a GeneChip. Q: quartile.

AtGenExpress*
(Stress)
245989_s_at
245989_s_at.png

X axis is samples (pdf file), and Y axis is log2-expression.

AtGenExpress*
(Hormone)
245989_s_at
245989_s_at.png

X axis is samples (xls file), and Y axis is log-expression.

Link to other DBs
Entrez Gene ID 832184    
Refseq ID (protein) NP_001332370.1 
NP_568397.1 


The preparation time of this page was 0.1 [sec].