[←][→] ath   At5g38940 Gene
functional annotation
Function   RmlC-like cupins superfamily protein      
GO BP
GO CC
GO:0009505 [list] [network] plant-type cell wall  (498 genes)  HDA  
GO:0005576 [list] [network] extracellular region  (3154 genes)  ISM  
GO MF
GO:0030145 [list] [network] manganese ion binding  (44 genes)  IEA  
KEGG
Protein NP_001330896.1  NP_198710.2 
BLAST NP_001330896.1  NP_198710.2 
Orthologous [Ortholog page] AT3G04200 (ath)  AT3G05950 (ath)  GLP9 (ath)  AT5G38910 (ath)  AT5G38930 (ath)  AT5G38960 (ath)  GLP6 (ath)  AT5G39110 (ath)  AT5G39120 (ath)  AT5G39130 (ath)  AT5G39150 (ath)  AT5G39160 (ath)  AT5G39180 (ath)  GER2 (ath)  LOC4329389 (osa)  LOC4329390 (osa)  LOC4329391 (osa)  LOC4337008 (osa)  LOC7453557 (ppo)  LOC7469831 (ppo)  LOC7469832 (ppo)  LOC7474642 (ppo)  LOC7474643 (ppo)  LOC7474644 (ppo)  LOC7480413 (ppo)  LOC7480420 (ppo)  LOC7487706 (ppo)  LOC7487730 (ppo)  LOC7489692 (ppo)  LOC7489693 (ppo)  LOC11412593 (mtr)  LOC11414422 (mtr)  LOC11414568 (mtr)  LOC11419235 (mtr)  LOC11422481 (mtr)  LOC11424092 (mtr)  LOC11424098 (mtr)  LOC11425078 (mtr)  LOC11425316 (mtr)  LOC11426661 (mtr)  LOC11433625 (mtr)  LOC11433956 (mtr)  LOC11439325 (mtr)  LOC18096031 (ppo)  LOC18103504 (ppo)  LOC18103515 (ppo)  LOC18103516 (ppo)  LOC18103521 (ppo)  LOC18104102 (ppo)  LOC18104137 (ppo)  LOC18108197 (ppo)  LOC18108199 (ppo)  LOC18108201 (ppo)  LOC18109093 (ppo)  LOC25486309 (mtr)  LOC25486310 (mtr)  LOC25486313 (mtr)  LOC100306389 (gma)  GER3 (gma)  GER12 (gma)  GER2 (gma)  GER13 (gma)  GER14 (gma)  LOC100780252 (gma)  LOC100780789 (gma)  LOC100782768 (gma)  LOC100783871 (gma)  LOC100786576 (gma)  GER4 (gma)  LOC100788721 (gma)  GER11 (gma)  LOC100797415 (gma)  GER6 (gma)  LOC100803440 (gma)  LOC100814242 (gma)  GER20 (gma)  LOC100818120 (gma)  LOC100820481 (gma)  LOC101253136 (sly)  LOC101253431 (sly)  LOC101253729 (sly)  LOC101253951 (sly)  LOC101254252 (sly)  LOC102660582 (gma)  LOC103833457 (bra)  LOC103838740 (bra)  LOC103850001 (bra)  LOC103850135 (bra)  LOC103850187 (bra)  LOC103854691 (bra)  LOC103863820 (bra)  LOC103864164 (bra)  LOC103864208 (bra)  LOC112323815 (ppo)  LOC112323840 (ppo)  LOC112323842 (ppo)  LOC112323843 (ppo)  LOC112323844 (ppo)  LOC112323845 (ppo)  LOC112323846 (ppo)  LOC112323882 (ppo)  LOC112325192 (ppo)  LOC112325612 (ppo)  LOC112326061 (ppo)  LOC123041641 (tae)  LOC123042086 (tae)  LOC123042088 (tae)  LOC123049608 (tae)  LOC123050039 (tae)  LOC123050041 (tae)  LOC123083951 (tae)  LOC123084060 (tae)  LOC123084166 (tae)  LOC123084272 (tae)  LOC123084380 (tae)  LOC123086668 (tae)  LOC123086675 (tae)  LOC123086683 (tae)  LOC123086694 (tae)  LOC123086699 (tae)  LOC123106717 (tae)  LOC123106728 (tae)  LOC123131534 (tae)  LOC123133292 (tae)  LOC123134569 (tae)  LOC123138385 (tae)  LOC123148826 (tae)  LOC123156679 (tae)  LOC123156680 (tae)  LOC123156691 (tae)  LOC123159756 (tae)  LOC123164370 (tae)  LOC123164376 (tae)  LOC123164385 (tae)  LOC123164391 (tae)  LOC123164394 (tae)  LOC123164401 (tae)  LOC123164409 (tae)  LOC123164694 (tae)  LOC123164830 (tae)  LOC123164831 (tae)  LOC123164837 (tae)  LOC123172090 (tae)  LOC123186091 (tae)  LOC123186092 (tae)  LOC123405541 (hvu)  LOC123405552 (hvu)  LOC123405572 (hvu)  LOC123412769 (hvu)  LOC123412890 (hvu)  LOC123430574 (hvu)  LOC123430805 (hvu)  LOC123430806 (hvu) 
Subcellular
localization
wolf
chlo 4,  extr 3,  cyto 1,  mito 1  (predict for NP_001330896.1)
extr 4,  chlo 1,  mito 1,  vacu 1,  chlo_mito 1  (predict for NP_198710.2)
Subcellular
localization
TargetP
other 3  (predict for NP_001330896.1)
scret 9  (predict for NP_198710.2)
Gene coexpression
Network*for
coexpressed
genes
LCNloc
[Cytoscape]
KEGG* ID Title #genes Link to the KEGG* map
(Multiple genes)
ath00940 Phenylpropanoid biosynthesis 3
ath00410 beta-Alanine metabolism 2
Genes directly connected with AT5G38940 on the network
coex z* Locus Function* CoexViewer Entrez Gene ID*
17.3 AT5G38930 RmlC-like cupins superfamily protein [detail] 833885
8.5 AT5G64110 Peroxidase superfamily protein [detail] 836532
6.3 AT3G05727 S locus-related glycoprotein 1 (SLR1) binding pollen coat protein family [detail] 3768785
Coexpressed
gene list		 [Coexpressed gene list for AT5G38940]
Gene expression
All samples [Expression pattern for all samples]
Link to other DBs
Entrez Gene ID 833886      
Refseq ID (protein) NP_001330896.1 
NP_198710.2 


The preparation time of this page was 0.1 [sec].