[][] ath   At1g01980 Gene
functional annotation
Function   FAD-binding Berberine family protein
GO BP
GO CC
GO:0009505 [list] [network] plant-type cell wall  (498 genes)  IDA  
GO:0005794 [list] [network] Golgi apparatus  (1182 genes)  HDA  
GO:0005886 [list] [network] plasma membrane  (2529 genes)  HDA  
GO:0009507 [list] [network] chloroplast  (5004 genes)  ISM  
GO MF
GO:0016899 [list] [network] oxidoreductase activity, acting on the CH-OH group of donors, oxygen as acceptor  (17 genes)  IDA  
GO:0071949 [list] [network] FAD binding  (43 genes)  IEA  
KEGG
Protein NP_171700.1 
BLAST NP_171700.1 
Orthologous [Ortholog page] LOC732592 (gma)LOC732593 (gma)MEE23 (ath)AT4G20800 (ath)AT4G20820 (ath)AT4G20830 (ath)AT4G20840 (ath)AT4G20860 (ath)AT5G44360 (ath)AT5G44380 (ath)AT5G44390 (ath)AT5G44400 (ath)AT5G44410 (ath)AT5G44440 (ath)AT1G11770 (ath)AT1G26380 (ath)AT1G26390 (ath)AT1G26400 (ath)AT1G26410 (ath)AT1G26420 (ath)AT1G30700 (ath)AT1G30710 (ath)AT1G30760 (ath)AT1G34575 (ath)LOC4341253 (osa)LOC4341254 (osa)LOC4341257 (osa)LOC4341259 (osa)LOC4341261 (osa)LOC7457662 (ppo)LOC7471680 (ppo)LOC7471681 (ppo)LOC7480379 (ppo)LOC7480381 (ppo)LOC7480383 (ppo)LOC7480394 (ppo)LOC7480395 (ppo)LOC7480398 (ppo)LOC7480399 (ppo)LOC7480401 (ppo)LOC7480403 (ppo)LOC7480406 (ppo)LOC7480408 (ppo)LOC7480409 (ppo)LOC7480417 (ppo)LOC7480418 (ppo)LOC7484482 (ppo)LOC7485160 (ppo)LOC7485161 (ppo)LOC7485205 (ppo)LOC7489102 (ppo)LOC7489103 (ppo)LOC7489112 (ppo)LOC7489114 (ppo)LOC7489115 (ppo)LOC7489116 (ppo)LOC7489117 (ppo)LOC11406991 (mtr)LOC11407647 (mtr)LOC11415235 (mtr)LOC11415951 (mtr)LOC11416804 (mtr)LOC11418784 (mtr)LOC11420001 (mtr)LOC11422032 (mtr)LOC11422989 (mtr)LOC11424412 (mtr)LOC11429520 (mtr)LOC18095776 (ppo)LOC18096028 (ppo)LOC18103477 (ppo)LOC18103479 (ppo)LOC18103480 (ppo)LOC18103481 (ppo)LOC18103482 (ppo)LOC18103487 (ppo)LOC18103492 (ppo)LOC18103495 (ppo)LOC18103496 (ppo)LOC18103497 (ppo)LOC18103499 (ppo)LOC18103509 (ppo)LOC18103510 (ppo)LOC18103511 (ppo)LOC18103513 (ppo)LOC18105648 (ppo)LOC18109453 (ppo)LOC25486180 (mtr)LOC25486316 (mtr)LOC25486318 (mtr)LOC25486319 (mtr)LOC25492422 (mtr)LOC25493091 (mtr)LOC25493334 (mtr)LOC25493352 (mtr)LOC25493353 (mtr)LOC25493354 (mtr)LOC25493355 (mtr)LOC25493356 (mtr)LOC25493357 (mtr)LOC25493364 (mtr)LOC25493365 (mtr)LOC25493366 (mtr)LOC25495604 (mtr)LOC100775353 (gma)LOC100775893 (gma)LOC100776438 (gma)LOC100777594 (gma)LOC100778568 (gma)LOC100779395 (gma)LOC100780114 (gma)LOC100780461 (gma)LOC100781004 (gma)LOC100781731 (gma)LOC100782093 (gma)LOC100782292 (gma)LOC100782631 (gma)LOC100786800 (gma)LOC100788228 (gma)LOC100788233 (gma)LOC100794074 (gma)LOC100796276 (gma)LOC100796809 (gma)LOC100797188 (gma)LOC100797739 (gma)LOC100799990 (gma)LOC100800519 (gma)LOC100801058 (gma)LOC100802131 (gma)LOC100803041 (gma)LOC100807459 (gma)LOC100807998 (gma)LOC100810481 (gma)LOC100811019 (gma)LOC100811558 (gma)LOC100812087 (gma)LOC100813175 (gma)LOC100813706 (gma)LOC101246398 (sly)LOC101246685 (sly)LOC101249413 (sly)LOC101249763 (sly)LOC101254601 (sly)LOC101254908 (sly)LOC101254965 (sly)LOC101255262 (sly)LOC101255854 (sly)LOC101256448 (sly)LOC101263376 (sly)LOC101263972 (sly)LOC101264289 (sly)LOC101264571 (sly)LOC101264701 (sly)LOC101265002 (sly)LOC101265308 (sly)LOC101265606 (sly)LOC102662170 (gma)LOC103827902 (bra)LOC103827906 (bra)LOC103828799 (bra)LOC103828803 (bra)LOC103834173 (bra)LOC103839175 (bra)LOC103839178 (bra)LOC103839179 (bra)LOC103839182 (bra)LOC103839321 (bra)LOC103839322 (bra)LOC103840305 (bra)LOC103840312 (bra)LOC103840313 (bra)LOC103840613 (bra)LOC103840614 (bra)LOC103841228 (bra)LOC103843225 (bra)LOC103850258 (bra)LOC103857550 (bra)LOC103858368 (bra)LOC103858377 (bra)LOC103858400 (bra)LOC103858408 (bra)LOC103858430 (bra)LOC103858724 (bra)LOC103861201 (bra)LOC103861202 (bra)LOC103865354 (bra)LOC103867418 (bra)LOC103871928 (bra)LOC104645788 (sly)LOC104646055 (sly)LOC107275394 (osa)LOC108869423 (bra)LOC112323320 (ppo)LOC112323321 (ppo)LOC112323322 (ppo)LOC112323328 (ppo)LOC112323330 (ppo)LOC112324786 (ppo)LOC112324789 (ppo)LOC112325984 (ppo)LOC112329148 (ppo)LOC112421407 (mtr)LOC117125831 (bra)LOC120580904 (mtr)LOC123039084 (tae)LOC123043821 (tae)LOC123044031 (tae)LOC123048809 (tae)LOC123051687 (tae)LOC123051908 (tae)LOC123056682 (tae)LOC123069860 (tae)LOC123101225 (tae)LOC123104138 (tae)LOC123121890 (tae)LOC123151640 (tae)LOC123151641 (tae)LOC123151651 (tae)LOC123154502 (tae)LOC123154697 (tae)LOC123159831 (tae)LOC123160014 (tae)LOC123160305 (tae)LOC123160322 (tae)LOC123160325 (tae)LOC123160531 (tae)LOC123166878 (tae)LOC123166970 (tae)LOC123167086 (tae)LOC123167432 (tae)LOC123168236 (tae)LOC123169320 (tae)LOC123171182 (tae)LOC123172934 (tae)LOC123178742 (tae)LOC123182957 (tae)LOC123183295 (tae)LOC123184816 (tae)LOC123184818 (tae)LOC123396132 (hvu)LOC123407824 (hvu)LOC123409363 (hvu)LOC123411150 (hvu)LOC123411227 (hvu)LOC123411684 (hvu)LOC123413019 (hvu)LOC123421037 (hvu)LOC123425140 (hvu)LOC123425397 (hvu)LOC123429002 (hvu)LOC123429003 (hvu)LOC123429523 (hvu)
Subcellular
localization
wolf
cyto 3,  vacu 2,  E.R. 2,  E.R._vacu 2  (predict for NP_171700.1)
Subcellular
localization
TargetP
scret 8  (predict for NP_171700.1)
Gene coexpression
Network*for
coexpressed
genes
LCNloc
[Cytoscape]
KEGG* ID Title #genes Link to the KEGG* map
(Multiple genes)
ath00040 Pentose and glucuronate interconversions 2
Genes directly connected with AT1G01980 on the network
coex z* Locus Function* CoexViewer Entrez Gene ID*
9.4 AT3G62710 Glycosyl hydrolase family protein [detail] 825445
9.3 RALFL26 ralf-like 26 [detail] 822109
9.0 AT3G01240 splicing regulatory glutamine/lysine-rich-like protein [detail] 821219
4.3 INVH invertase H [detail] 819751
Coexpressed
gene list
[Coexpressed gene list for AT1G01980]
Gene expression
All samples [Expression pattern for all samples]
AtGenExpress*
(Development)
261623_at
261623_at.png

X axis is samples (pdf file), and Y axis is log2-expression.
"1st Q", "mean" and "3rd Q" indecate the values for all genes on a GeneChip. Q: quartile.

AtGenExpress*
(Stress)
261623_at
261623_at.png

X axis is samples (pdf file), and Y axis is log2-expression.

AtGenExpress*
(Hormone)
261623_at
261623_at.png

X axis is samples (xls file), and Y axis is log-expression.

Link to other DBs
Entrez Gene ID 839296    
Refseq ID (protein) NP_171700.1 


The preparation time of this page was 1.0 [sec].