[][] ath   AT1G06650 Gene
functional annotation
Function   2-oxoglutarate (2OG) and Fe(II)-dependent oxygenase superfamily protein
GO BP
GO:0055114 [list] [network] oxidation-reduction process  (1468 genes)  IEA  
GO CC
GO:0005576 [list] [network] extracellular region  (3363 genes)  HDA  
GO:0005829 [list] [network] cytosol  (3506 genes)  RCA  
GO:0005737 [list] [network] cytoplasm  (14855 genes)  ISM  
GO MF
GO:0016706 [list] [network] 2-oxoglutarate-dependent dioxygenase activity  (51 genes)  ISS  
GO:0051213 [list] [network] dioxygenase activity  (147 genes)  IBA  
GO:0046872 [list] [network] metal ion binding  (3180 genes)  IEA  
KEGG
Protein NP_172150.1  NP_849602.1 
BLAST NP_172150.1  NP_849602.1 
Orthologous [Ortholog page] E8 (sly)AT2G25450 (ath)AT2G30830 (ath)AT2G30840 (ath)AT3G61400 (ath)AT5G43440 (ath)AT5G43450 (ath)AT5G59530 (ath)AT5G59540 (ath)AT1G06620 (ath)AT1G06640 (ath)AT1G03400 (ath)2A6 (ath)AT1G04380 (ath)AT1G04350 (ath)AT1G06645 (ath)LOC4333774 (osa)LOC4335099 (osa)LOC7474620 (ppo)LOC7485152 (ppo)LOC7498016 (ppo)LOC7498017 (ppo)LOC7498018 (ppo)LOC11405673 (mtr)LOC11406189 (mtr)LOC11408358 (mtr)LOC11409009 (mtr)LOC11409250 (mtr)LOC11409504 (mtr)LOC11409765 (mtr)LOC11410509 (mtr)LOC11410704 (mtr)LOC11410782 (mtr)LOC11410784 (mtr)LOC11413339 (mtr)LOC11415384 (mtr)LOC11418386 (mtr)LOC11418387 (mtr)LOC11419853 (mtr)LOC11421214 (mtr)LOC11424282 (mtr)LOC11428587 (mtr)LOC11429536 (mtr)LOC11429538 (mtr)LOC11431109 (mtr)LOC11434481 (mtr)LOC11434538 (mtr)LOC11434967 (mtr)LOC11438884 (mtr)LOC25479840 (mtr)LOC25483008 (mtr)LOC25494048 (mtr)LOC25497878 (mtr)LOC25498293 (mtr)LOC25498303 (mtr)LOC25500056 (mtr)LOC25500804 (mtr)ODD (sly)LOC100192706 (zma)LOC100232930 (vvi)LOC100247670 (vvi)LOC100251035 (vvi)LOC100255665 (vvi)LOC100256229 (vvi)LOC100257928 (vvi)LOC100257959 (vvi)LOC100259642 (vvi)LOC100260734 (vvi)LOC100264824 (vvi)LOC100266164 (vvi)LOC100272887 (zma)LOC100777564 (gma)LOC100781078 (gma)LOC100781624 (gma)LOC100786255 (gma)LOC100787331 (gma)LOC100789941 (gma)LOC100790198 (gma)LOC100792296 (gma)LOC100792753 (gma)LOC100800882 (gma)LOC100815823 (gma)LOC100815890 (gma)LOC101244528 (sly)LOC101245098 (sly)LOC101245399 (sly)LOC101245697 (sly)LOC101245991 (sly)LOC101246865 (sly)LOC101248415 (sly)LOC101249199 (sly)LOC101249481 (sly)LOC101250009 (sly)LOC101250295 (sly)LOC101259580 (sly)ACO3 (sly)LOC102659434 (gma)LOC102659833 (gma)LOC102667868 (gma)LOC102669426 (gma)LOC103642471 (zma)LOC103836579 (bra)LOC103841969 (bra)LOC103843501 (bra)LOC103843502 (bra)LOC103843543 (bra)LOC103843658 (bra)LOC103844023 (bra)LOC103844024 (bra)LOC103844025 (bra)LOC103844262 (bra)LOC103844264 (bra)LOC103844266 (bra)LOC103844507 (bra)LOC103844509 (bra)LOC103856626 (bra)LOC103856627 (bra)LOC103856628 (bra)GSL-OH (bra)LOC103865075 (bra)LOC103865076 (bra)LOC103865077 (bra)LOC103865078 (bra)LOC103865081 (bra)LOC104879284 (vvi)LOC104879286 (vvi)LOC106798825 (gma)LOC109121508 (vvi)LOC109122663 (vvi)
Subcellular
localization
wolf
cyto 4,  nucl 3,  pero 1,  nucl_plas 1  (predict for NP_172150.1)
nucl 6,  cyto 1,  chlo 1,  extr 1,  vacu 1,  cysk 1,  cyto_pero 1,  cyto_E.R. 1,  cyto_plas 1  (predict for NP_849602.1)
Subcellular
localization
TargetP
other 8  (predict for NP_172150.1)
other 8  (predict for NP_849602.1)
Gene coexpression
Network*for
coexpressed
genes
LCNloc
[Cytoscape]
Genes directly connected with AT1G06650 on the network
coex z* Locus Function* Coexpression
detail
Entrez Gene ID*
5.3 CYP71B28 cytochrome P450, family 71, subfamily B, polypeptide 28 [detail] 837866
4.7 AT5G19540 thermosome subunit gamma [detail] 832074
4.7 CCD1 carotenoid cleavage dioxygenase 1 [detail] 825527
Coexpressed
gene list
[Coexpressed gene list for AT1G06650]
Gene expression
All samples [Expression pattern for all samples]
AtGenExpress*
(Development)
262638_at
262638_at.png

X axis is samples (pdf file), and Y axis is log2-expression.
"1st Q", "mean" and "3rd Q" indecate the values for all genes on a GeneChip. Q: quartile.

AtGenExpress*
(Stress)
262638_at
262638_at.png

X axis is samples (pdf file), and Y axis is log2-expression.

AtGenExpress*
(Hormone)
262638_at
262638_at.png

X axis is samples (xls file), and Y axis is log-expression.

Link to other DBs
Entrez Gene ID 837175    
Refseq ID (protein) NP_172150.1 
NP_849602.1 


The preparation time of this page was 0.3 [sec].