[][] ath   At1g09200 Gene
functional annotation
Function   Histone superfamily protein
GO BP
GO:0006260 [list] [network] DNA replication  (68 genes)  IEA  
GO:0051276 [list] [network] chromosome organization  (142 genes)  IEA  
GO:0051726 [list] [network] regulation of cell cycle  (158 genes)  IEA  
GO:0048229 [list] [network] gametophyte development  (523 genes)  IEA  
GO:0048523 [list] [network] negative regulation of cellular process  (960 genes)  IEA  
GO CC
GO:0005576 [list] [network] extracellular region  (3154 genes)  HDA  
GO:0005634 [list] [network] nucleus  (10305 genes)  ISM  
GO MF
KEGG
Protein NP_563838.1 
BLAST NP_563838.1 
Orthologous [Ortholog page] LOC544102 (sly)AT3G27360 (ath)AT4G40030 (ath)AT4G40040 (ath)AT5G10390 (ath)AT5G10400 (ath)AT5G10980 (ath)HTR11 (ath)AT5G65360 (ath)AT1G13370 (ath)MGH3 (ath)AT1G75600 (ath)LOC4325069 (osa)LOC4333019 (osa)LOC4336000 (osa)LOC4338913 (osa)LOC4340006 (osa)LOC4340203 (osa)LOC4349820 (osa)LOC7455189 (ppo)LOC7458004 (ppo)LOC7466789 (ppo)LOC7477652 (ppo)LOC7490669 (ppo)LOC7493256 (ppo)LOC7495534 (ppo)LOC7496045 (ppo)LOC9269345 (osa)LOC9271591 (osa)LOC11405531 (mtr)LOC11408671 (mtr)LOC11409321 (mtr)LOC11409357 (mtr)LOC11409976 (mtr)LOC11410249 (mtr)LOC11413536 (mtr)LOC11419237 (mtr)LOC11430310 (mtr)LOC11430980 (mtr)LOC11433985 (mtr)LOC11435575 (mtr)LOC11436749 (mtr)LOC11437960 (mtr)LOC18094306 (ppo)LOC18096107 (ppo)LOC18097281 (ppo)LOC18099681 (ppo)LOC25492607 (mtr)LOC25493065 (mtr)LOC25493536 (mtr)LOC25502181 (mtr)LOC25502270 (mtr)LOC100305466 (gma)LOC100306416 (gma)LOC100781420 (gma)LOC100783277 (gma)LOC100783845 (gma)LOC100785082 (gma)LOC100788696 (gma)LOC100789332 (gma)LOC100797506 (gma)LOC100807058 (gma)LOC100809785 (gma)LOC100810646 (gma)LOC100817768 (gma)LOC100818932 (gma)LOC101245793 (sly)LOC101250929 (sly)LOC101252717 (sly)LOC101253224 (sly)LOC101254197 (sly)LOC101260571 (sly)LOC101262275 (sly)LOC101263309 (sly)LOC101263845 (sly)LOC101267861 (sly)LOC101268556 (sly)LOC102661475 (gma)LOC102669107 (gma)LOC103830640 (bra)LOC103836349 (bra)LOC103837572 (bra)LOC103839289 (bra)LOC103850291 (bra)LOC103850326 (bra)LOC103852966 (bra)LOC103854530 (bra)LOC103854831 (bra)LOC103855863 (bra)LOC103855894 (bra)LOC107276414 (osa)LOC112326641 (ppo)LOC112326872 (ppo)LOC123045447 (tae)LOC123045621 (tae)LOC123053099 (tae)LOC123053276 (tae)LOC123053464 (tae)LOC123056226 (tae)LOC123057731 (tae)LOC123060632 (tae)LOC123062714 (tae)LOC123064940 (tae)LOC123064951 (tae)LOC123065019 (tae)LOC123065156 (tae)LOC123065167 (tae)LOC123077766 (tae)LOC123079871 (tae)LOC123083067 (tae)LOC123084869 (tae)LOC123085076 (tae)LOC123088195 (tae)LOC123088199 (tae)LOC123088208 (tae)LOC123093219 (tae)LOC123098255 (tae)LOC123098485 (tae)LOC123111760 (tae)LOC123121324 (tae)LOC123125859 (tae)LOC123129777 (tae)LOC123129797 (tae)LOC123130177 (tae)LOC123131739 (tae)LOC123131853 (tae)LOC123134870 (tae)LOC123135593 (tae)LOC123137526 (tae)LOC123142494 (tae)LOC123143161 (tae)LOC123143162 (tae)LOC123150061 (tae)LOC123150701 (tae)LOC123150820 (tae)LOC123154129 (tae)LOC123156021 (tae)LOC123157145 (tae)LOC123157517 (tae)LOC123159021 (tae)LOC123161499 (tae)LOC123166502 (tae)LOC123166703 (tae)LOC123167174 (tae)LOC123167447 (tae)LOC123169031 (tae)LOC123169919 (tae)LOC123172808 (tae)LOC123189368 (tae)LOC123401492 (hvu)LOC123402877 (hvu)LOC123406049 (hvu)LOC123407026 (hvu)LOC123407027 (hvu)LOC123407571 (hvu)LOC123407579 (hvu)LOC123407601 (hvu)LOC123407840 (hvu)LOC123407879 (hvu)LOC123407880 (hvu)LOC123409950 (hvu)LOC123410250 (hvu)LOC123410467 (hvu)LOC123410874 (hvu)LOC123411359 (hvu)LOC123411529 (hvu)LOC123413075 (hvu)LOC123413076 (hvu)LOC123413522 (hvu)LOC123424186 (hvu)LOC123426702 (hvu)LOC123426872 (hvu)LOC123426873 (hvu)LOC123427282 (hvu)LOC123440459 (hvu)LOC123440480 (hvu)LOC123444127 (hvu)LOC123444237 (hvu)LOC123444810 (hvu)LOC123446355 (hvu)LOC123449322 (hvu)LOC123449497 (hvu)LOC123452879 (hvu)
Subcellular
localization
wolf
nucl 8,  chlo 1  (predict for NP_563838.1)
Subcellular
localization
TargetP
chlo 7,  mito 3  (predict for NP_563838.1)
Gene coexpression
Network*for
coexpressed
genes
LCNloc
[Cytoscape]
Genes directly connected with AT1G09200 on the network
coex z* Locus Function* CoexViewer Entrez Gene ID*
26.1 HTA6 histone H2A 6 [detail] 836109
24.9 AT5G65360 Histone superfamily protein [detail] 836661
20.7 AT5G10390 Histone superfamily protein [detail] 830903
18.0 HTB2 histone B2 [detail] 832352
17.2 AT5G10400 Histone superfamily protein [detail] 830904
16.7 AT3G46320 Histone superfamily protein [detail] 823777
16.7 HIS4 histone H4 [detail] 817423
15.3 AT3G27360 Histone superfamily protein [detail] 822357
15.1 HTA13 histone H2A 13 [detail] 821614
13.6 HTA11 histone H2A 11 [detail] 824621
13.1 HTB1 Histone superfamily protein [detail] 837293
10.8 HTA8 histone H2A 8 [detail] 818463
Coexpressed
gene list
[Coexpressed gene list for AT1G09200]
Gene expression
All samples [Expression pattern for all samples]
AtGenExpress*
(Development)
264262_at
264262_at.png

X axis is samples (pdf file), and Y axis is log2-expression.
"1st Q", "mean" and "3rd Q" indecate the values for all genes on a GeneChip. Q: quartile.

AtGenExpress*
(Stress)
264262_at
264262_at.png

X axis is samples (pdf file), and Y axis is log2-expression.

AtGenExpress*
(Hormone)
264262_at
264262_at.png

X axis is samples (xls file), and Y axis is log-expression.

Link to other DBs
Entrez Gene ID 837440    
Refseq ID (protein) NP_563838.1 


The preparation time of this page was 2.7 [sec].