[][] ath   AT1G13290 Gene
functional annotation
Function   C2H2-like zinc finger protein
GO BP
GO:0010588 [list] [network] cotyledon vascular tissue pattern formation  (18 genes)  IMP  
GO:0010305 [list] [network] leaf vascular tissue pattern formation  (33 genes)  IMP  
GO:0010087 [list] [network] phloem or xylem histogenesis  (102 genes)  IMP  
GO:0048364 [list] [network] root development  (482 genes)  IMP  
GO:0048367 [list] [network] shoot system development  (812 genes)  IMP  
GO:0010468 [list] [network] regulation of gene expression  (2484 genes)  IBA  
GO CC
GO:0005634 [list] [network] nucleus  (10793 genes)  IBA IDA ISM  
GO MF
GO:0003700 [list] [network] DNA-binding transcription factor activity  (1599 genes)  ISS  
GO:0046872 [list] [network] metal ion binding  (3180 genes)  IEA  
GO:0003676 [list] [network] nucleic acid binding  (4187 genes)  IEA  
KEGG
Protein NP_172787.1 
BLAST NP_172787.1 
Orthologous [Ortholog page] LOC547675 (gma)WIP4 (ath)NTT (ath)WIP3 (ath)TT1 (ath)WIP5 (ath)LOC4325059 (osa)LOC4338934 (osa)LOC4341518 (osa)LOC4346617 (osa)LOC4347420 (osa)LOC7460201 (ppo)LOC7463856 (ppo)LOC7466916 (ppo)LOC7468965 (ppo)LOC7472081 (ppo)LOC7495161 (ppo)LOC9271702 (osa)LOC11445732 (mtr)LOC25484895 (mtr)LOC100244743 (vvi)LOC100245035 (vvi)LOC100252639 (vvi)LOC100255592 (vvi)LOC100264302 (vvi)LOC100265548 (vvi)LOC100272543 (zma)LOC100284341 (zma)LOC100776343 (gma)LOC100783088 (gma)LOC100783143 (gma)LOC100784037 (gma)LOC100788243 (gma)LOC100788451 (gma)LOC100789060 (gma)LOC100789416 (gma)LOC100791558 (gma)LOC100794446 (gma)LOC100795704 (gma)LOC100799060 (gma)LOC100800644 (gma)LOC100801922 (gma)LOC100802239 (gma)LOC100802773 (gma)LOC100802907 (gma)LOC100808573 (gma)LOC100813583 (gma)LOC100818131 (gma)LOC100819306 (gma)LOC101248676 (sly)LOC101251000 (sly)LOC101254266 (sly)LOC101257840 (sly)LOC101262756 (sly)LOC101268180 (sly)LOC103630405 (zma)LOC103635602 (zma)LOC103638807 (zma)LOC103641945 (zma)LOC103654491 (zma)LOC103830118 (bra)LOC103835639 (bra)LOC103839994 (bra)LOC103841673 (bra)LOC103843405 (bra)LOC103863033 (bra)LOC103868637 (bra)LOC103869221 (bra)LOC103871572 (bra)LOC103871673 (bra)LOC103871945 (bra)LOC107276310 (osa)LOC109944872 (zma)LOC112416381 (mtr)LOC112417257 (mtr)LOC112417258 (mtr)LOC112419056 (mtr)LOC112419064 (mtr)LOC112420920 (mtr)LOC112421394 (mtr)LOC112422242 (mtr)
Subcellular
localization
wolf
nucl 9,  cyto_nucl 5  (predict for NP_172787.1)
Subcellular
localization
TargetP
other 8  (predict for NP_172787.1)
Gene coexpression
Network*for
coexpressed
genes
Coexpressed
gene list
[Coexpressed gene list for DOT5]
Gene expression
All samples [Expression pattern for all samples]
AtGenExpress*
(Development)
257515_at
257515_at.png

X axis is samples (pdf file), and Y axis is log2-expression.
"1st Q", "mean" and "3rd Q" indecate the values for all genes on a GeneChip. Q: quartile.

AtGenExpress*
(Stress)
257515_at
257515_at.png

X axis is samples (pdf file), and Y axis is log2-expression.

AtGenExpress*
(Hormone)
257515_at
257515_at.png

X axis is samples (xls file), and Y axis is log-expression.

Link to other DBs
Entrez Gene ID 837889    
Refseq ID (protein) NP_172787.1 


The preparation time of this page was 0.2 [sec].