[][] ath   At1g26380 Gene
functional annotation
Function   FAD-binding Berberine family protein
GO BP
GO:0071456 [list] [network] cellular response to hypoxia  (241 genes)  IEP  
GO CC
GO:0009505 [list] [network] plant-type cell wall  (498 genes)  ISS  
GO:0005783 [list] [network] endoplasmic reticulum  (856 genes)  IDA  
GO:0005737 [list] [network] cytoplasm  (13880 genes)  ISM  
GO MF
GO:0071949 [list] [network] FAD binding  (43 genes)  IEA  
KEGG
Protein NP_564244.1 
BLAST NP_564244.1 
Orthologous [Ortholog page] LOC732592 (gma)LOC732593 (gma)MEE23 (ath)AT4G20800 (ath)AT4G20820 (ath)AT4G20830 (ath)AT4G20840 (ath)AT4G20860 (ath)AT5G44360 (ath)AT5G44380 (ath)AT5G44390 (ath)AT5G44400 (ath)AT5G44410 (ath)AT5G44440 (ath)AT1G11770 (ath)AT1G26390 (ath)AT1G26400 (ath)AT1G26410 (ath)AT1G26420 (ath)AT1G01980 (ath)AT1G30700 (ath)AT1G30710 (ath)AT1G30760 (ath)AT1G34575 (ath)LOC4341253 (osa)LOC4341254 (osa)LOC4341257 (osa)LOC4341259 (osa)LOC4341261 (osa)LOC7457662 (ppo)LOC7471680 (ppo)LOC7471681 (ppo)LOC7480379 (ppo)LOC7480381 (ppo)LOC7480383 (ppo)LOC7480394 (ppo)LOC7480395 (ppo)LOC7480398 (ppo)LOC7480399 (ppo)LOC7480401 (ppo)LOC7480403 (ppo)LOC7480406 (ppo)LOC7480408 (ppo)LOC7480409 (ppo)LOC7480417 (ppo)LOC7480418 (ppo)LOC7484482 (ppo)LOC7485160 (ppo)LOC7485161 (ppo)LOC7485205 (ppo)LOC7489102 (ppo)LOC7489103 (ppo)LOC7489112 (ppo)LOC7489114 (ppo)LOC7489115 (ppo)LOC7489116 (ppo)LOC7489117 (ppo)LOC11406991 (mtr)LOC11407647 (mtr)LOC11415235 (mtr)LOC11415951 (mtr)LOC11416804 (mtr)LOC11418784 (mtr)LOC11420001 (mtr)LOC11422032 (mtr)LOC11422989 (mtr)LOC11424412 (mtr)LOC11429520 (mtr)LOC18095776 (ppo)LOC18096028 (ppo)LOC18103477 (ppo)LOC18103479 (ppo)LOC18103480 (ppo)LOC18103481 (ppo)LOC18103482 (ppo)LOC18103487 (ppo)LOC18103492 (ppo)LOC18103495 (ppo)LOC18103496 (ppo)LOC18103497 (ppo)LOC18103499 (ppo)LOC18103509 (ppo)LOC18103510 (ppo)LOC18103511 (ppo)LOC18103513 (ppo)LOC18105648 (ppo)LOC18109453 (ppo)LOC25486180 (mtr)LOC25486316 (mtr)LOC25486318 (mtr)LOC25486319 (mtr)LOC25492422 (mtr)LOC25493091 (mtr)LOC25493334 (mtr)LOC25493352 (mtr)LOC25493353 (mtr)LOC25493354 (mtr)LOC25493355 (mtr)LOC25493356 (mtr)LOC25493357 (mtr)LOC25493364 (mtr)LOC25493365 (mtr)LOC25493366 (mtr)LOC25495604 (mtr)LOC100775353 (gma)LOC100775893 (gma)LOC100776438 (gma)LOC100777594 (gma)LOC100778568 (gma)LOC100779395 (gma)LOC100780114 (gma)LOC100780461 (gma)LOC100781004 (gma)LOC100781731 (gma)LOC100782093 (gma)LOC100782292 (gma)LOC100782631 (gma)LOC100786800 (gma)LOC100788228 (gma)LOC100788233 (gma)LOC100794074 (gma)LOC100796276 (gma)LOC100796809 (gma)LOC100797188 (gma)LOC100797739 (gma)LOC100799990 (gma)LOC100800519 (gma)LOC100801058 (gma)LOC100802131 (gma)LOC100803041 (gma)LOC100807459 (gma)LOC100807998 (gma)LOC100810481 (gma)LOC100811019 (gma)LOC100811558 (gma)LOC100812087 (gma)LOC100813175 (gma)LOC100813706 (gma)LOC101246398 (sly)LOC101246685 (sly)LOC101249413 (sly)LOC101249763 (sly)LOC101254601 (sly)LOC101254908 (sly)LOC101254965 (sly)LOC101255262 (sly)LOC101255854 (sly)LOC101256448 (sly)LOC101263376 (sly)LOC101263972 (sly)LOC101264289 (sly)LOC101264571 (sly)LOC101264701 (sly)LOC101265002 (sly)LOC101265308 (sly)LOC101265606 (sly)LOC102662170 (gma)LOC103827902 (bra)LOC103827906 (bra)LOC103828799 (bra)LOC103828803 (bra)LOC103834173 (bra)LOC103839175 (bra)LOC103839178 (bra)LOC103839179 (bra)LOC103839182 (bra)LOC103839321 (bra)LOC103839322 (bra)LOC103840305 (bra)LOC103840312 (bra)LOC103840313 (bra)LOC103840613 (bra)LOC103840614 (bra)LOC103841228 (bra)LOC103843225 (bra)LOC103850258 (bra)LOC103857550 (bra)LOC103858368 (bra)LOC103858377 (bra)LOC103858400 (bra)LOC103858408 (bra)LOC103858430 (bra)LOC103858724 (bra)LOC103861201 (bra)LOC103861202 (bra)LOC103865354 (bra)LOC103867418 (bra)LOC103871928 (bra)LOC104645788 (sly)LOC104646055 (sly)LOC107275394 (osa)LOC108869423 (bra)LOC112323320 (ppo)LOC112323321 (ppo)LOC112323322 (ppo)LOC112323328 (ppo)LOC112323330 (ppo)LOC112324786 (ppo)LOC112324789 (ppo)LOC112325984 (ppo)LOC112329148 (ppo)LOC112421407 (mtr)LOC117125831 (bra)LOC120580904 (mtr)LOC123039084 (tae)LOC123043821 (tae)LOC123044031 (tae)LOC123048809 (tae)LOC123051687 (tae)LOC123051908 (tae)LOC123056682 (tae)LOC123069860 (tae)LOC123101225 (tae)LOC123104138 (tae)LOC123121890 (tae)LOC123151640 (tae)LOC123151641 (tae)LOC123151651 (tae)LOC123154502 (tae)LOC123154697 (tae)LOC123159831 (tae)LOC123160014 (tae)LOC123160305 (tae)LOC123160322 (tae)LOC123160325 (tae)LOC123160531 (tae)LOC123166878 (tae)LOC123166970 (tae)LOC123167086 (tae)LOC123167432 (tae)LOC123168236 (tae)LOC123169320 (tae)LOC123171182 (tae)LOC123172934 (tae)LOC123178742 (tae)LOC123182957 (tae)LOC123183295 (tae)LOC123184816 (tae)LOC123184818 (tae)LOC123396132 (hvu)LOC123407824 (hvu)LOC123409363 (hvu)LOC123411150 (hvu)LOC123411227 (hvu)LOC123411684 (hvu)LOC123413019 (hvu)LOC123421037 (hvu)LOC123425140 (hvu)LOC123425397 (hvu)LOC123429002 (hvu)LOC123429003 (hvu)LOC123429523 (hvu)
Subcellular
localization
wolf
cyto 5,  extr 1,  E.R. 1,  chlo 1,  mito 1,  plas 1,  chlo_mito 1,  E.R._vacu 1,  mito_plas 1  (predict for NP_564244.1)
Subcellular
localization
TargetP
scret 7  (predict for NP_564244.1)
Gene coexpression
Network*for
coexpressed
genes
LCNloc
[Cytoscape]
KEGG* ID Title #genes Link to the KEGG* map
(Multiple genes)
ath00480 Glutathione metabolism 3
Genes directly connected with AT1G26380 on the network
coex z* Locus Function* CoexViewer Entrez Gene ID*
19.5 CYP71A12 cytochrome P450 family 71 polypeptide [detail] 817626
18.2 AT1G26420 FAD-binding Berberine family protein [detail] 839184
15.0 AT1G26410 FAD-binding Berberine family protein [detail] 839183
13.0 NAC042 NAC domain containing protein 42 [detail] 818902
12.5 WAKL10 WALL ASSOCIATED KINASE (WAK)-LIKE 10 [detail] 844307
11.7 GSTF7 glutathione S-transferase 7 [detail] 839295
11.7 CYP81F2 cytochrome P450, family 81, subfamily F, polypeptide 2 [detail] 835828
11.0 AT5G65600 Concanavalin A-like lectin protein kinase family protein [detail] 836686
9.7 AT2G23270 uncharacterized protein [detail] 816859
9.4 CCOAMT caffeoyl-CoA 3-O-methyltransferase [detail] 843126
9.1 PLA2A phospholipase A 2A [detail] 817197
9.0 PAD3 Cytochrome P450 superfamily protein [detail] 822298
8.7 IGMT2 O-methyltransferase family protein [detail] 838708
8.7 GSTU12 glutathione S-transferase TAU 12 [detail] 843328
8.6 AT3G54150 S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferases superfamily protein [detail] 824582
8.1 GSTF6 glutathione S-transferase 6 [detail] 839515
7.6 PXMT1 S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferases superfamily protein [detail] 842988
6.9 AT4G26120 Ankyrin repeat family protein / BTB/POZ domain-containing protein [detail] 828718
6.6 AT3G09405 Pectinacetylesterase family protein [detail] 7922320
6.3 AT2G25297 uncharacterized protein [detail] 28718306
5.9 AT5G56960 basic helix-loop-helix (bHLH) DNA-binding family protein [detail] 835798
5.4 AT5G42830 HXXXD-type acyl-transferase family protein [detail] 834294
Coexpressed
gene list
[Coexpressed gene list for AT1G26380]
Gene expression
All samples [Expression pattern for all samples]
AtGenExpress*
(Development)
261021_at
261021_at.png

X axis is samples (pdf file), and Y axis is log2-expression.
"1st Q", "mean" and "3rd Q" indecate the values for all genes on a GeneChip. Q: quartile.

AtGenExpress*
(Stress)
261021_at
261021_at.png

X axis is samples (pdf file), and Y axis is log2-expression.

AtGenExpress*
(Hormone)
261021_at
261021_at.png

X axis is samples (xls file), and Y axis is log-expression.

Link to other DBs
Entrez Gene ID 839180    
Refseq ID (protein) NP_564244.1 


The preparation time of this page was 0.1 [sec].