[][] ath   At1g29910 Gene
functional annotation
Function   chlorophyll A/B binding protein 3 Plant GARDENPlant GARDEN JBrowse
GO BP
GO CC
GO:0010287 [list] [network] plastoglobule  (57 genes)  HDA  
GO:0009535 [list] [network] chloroplast thylakoid membrane  (315 genes)  HDA  
GO:0009534 [list] [network] chloroplast thylakoid  (415 genes)  HDA  
GO:0009579 [list] [network] thylakoid  (509 genes)  HDA  
GO:0005794 [list] [network] Golgi apparatus  (1182 genes)  RCA  
GO:0005739 [list] [network] mitochondrion  (4228 genes)  HDA  
GO:0009507 [list] [network] chloroplast  (5004 genes)  HDA ISM  
GO:0005634 [list] [network] nucleus  (10305 genes)  HDA  
GO MF
GO:0016168 [list] [network] chlorophyll binding  (21 genes)  ISS TAS  
GO:0003729 [list] [network] mRNA binding  (1535 genes)  IDA  
KEGG ath00196 [list] [network] Photosynthesis - antenna proteins (22 genes)
Protein NP_564339.1 
BLAST NP_564339.1 
Orthologous [Ortholog page] LOC543256 (tae)CAB4 (sly)CAB5 (sly)LOC547819 (gma)CAB3 (gma)LHCB2.2 (ath)LHCB2.1 (ath)LHB1B2 (ath)LHB1B1 (ath)LHCB2.3 (ath)CAB2 (ath)CAB1 (ath)LOC4324599 (osa)LOC4324705 (osa)LOC4333359 (osa)LOC4346803 (osa)LOC7455996 (ppo)LOC7471832 (ppo)LOC7481433 (ppo)LOC7489858 (ppo)LOC7493970 (ppo)LOC7493971 (ppo)LOC11414909 (mtr)LOC11427672 (mtr)LOC11434875 (mtr)LOC25493394 (mtr)LOC25495304 (mtr)LOC25495305 (mtr)LOC25495306 (mtr)LOC100682487 (tae)LOC100793702 (gma)LOC100799813 (gma)LHCB1-7 (gma)LOC100805310 (gma)LOC100815789 (gma)LOC101245729 (sly)LOC101263969 (sly)LOC101264286 (sly)CAB1B (sly)LOC101265886 (sly)CBP1 (sly)LOC101267774 (sly)LOC103828916 (bra)LOC103828920 (bra)LOC103835251 (bra)LOC103837002 (bra)LOC103840451 (bra)LOC103854220 (bra)LOC103857533 (bra)LOC103860327 (bra)LOC103865334 (bra)LOC103867454 (bra)LOC103867457 (bra)LOC103875194 (bra)Cab-1D (sly)Cab-1A (sly)Cab-3C (sly)CBP2 (sly)LOC123060502 (tae)LOC123065880 (tae)LOC123065889 (tae)LOC123065910 (tae)LOC123065922 (tae)LOC123068639 (tae)LOC123068673 (tae)LOC123104562 (tae)LOC123105512 (tae)LOC123105513 (tae)LOC123112836 (tae)LOC123113017 (tae)LOC123113816 (tae)LOC123113817 (tae)LOC123113818 (tae)LOC123113821 (tae)LOC123122327 (tae)LOC123122527 (tae)LOC123123324 (tae)LOC123123325 (tae)LOC123123326 (tae)LOC123132049 (tae)LOC123132051 (tae)LOC123132053 (tae)LOC123132054 (tae)LOC123132056 (tae)LOC123136082 (tae)LOC123136085 (tae)LOC123137522 (tae)LOC123137523 (tae)LOC123143417 (tae)LOC123143588 (tae)LOC123143591 (tae)LOC123146389 (tae)LOC123146452 (tae)LOC123152634 (tae)LOC123160302 (tae)LOC123163221 (tae)LOC123168972 (tae)LOC123169666 (tae)LOC123175700 (tae)LOC123182417 (tae)LOC123182881 (tae)LOC123182882 (tae)LOC123182883 (tae)LOC123183162 (tae)LOC123400105 (hvu)LOC123403763 (hvu)LOC123403764 (hvu)LOC123404210 (hvu)LOC123411532 (hvu)LOC123412762 (hvu)LOC123412763 (hvu)LOC123447768 (hvu)LOC123450698 (hvu)LOC123451888 (hvu)
Subcellular
localization
wolf
chlo 10  (predict for NP_564339.1)
Subcellular
localization
TargetP
chlo 7  (predict for NP_564339.1)
Gene coexpression
Network*for
coexpressed
genes
LCNloc
[Cytoscape]
KEGG* ID Title #genes Link to the KEGG* map
(Multiple genes)
ath00196 Photosynthesis - antenna proteins 15
ath00195 Photosynthesis 6
Genes directly connected with CAB3 on the network
coex z* Locus Function* CoexViewer Entrez Gene ID*
17.6 CAB2 chlorophyll A/B-binding protein 2 [detail] 839870
15.0 LHCA1 chlorophyll a-b binding protein 6 [detail] 824654
14.9 CAB1 chlorophyll A/B binding protein 1 [detail] 839871
14.1 LHB1B1 light-harvesting chlorophyll-protein complex II subunit B1 [detail] 818006
Coexpressed
gene list
[Coexpressed gene list for CAB3]
Gene expression
All samples [Expression pattern for all samples]
Link to other DBs
Entrez Gene ID 839869    
Refseq ID (protein) NP_564339.1 


The preparation time of this page was 0.1 [sec].