[][] ath   At1g30700 Gene
functional annotation
Function   FAD-binding Berberine family protein Plant GARDENPlant GARDEN JBrowse
GO BP
GO:0009404 [list] [network] toxin metabolic process  (116 genes)  IEA  
GO:0010150 [list] [network] leaf senescence  (195 genes)  IEA  
GO:0098771 [list] [network] inorganic ion homeostasis  (252 genes)  IEA  
GO:0002376 [list] [network] immune system process  (453 genes)  IEA  
GO:0009753 [list] [network] response to jasmonic acid  (611 genes)  IEA  
GO:0050832 [list] [network] defense response to fungus  (705 genes)  IEA  
GO:0031347 [list] [network] regulation of defense response  (749 genes)  IEA  
GO:0006970 [list] [network] response to osmotic stress  (883 genes)  IEA  
GO:0042742 [list] [network] defense response to bacterium  (980 genes)  IEA  
GO:0009414 [list] [network] response to water deprivation  (1006 genes)  IEA  
GO:0009737 [list] [network] response to abscisic acid  (1086 genes)  IEA  
GO:0044248 [list] [network] cellular catabolic process  (1086 genes)  IEA  
GO:0009416 [list] [network] response to light stimulus  (1981 genes)  IEA  
GO CC
GO:0009505 [list] [network] plant-type cell wall  (498 genes)  ISS  
GO:0009507 [list] [network] chloroplast  (5004 genes)  ISM  
GO MF
GO:0071949 [list] [network] FAD binding  (43 genes)  IEA  
KEGG
Protein NP_174357.1 
BLAST NP_174357.1 
Orthologous [Ortholog page] LOC732592 (gma)LOC732593 (gma)MEE23 (ath)AT4G20800 (ath)AT4G20820 (ath)AT4G20830 (ath)AT4G20840 (ath)AT4G20860 (ath)AT5G44360 (ath)AT5G44380 (ath)AT5G44390 (ath)AT5G44400 (ath)AT5G44410 (ath)AT5G44440 (ath)AT1G11770 (ath)AT1G26380 (ath)AT1G26390 (ath)AT1G26400 (ath)AT1G26410 (ath)AT1G26420 (ath)AT1G01980 (ath)AT1G30710 (ath)AT1G30760 (ath)AT1G34575 (ath)LOC4341253 (osa)LOC4341254 (osa)LOC4341257 (osa)LOC4341259 (osa)LOC4341261 (osa)LOC7457662 (ppo)LOC7471680 (ppo)LOC7471681 (ppo)LOC7480379 (ppo)LOC7480381 (ppo)LOC7480383 (ppo)LOC7480394 (ppo)LOC7480395 (ppo)LOC7480398 (ppo)LOC7480399 (ppo)LOC7480401 (ppo)LOC7480403 (ppo)LOC7480406 (ppo)LOC7480408 (ppo)LOC7480409 (ppo)LOC7480417 (ppo)LOC7480418 (ppo)LOC7484482 (ppo)LOC7485160 (ppo)LOC7485161 (ppo)LOC7485205 (ppo)LOC7489102 (ppo)LOC7489103 (ppo)LOC7489112 (ppo)LOC7489114 (ppo)LOC7489115 (ppo)LOC7489116 (ppo)LOC7489117 (ppo)LOC11406991 (mtr)LOC11407647 (mtr)LOC11415235 (mtr)LOC11415951 (mtr)LOC11416804 (mtr)LOC11418784 (mtr)LOC11420001 (mtr)LOC11422032 (mtr)LOC11422989 (mtr)LOC11424412 (mtr)LOC11429520 (mtr)LOC18095776 (ppo)LOC18096028 (ppo)LOC18103477 (ppo)LOC18103479 (ppo)LOC18103480 (ppo)LOC18103481 (ppo)LOC18103482 (ppo)LOC18103487 (ppo)LOC18103492 (ppo)LOC18103495 (ppo)LOC18103496 (ppo)LOC18103497 (ppo)LOC18103499 (ppo)LOC18103509 (ppo)LOC18103510 (ppo)LOC18103511 (ppo)LOC18103513 (ppo)LOC18105648 (ppo)LOC18109453 (ppo)LOC25486180 (mtr)LOC25486316 (mtr)LOC25486318 (mtr)LOC25486319 (mtr)LOC25492422 (mtr)LOC25493091 (mtr)LOC25493334 (mtr)LOC25493352 (mtr)LOC25493353 (mtr)LOC25493354 (mtr)LOC25493355 (mtr)LOC25493356 (mtr)LOC25493357 (mtr)LOC25493364 (mtr)LOC25493365 (mtr)LOC25493366 (mtr)LOC25495604 (mtr)LOC100775353 (gma)LOC100775893 (gma)LOC100776438 (gma)LOC100777594 (gma)LOC100778568 (gma)LOC100779395 (gma)LOC100780114 (gma)LOC100780461 (gma)LOC100781004 (gma)LOC100781731 (gma)LOC100782093 (gma)LOC100782292 (gma)LOC100782631 (gma)LOC100786800 (gma)LOC100788228 (gma)LOC100788233 (gma)LOC100794074 (gma)LOC100796276 (gma)LOC100796809 (gma)LOC100797188 (gma)LOC100797739 (gma)LOC100799990 (gma)LOC100800519 (gma)LOC100801058 (gma)LOC100802131 (gma)LOC100803041 (gma)LOC100807459 (gma)LOC100807998 (gma)LOC100810481 (gma)LOC100811019 (gma)LOC100811558 (gma)LOC100812087 (gma)LOC100813175 (gma)LOC100813706 (gma)LOC101246398 (sly)LOC101246685 (sly)LOC101249413 (sly)LOC101249763 (sly)LOC101254601 (sly)LOC101254908 (sly)LOC101254965 (sly)LOC101255262 (sly)LOC101255854 (sly)LOC101256448 (sly)LOC101263376 (sly)LOC101263972 (sly)LOC101264289 (sly)LOC101264571 (sly)LOC101264701 (sly)LOC101265002 (sly)LOC101265308 (sly)LOC101265606 (sly)LOC102662170 (gma)LOC103827902 (bra)LOC103827906 (bra)LOC103828799 (bra)LOC103828803 (bra)LOC103834173 (bra)LOC103839175 (bra)LOC103839178 (bra)LOC103839179 (bra)LOC103839182 (bra)LOC103839321 (bra)LOC103839322 (bra)LOC103840305 (bra)LOC103840312 (bra)LOC103840313 (bra)LOC103840613 (bra)LOC103840614 (bra)LOC103841228 (bra)LOC103843225 (bra)LOC103850258 (bra)LOC103857550 (bra)LOC103858368 (bra)LOC103858377 (bra)LOC103858400 (bra)LOC103858408 (bra)LOC103858430 (bra)LOC103858724 (bra)LOC103861201 (bra)LOC103861202 (bra)LOC103865354 (bra)LOC103867418 (bra)LOC103871928 (bra)LOC104645788 (sly)LOC104646055 (sly)LOC107275394 (osa)LOC108869423 (bra)LOC112323320 (ppo)LOC112323321 (ppo)LOC112323322 (ppo)LOC112323328 (ppo)LOC112323330 (ppo)LOC112324786 (ppo)LOC112324789 (ppo)LOC112325984 (ppo)LOC112329148 (ppo)LOC112421407 (mtr)LOC117125831 (bra)LOC120580904 (mtr)LOC123039084 (tae)LOC123043821 (tae)LOC123044031 (tae)LOC123048809 (tae)LOC123051687 (tae)LOC123051908 (tae)LOC123056682 (tae)LOC123069860 (tae)LOC123101225 (tae)LOC123104138 (tae)LOC123121890 (tae)LOC123151640 (tae)LOC123151641 (tae)LOC123151651 (tae)LOC123154502 (tae)LOC123154697 (tae)LOC123159831 (tae)LOC123160014 (tae)LOC123160305 (tae)LOC123160322 (tae)LOC123160325 (tae)LOC123160531 (tae)LOC123166878 (tae)LOC123166970 (tae)LOC123167086 (tae)LOC123167432 (tae)LOC123168236 (tae)LOC123169320 (tae)LOC123171182 (tae)LOC123172934 (tae)LOC123178742 (tae)LOC123182957 (tae)LOC123183295 (tae)LOC123184816 (tae)LOC123184818 (tae)LOC123396132 (hvu)LOC123407824 (hvu)LOC123409363 (hvu)LOC123411150 (hvu)LOC123411227 (hvu)LOC123411684 (hvu)LOC123413019 (hvu)LOC123421037 (hvu)LOC123425140 (hvu)LOC123425397 (hvu)LOC123429002 (hvu)LOC123429003 (hvu)LOC123429523 (hvu)
Subcellular
localization
wolf
vacu 4,  chlo 1,  golg 1,  cyto 1,  mito 1,  plas 1,  extr 1,  mito_plas 1,  cyto_plas 1  (predict for NP_174357.1)
Subcellular
localization
TargetP
scret 8  (predict for NP_174357.1)
Gene coexpression
Network*for
coexpressed
genes
LCNloc
[Cytoscape]
Genes directly connected with AT1G30700 on the network
coex z* Locus Function* CoexViewer Entrez Gene ID*
9.7 DOX1 Peroxidase superfamily protein [detail] 821135
9.3 PDE337 VQ motif-containing protein [detail] 843174
8.3 UPI Serine protease inhibitor, potato inhibitor I-type family protein [detail] 834378
7.3 AT4G15610 Uncharacterized protein family (UPF0497) [detail] 827238
6.8 AT2G45220 Plant invertase/pectin methylesterase inhibitor superfamily [detail] 819130
6.4 AT3G46690 UDP-Glycosyltransferase superfamily protein [detail] 823822
5.8 AT4G20860 FAD-binding Berberine family protein [detail] 827834
Coexpressed
gene list
[Coexpressed gene list for AT1G30700]
Gene expression
All samples [Expression pattern for all samples]
AtGenExpress*
(Development)
263228_at
263228_at.png

X axis is samples (pdf file), and Y axis is log2-expression.
"1st Q", "mean" and "3rd Q" indecate the values for all genes on a GeneChip. Q: quartile.

AtGenExpress*
(Stress)
263228_at
263228_at.png

X axis is samples (pdf file), and Y axis is log2-expression.

AtGenExpress*
(Hormone)
263228_at
263228_at.png

X axis is samples (xls file), and Y axis is log-expression.

Link to other DBs
Entrez Gene ID 839950    
Refseq ID (protein) NP_174357.1 


The preparation time of this page was 0.5 [sec].