[][] ath   At1g49240 Gene
functional annotation
Function   actin 8 Plant GARDENPlant GARDEN JBrowse
GO BP
GO:0048768 [list] [network] root hair cell tip growth  (25 genes)  IMP  
GO CC
GO:0009941 [list] [network] chloroplast envelope  (582 genes)  HDA  
GO:0009570 [list] [network] chloroplast stroma  (705 genes)  HDA  
GO:0000325 [list] [network] plant-type vacuole  (785 genes)  HDA  
GO:0009506 [list] [network] plasmodesma  (871 genes)  HDA  
GO:0005829 [list] [network] cytosol  (2559 genes)  HDA  
GO:0005634 [list] [network] nucleus  (10305 genes)  HDA  
GO:0005737 [list] [network] cytoplasm  (13880 genes)  ISM  
GO MF
GO:0005507 [list] [network] copper ion binding  (132 genes)  HDA  
GO:0003729 [list] [network] mRNA binding  (1535 genes)  HDA  
KEGG
Protein NP_175350.1 
BLAST NP_175350.1 
Orthologous [Ortholog page] LOC542814 (tae)LOC543120 (tae)ACT1 (ath)ACT9 (ath)AT2G42100 (ath)AT2G42170 (ath)ACT11 (ath)ACT2 (ath)ACT12 (ath)ACT3 (ath)ACT7 (ath)ACT4 (ath)LOC4325068 (osa)LOC4333919 (osa)LOC4334702 (osa)LOC4337566 (osa)LOC4338914 (osa)LOC4349087 (osa)LOC4349863 (osa)LOC4351585 (osa)LOC4352927 (osa)LOC7458147 (ppo)LOC7467546 (ppo)LOC7479526 (ppo)LOC7483974 (ppo)LOC7489063 (ppo)LOC7490729 (ppo)LOC7492024 (ppo)LOC9269066 (osa)LOC11425201 (mtr)LOC11428527 (mtr)LOC11431140 (mtr)LOC11441933 (mtr)LOC18100314 (ppo)LOC18108099 (ppo)LOC25479628 (mtr)LOC25487878 (mtr)LOC25495077 (mtr)LOC100777460 (gma)LOC100777705 (gma)LOC100778206 (gma)LOC100781142 (gma)LOC100781831 (gma)LOC100787265 (gma)LOC100789000 (gma)LOC100792119 (gma)LOC100797704 (gma)LOC100798052 (gma)SOY69 (gma)LOC100799890 (gma)LOC100806695 (gma)LOC100807341 (gma)LOC100811630 (gma)LOC100813210 (gma)LOC100813437 (gma)LOC100815472 (gma)LOC101249734 (sly)LOC101250165 (sly)LOC101253675 (sly)LOC101255046 (sly)LOC101255728 (sly)actin (sly)LOC101262163 (sly)Tom52 (sly)LOC101264220 (sly)ACT (sly)LOC101264618 (sly)LOC103838412 (bra)LOC103841298 (bra)LOC103845362 (bra)LOC103846860 (bra)LOC103850356 (bra)LOC103851581 (bra)LOC103855835 (bra)LOC103856636 (bra)LOC103857724 (bra)LOC103859774 (bra)LOC103863285 (bra)LOC103865617 (bra)LOC103867177 (bra)ACT1 (bra)LOC103870277 (bra)LOC103873303 (bra)LOC103873596 (bra)LOC103873698 (bra)LOC112325314 (ppo)LOC123048645 (tae)LOC123057740 (tae)LOC123062711 (tae)LOC123071529 (tae)LOC123079869 (tae)LOC123087081 (tae)LOC123090883 (tae)LOC123095909 (tae)LOC123101898 (tae)LOC123102963 (tae)LOC123103657 (tae)LOC123110037 (tae)LOC123111117 (tae)LOC123114174 (tae)LOC123119001 (tae)LOC123120107 (tae)LOC123123661 (tae)LOC123124811 (tae)LOC123179078 (tae)LOC123179877 (tae)LOC123181307 (tae)LOC123182166 (tae)LOC123185737 (tae)LOC123394939 (hvu)LOC123398932 (hvu)LOC123399877 (hvu)LOC123430406 (hvu)LOC123434401 (hvu)LOC123444811 (hvu)LOC123446308 (hvu)LOC123447531 (hvu)
Subcellular
localization
wolf
cysk 10  (predict for NP_175350.1)
Subcellular
localization
TargetP
other 8  (predict for NP_175350.1)
Gene coexpression
Network*for
coexpressed
genes
LCNloc
[Cytoscape]
Genes directly connected with ACT8 on the network
coex z* Locus Function* CoexViewer Entrez Gene ID*
10.8 ARFA1E ADP-ribosylation factor A1E [detail] 825402
10.5 ACT2 actin 2 [detail] 821411
9.8 WAV2 alpha/beta-Hydrolases superfamily protein [detail] 832174
9.0 ATR1 P450 reductase 1 [detail] 828554
6.1 HMG1 hydroxy methylglutaryl CoA reductase 1 [detail] 843982
5.1 CINV1 cytosolic invertase 1 [detail] 840454
Coexpressed
gene list
[Coexpressed gene list for ACT8]
Gene expression
All samples [Expression pattern for all samples]
AtGenExpress*
(Development)
260765_at
260765_at.png

X axis is samples (pdf file), and Y axis is log2-expression.
"1st Q", "mean" and "3rd Q" indecate the values for all genes on a GeneChip. Q: quartile.

AtGenExpress*
(Stress)
260765_at
260765_at.png

X axis is samples (pdf file), and Y axis is log2-expression.

AtGenExpress*
(Hormone)
260765_at
260765_at.png

X axis is samples (xls file), and Y axis is log-expression.

Link to other DBs
Entrez Gene ID 841347    
Refseq ID (protein) NP_175350.1 


The preparation time of this page was 0.1 [sec].