[][] ath   At1g73280 Gene
functional annotation
Function   serine carboxypeptidase-like 3 Plant GARDENPlant GARDEN JBrowse
GO BP
GO CC
GO:0005576 [list] [network] extracellular region  (3154 genes)  ISM  
GO MF
GO:0004185 [list] [network] serine-type carboxypeptidase activity  (23 genes)  IEA  
KEGG
Protein NP_001323311.1  NP_001323312.1  NP_001323313.1  NP_177471.1 
BLAST NP_001323311.1  NP_001323312.1  NP_001323313.1  NP_177471.1 
Orthologous [Ortholog page] SCPL12 (ath)SCPL11 (ath)SCPL13 (ath)SNG1 (ath)scpl10 (ath)SCPL9 (ath)SCPL7 (ath)scpl17 (ath)scpl16 (ath)scpl14 (ath)SCPL15 (ath)SCPL19 (ath)scpl1 (ath)scpl18 (ath)scpl6 (ath)scpl5 (ath)scpl2 (ath)scpl4 (ath)LOC4330362 (osa)LOC4335083 (osa)LOC4347941 (osa)LOC4350472 (osa)LOC4350473 (osa)LOC7478668 (ppo)LOC9269030 (osa)LOC9271773 (osa)LOC11414298 (mtr)LOC11414299 (mtr)LOC11414606 (mtr)LOC11419263 (mtr)LOC11421514 (mtr)LOC11423210 (mtr)LOC11437807 (mtr)LOC11438858 (mtr)LOC11440819 (mtr)LOC18095163 (ppo)LOC18095168 (ppo)LOC18095169 (ppo)LOC18104568 (ppo)LOC18104570 (ppo)LOC25491575 (mtr)LOC100780069 (gma)LOC100781037 (gma)LOC100792006 (gma)LOC100794342 (gma)LOC100801015 (gma)LOC101250687 (sly)LOC101260582 (sly)LOC101261173 (sly)LOC101261227 (sly)LOC101266126 (sly)LOC101268653 (sly)LOC103828800 (bra)LOC103829513 (bra)LOC103830756 (bra)LOC103830757 (bra)LOC103831815 (bra)LOC103840196 (bra)LOC103840308 (bra)LOC103842453 (bra)LOC103845655 (bra)LOC103845689 (bra)LOC103846315 (bra)LOC103847220 (bra)LOC103847221 (bra)LOC103850370 (bra)LOC103850371 (bra)LOC103851060 (bra)LOC103856206 (bra)LOC103858396 (bra)LOC103859433 (bra)LOC103859434 (bra)LOC103859435 (bra)LOC103863921 (bra)LOC103863958 (bra)LOC103864442 (bra)LOC103870465 (bra)LOC104647190 (sly)LOC104647191 (sly)LOC104647586 (sly)LOC107275596 (osa)LOC107276517 (osa)LOC107277598 (osa)LOC112325867 (ppo)LOC112421300 (mtr)LOC112940472 (sly)LOC117125623 (bra)LOC123060322 (tae)LOC123064935 (tae)LOC123077337 (tae)LOC123084332 (tae)LOC123086990 (tae)LOC123086992 (tae)LOC123086993 (tae)LOC123090973 (tae)LOC123090977 (tae)LOC123090979 (tae)LOC123093730 (tae)LOC123093731 (tae)LOC123095995 (tae)LOC123098973 (tae)LOC123101421 (tae)LOC123104155 (tae)LOC123107246 (tae)LOC123107449 (tae)LOC123112392 (tae)LOC123112393 (tae)LOC123121913 (tae)LOC123121915 (tae)LOC123125194 (tae)LOC123150405 (tae)LOC123150508 (tae)LOC123150519 (tae)LOC123154991 (tae)LOC123161709 (tae)LOC123166880 (tae)LOC123396694 (hvu)LOC123396843 (hvu)LOC123399364 (hvu)LOC123409906 (hvu)LOC123412975 (hvu)LOC123442853 (hvu)LOC123447665 (hvu)LOC123447666 (hvu)LOC123449852 (hvu)
Subcellular
localization
wolf
vacu 4,  chlo 1,  plas 1,  extr 1,  nucl 1,  cyto 1,  cyto_nucl 1,  chlo_mito 1,  golg_plas 1,  cysk_plas 1,  E.R._plas 1,  mito_plas 1  (predict for NP_001323311.1)
chlo 4,  cyto 2,  chlo_mito 2,  extr 1,  pero 1,  cyto_nucl 1  (predict for NP_001323312.1)
cyto 5,  nucl 2,  chlo 1,  cysk_nucl 1  (predict for NP_001323313.1)
vacu 4,  plas 1,  extr 1,  E.R. 1,  golg 1,  golg_plas 1,  E.R._plas 1  (predict for NP_177471.1)
Subcellular
localization
TargetP
scret 9  (predict for NP_001323311.1)
other 5  (predict for NP_001323312.1)
other 7  (predict for NP_001323313.1)
scret 9  (predict for NP_177471.1)
Gene coexpression
Network*for
coexpressed
genes
LCNloc
[Cytoscape]
Genes directly connected with scpl3 on the network
coex z* Locus Function* CoexViewer Entrez Gene ID*
9.6 scpl6 serine carboxypeptidase-like 6 [detail] 843661
6.7 AT1G66800 NAD(P)-binding Rossmann-fold superfamily protein [detail] 842998
6.5 AT5G23840 MD-2-related lipid recognition domain-containing protein [detail] 832449
6.2 scpl1 serine carboxypeptidase-like 1 [detail] 833615
4.7 AT4G25400 basic helix-loop-helix (bHLH) DNA-binding superfamily protein [detail] 828643
Coexpressed
gene list
[Coexpressed gene list for scpl3]
Gene expression
All samples [Expression pattern for all samples]
AtGenExpress*
(Development)
260092_at
260092_at.png

X axis is samples (pdf file), and Y axis is log2-expression.
"1st Q", "mean" and "3rd Q" indecate the values for all genes on a GeneChip. Q: quartile.

AtGenExpress*
(Stress)
260092_at
260092_at.png

X axis is samples (pdf file), and Y axis is log2-expression.

AtGenExpress*
(Hormone)
260092_at
260092_at.png

X axis is samples (xls file), and Y axis is log-expression.

Link to other DBs
Entrez Gene ID 843662    
Refseq ID (protein) NP_001323311.1 
NP_001323312.1 
NP_001323313.1 
NP_177471.1 


The preparation time of this page was 0.2 [sec].