[][] ath   At2g25450 Gene
functional annotation
Function   2-oxoglutarate (2OG) and Fe(II)-dependent oxygenase superfamily protein
GO BP
GO:0010439 [list] [network] regulation of glucosinolate biosynthetic process  (13 genes)  IMP  
GO:0019761 [list] [network] glucosinolate biosynthetic process  (42 genes)  IMP  
GO CC
GO:0009506 [list] [network] plasmodesma  (871 genes)  HDA  
GO:0005773 [list] [network] vacuole  (971 genes)  HDA  
GO:0005829 [list] [network] cytosol  (2559 genes)  HDA  
GO:0005737 [list] [network] cytoplasm  (13880 genes)  ISM  
GO MF
GO:0062131 [list] [network] 3-butenylglucosinolate 2-hydroxylase activity  (1 genes)  IDA IMP  
GO:0009815 [list] [network] 1-aminocyclopropane-1-carboxylate oxidase activity  (12 genes)  ISS  
KEGG
Protein NP_180115.1 
BLAST NP_180115.1 
Orthologous [Ortholog page] E8 (sly)AT2G30830 (ath)AT2G30840 (ath)AT3G61400 (ath)AT5G43440 (ath)AT5G43450 (ath)AT5G59530 (ath)AT5G59540 (ath)AT1G06620 (ath)AT1G06640 (ath)AT1G06650 (ath)AT1G03400 (ath)2A6 (ath)AT1G04380 (ath)AT1G04350 (ath)AT1G06645 (ath)LOC4333774 (osa)LOC4335099 (osa)LOC7474620 (ppo)LOC7476902 (ppo)LOC7479980 (ppo)LOC7485152 (ppo)LOC7487408 (ppo)LOC7498016 (ppo)LOC7498017 (ppo)LOC7498018 (ppo)LOC11405673 (mtr)LOC11406189 (mtr)LOC11408358 (mtr)LOC11409009 (mtr)LOC11409250 (mtr)LOC11409504 (mtr)LOC11409765 (mtr)LOC11410509 (mtr)LOC11410704 (mtr)LOC11410782 (mtr)LOC11410784 (mtr)LOC11413339 (mtr)LOC11418386 (mtr)LOC11418387 (mtr)LOC11419853 (mtr)LOC11421214 (mtr)LOC11424282 (mtr)LOC11429536 (mtr)LOC11429538 (mtr)LOC11431109 (mtr)LOC11434481 (mtr)LOC11434538 (mtr)LOC11434967 (mtr)LOC11438884 (mtr)LOC18101595 (ppo)LOC18102482 (ppo)LOC18106584 (ppo)LOC18106587 (ppo)LOC25479840 (mtr)LOC25483008 (mtr)LOC25484298 (mtr)LOC25493597 (mtr)LOC25494048 (mtr)LOC25497878 (mtr)LOC25498293 (mtr)LOC25498303 (mtr)LOC25500056 (mtr)LOC25500804 (mtr)ODD (sly)LOC100777564 (gma)LOC100778953 (gma)LOC100781078 (gma)LOC100781624 (gma)LOC100785833 (gma)LOC100786255 (gma)LOC100787331 (gma)LOC100789941 (gma)LOC100790198 (gma)LOC100792296 (gma)LOC100792753 (gma)LOC100806682 (gma)LOC100809768 (gma)LOC100815823 (gma)LOC100815890 (gma)LOC101244528 (sly)LOC101245098 (sly)LOC101245399 (sly)LOC101245697 (sly)LOC101245991 (sly)LOC101246865 (sly)LOC101247162 (sly)LOC101248415 (sly)LOC101249199 (sly)LOC101249481 (sly)LOC101250009 (sly)LOC101250295 (sly)LOC101259580 (sly)LOC101259885 (sly)LOC101260178 (sly)ACO3 (sly)LOC102659434 (gma)LOC102659833 (gma)LOC102667868 (gma)LOC102668613 (gma)LOC102669426 (gma)LOC103836579 (bra)LOC103841969 (bra)LOC103843501 (bra)LOC103843502 (bra)LOC103843543 (bra)LOC103843658 (bra)LOC103844023 (bra)LOC103844024 (bra)LOC103844025 (bra)LOC103844262 (bra)LOC103844264 (bra)LOC103844266 (bra)LOC103844507 (bra)LOC103844509 (bra)LOC103856626 (bra)LOC103856627 (bra)LOC103856628 (bra)LOC103856629 (bra)GSL-OH (bra)LOC103865075 (bra)LOC103865076 (bra)LOC103865077 (bra)LOC103865078 (bra)LOC103865081 (bra)LOC103869588 (bra)LOC106798825 (gma)LOC117125692 (bra)LOC117128368 (bra)LOC123040041 (tae)LOC123040049 (tae)LOC123043181 (tae)LOC123048248 (tae)LOC123048250 (tae)LOC123048251 (tae)LOC123051068 (tae)LOC123051075 (tae)LOC123058656 (tae)LOC123072301 (tae)LOC123074846 (tae)LOC123076530 (tae)LOC123088671 (tae)LOC123111152 (tae)LOC123176144 (tae)LOC123180396 (tae)LOC123184283 (tae)LOC123184284 (tae)LOC123184287 (tae)LOC123184291 (tae)LOC123186187 (tae)LOC123186994 (tae)LOC123187000 (tae)LOC123190830 (tae)LOC123407181 (hvu)LOC123408335 (hvu)LOC123424365 (hvu)LOC123424367 (hvu)LOC123424865 (hvu)LOC123429116 (hvu)LOC123429118 (hvu)LOC123440337 (hvu)
Subcellular
localization
wolf
cyto 8,  nucl 1,  plas 1,  golg 1,  nucl_plas 1,  golg_plas 1  (predict for NP_180115.1)
Subcellular
localization
TargetP
other 8  (predict for NP_180115.1)
Gene coexpression
Network*for
coexpressed
genes
LCNloc
[Cytoscape]
KEGG* ID Title #genes Link to the KEGG* map
(Multiple genes)
ath00966 Glucosinolate biosynthesis 6
ath01210 2-Oxocarboxylic acid metabolism 6
ath00290 Valine, leucine and isoleucine biosynthesis 2
Genes directly connected with AT2G25450 on the network
coex z* Locus Function* CoexViewer Entrez Gene ID*
4.2 SFP1 Major facilitator superfamily protein [detail] 832794
4.1 MAM1 methylthioalkylmalate synthase 1 [detail] 832365
4.1 AT1G53560 Ribosomal protein L18ae family [detail] 841791
Coexpressed
gene list
[Coexpressed gene list for AT2G25450]
Gene expression
All samples [Expression pattern for all samples]
AtGenExpress*
(Development)
265615_at
265615_at.png

X axis is samples (pdf file), and Y axis is log2-expression.
"1st Q", "mean" and "3rd Q" indecate the values for all genes on a GeneChip. Q: quartile.

AtGenExpress*
(Stress)
265615_at
265615_at.png

X axis is samples (pdf file), and Y axis is log2-expression.

AtGenExpress*
(Hormone)
265615_at
265615_at.png

X axis is samples (xls file), and Y axis is log-expression.

Link to other DBs
Entrez Gene ID 817083    
Refseq ID (protein) NP_180115.1 


The preparation time of this page was 0.3 [sec].