[][] ath   AT2G29550 Gene
functional annotation
Function   tubulin beta-7 chain
GO BP
GO:0000226 [list] [network] microtubule cytoskeleton organization  (134 genes)  IBA  
GO:0007017 [list] [network] microtubule-based process  (183 genes)  IBA ISS  
GO:0000278 [list] [network] mitotic cell cycle  (198 genes)  IBA  
GO:0046686 [list] [network] response to cadmium ion  (346 genes)  IEP  
GO CC
GO:0045298 [list] [network] tubulin complex  (13 genes)  ISS  
GO:0005874 [list] [network] microtubule  (186 genes)  IBA  
GO:0005777 [list] [network] peroxisome  (325 genes)  HDA  
GO:0005618 [list] [network] cell wall  (685 genes)  IDA  
GO:0009506 [list] [network] plasmodesma  (962 genes)  IDA  
GO:0005773 [list] [network] vacuole  (1133 genes)  IDA  
GO:0005794 [list] [network] Golgi apparatus  (1430 genes)  IDA  
GO:0005829 [list] [network] cytosol  (3506 genes)  HDA IDA  
GO:0005886 [list] [network] plasma membrane  (3771 genes)  IDA  
GO:0005737 [list] [network] cytoplasm  (14855 genes)  IBA ISM  
GO MF
GO:0005200 [list] [network] structural constituent of cytoskeleton  (30 genes)  IBA ISS  
GO:0003924 [list] [network] GTPase activity  (169 genes)  IEA  
GO:0005525 [list] [network] GTP binding  (248 genes)  IBA  
KEGG ath04145 [list] [network] Phagosome (82 genes)
Protein NP_180515.1 
BLAST NP_180515.1 
Orthologous [Ortholog page] LOC542239 (zma)LOC542380 (zma)LOC542416 (zma)LOC542417 (zma)LOC542418 (zma)LOC542705 (zma)TUBB3 (gma)TUBB (gma)TUB (sly)TUB9 (ath)TUB6 (ath)TUB8 (ath)TUB4 (ath)TUB2 (ath)TUB3 (ath)TUB5 (ath)TUB1 (ath)LOC4326917 (osa)LOC4327550 (osa)LOC4328420 (osa)LOC4331315 (osa)LOC4333632 (osa)LOC4334309 (osa)LOC4338790 (osa)LOC4341810 (osa)LOC7464075 (ppo)LOC7465852 (ppo)LOC7465861 (ppo)LOC7471684 (ppo)LOC7472769 (ppo)LOC7477677 (ppo)LOC7479116 (ppo)LOC7479658 (ppo)LOC7481503 (ppo)LOC7486729 (ppo)LOC11414871 (mtr)LOC11415767 (mtr)LOC11422693 (mtr)LOC11425110 (mtr)LOC11437601 (mtr)LOC11438618 (mtr)LOC11439086 (mtr)LOC11442516 (mtr)LOC25491473 (mtr)LOC25493371 (mtr)LOC100244399 (vvi)LOC100244729 (vvi)LOC100247828 (vvi)LOC100258042 (vvi)LOC100259087 (vvi)LOC100259401 (vvi)LOC100259534 (vvi)LOC100260443 (vvi)LOC100261736 (vvi)LOC100265052 (vvi)LOC100272336 (zma)LOC100273658 (zma)LOC100382290 (zma)LOC100383576 (zma)LOC100502086 (zma)TUBB1 (gma)LOC100781043 (gma)LOC100781525 (gma)LOC100784236 (gma)LOC100788253 (gma)LOC100793406 (gma)LOC100797652 (gma)LOC100797894 (gma)LOC100798849 (gma)LOC100801608 (gma)TUBB2 (gma)LOC100816898 (gma)LOC100818878 (gma)LOC100819408 (gma)LOC100819883 (gma)LOC101246411 (sly)LOC101248630 (sly)LOC101248956 (sly)LOC101251552 (sly)LOC101252240 (sly)LOC101253952 (sly)LOC101262621 (sly)LOC101262728 (sly)LOC101265829 (sly)LOC103625832 (zma)LOC103629648 (zma)LOC103827910 (bra)LOC103832026 (bra)LOC103834176 (bra)LOC103839187 (bra)LOC103846653 (bra)LOC103848440 (bra)LOC103858467 (bra)LOC103861207 (bra)LOC103864974 (bra)LOC103867806 (bra)LOC103868027 (bra)LOC103873285 (bra)LOC103873591 (bra)LOC103873913 (bra)LOC103874246 (bra)LOC103874709 (bra)
Subcellular
localization
wolf
nucl 5,  cyto 4,  vacu 1,  cysk 1  (predict for NP_180515.1)
Subcellular
localization
TargetP
other 8  (predict for NP_180515.1)
Gene coexpression
Network*for
coexpressed
genes
LCNloc
[Cytoscape]
KEGG* ID Title #genes Link to the KEGG* map
(Multiple genes)
ath04145 Phagosome 11
Genes directly connected with TUB7 on the network
coex z* Locus Function* Coexpression
detail
Entrez Gene ID*
8.1 TUA2 tubulin alpha-2 chain [detail] 841425
7.6 TUA4 tubulin alpha-4 chain [detail] 839405
6.9 TUA5 tubulin alpha-5 [detail] 832098
5.3 AT1G35780 N-lysine methyltransferase [detail] 840483
Coexpressed
gene list
[Coexpressed gene list for TUB7]
Gene expression
All samples [Expression pattern for all samples]
AtGenExpress*
(Development)
266295_at
266295_at.png

X axis is samples (pdf file), and Y axis is log2-expression.
"1st Q", "mean" and "3rd Q" indecate the values for all genes on a GeneChip. Q: quartile.

AtGenExpress*
(Stress)
266295_at
266295_at.png

X axis is samples (pdf file), and Y axis is log2-expression.

AtGenExpress*
(Hormone)
266295_at
266295_at.png

X axis is samples (xls file), and Y axis is log-expression.

Link to other DBs
Entrez Gene ID 817504    
Refseq ID (protein) NP_180515.1 


The preparation time of this page was 0.3 [sec].