[][] ath   At2g29550 Gene
functional annotation
Function   tubulin beta-7 chain Plant GARDENPlant GARDEN JBrowse
GO BP
GO:0007017 [list] [network] microtubule-based process  (134 genes)  ISS  
GO CC
GO:0045298 [list] [network] tubulin complex  (13 genes)  ISS  
GO:0005777 [list] [network] peroxisome  (311 genes)  HDA  
GO:0009505 [list] [network] plant-type cell wall  (498 genes)  HDA  
GO:0009506 [list] [network] plasmodesma  (871 genes)  HDA  
GO:0005773 [list] [network] vacuole  (971 genes)  HDA  
GO:0005794 [list] [network] Golgi apparatus  (1182 genes)  HDA  
GO:0005886 [list] [network] plasma membrane  (2529 genes)  HDA  
GO:0005829 [list] [network] cytosol  (2559 genes)  HDA  
GO:0005737 [list] [network] cytoplasm  (13880 genes)  ISM  
GO MF
GO:0005200 [list] [network] structural constituent of cytoskeleton  (24 genes)  ISS  
GO:0003729 [list] [network] mRNA binding  (1535 genes)  IDA  
KEGG ath04145 [list] [network] Phagosome (83 genes)
Protein NP_180515.1 
BLAST NP_180515.1 
Orthologous [Ortholog page] LOC543257 (tae)LOC543258 (tae)LOC543260 (tae)LOC543261 (tae)LOC543262 (tae)LOC543473 (tae)TUBB3 (gma)TUBB (gma)TUB (sly)TUB9 (ath)TUB6 (ath)TUB8 (ath)TUB4 (ath)TUB2 (ath)TUB3 (ath)TUB5 (ath)TUB1 (ath)LOC4326917 (osa)LOC4327550 (osa)LOC4328420 (osa)LOC4331315 (osa)LOC4333632 (osa)LOC4334309 (osa)LOC4338790 (osa)LOC4341810 (osa)LOC7454884 (ppo)LOC7462497 (ppo)LOC7464075 (ppo)LOC7465852 (ppo)LOC7465861 (ppo)LOC7468015 (ppo)LOC7471684 (ppo)LOC7472769 (ppo)LOC7477677 (ppo)LOC7478050 (ppo)LOC7479116 (ppo)LOC7479658 (ppo)LOC7480106 (ppo)LOC7481503 (ppo)LOC7486729 (ppo)LOC7487287 (ppo)LOC7487442 (ppo)LOC11414871 (mtr)LOC11415767 (mtr)LOC11422693 (mtr)LOC11425110 (mtr)LOC11437601 (mtr)LOC11438618 (mtr)LOC11439086 (mtr)LOC11442516 (mtr)LOC18095120 (ppo)LOC18103507 (ppo)LOC18108966 (ppo)LOC25491473 (mtr)LOC25493371 (mtr)TUBB1 (gma)LOC100781043 (gma)LOC100781525 (gma)LOC100784236 (gma)LOC100788253 (gma)LOC100793406 (gma)LOC100797652 (gma)LOC100797894 (gma)LOC100798849 (gma)LOC100801608 (gma)LOC100801893 (gma)TUBB2 (gma)LOC100816898 (gma)LOC100818878 (gma)LOC100819408 (gma)LOC100819883 (gma)LOC101246411 (sly)LOC101248630 (sly)LOC101248956 (sly)LOC101251552 (sly)LOC101252240 (sly)LOC101253952 (sly)LOC101262621 (sly)LOC101262728 (sly)LOC101265829 (sly)LOC103827910 (bra)LOC103832026 (bra)LOC103834176 (bra)LOC103839187 (bra)LOC103846653 (bra)LOC103848440 (bra)LOC103858467 (bra)LOC103861207 (bra)LOC103864974 (bra)LOC103867806 (bra)LOC103868027 (bra)LOC103873285 (bra)LOC103873591 (bra)LOC103873913 (bra)LOC103874246 (bra)LOC103874709 (bra)LOC112324443 (ppo)LOC121173566 (gma)LOC123038379 (tae)LOC123055669 (tae)LOC123062345 (tae)LOC123071115 (tae)LOC123087340 (tae)LOC123093905 (tae)LOC123095632 (tae)LOC123099112 (tae)LOC123102397 (tae)LOC123105255 (tae)LOC123105434 (tae)LOC123106070 (tae)LOC123113513 (tae)LOC123132419 (tae)LOC123132824 (tae)LOC123136498 (tae)LOC123137750 (tae)LOC123149111 (tae)LOC123156491 (tae)LOC123168888 (tae)LOC123182447 (tae)LOC123405951 (hvu)LOC123408330 (hvu)LOC123413646 (hvu)LOC123442982 (hvu)LOC123444074 (hvu)LOC123444643 (hvu)LOC123446959 (hvu)LOC123449966 (hvu)LOC123452511 (hvu)
Subcellular
localization
wolf
nucl 5,  cyto 4,  vacu 1,  cysk 1  (predict for NP_180515.1)
Subcellular
localization
TargetP
other 8  (predict for NP_180515.1)
Gene coexpression
Network*for
coexpressed
genes
LCNloc
[Cytoscape]
KEGG* ID Title #genes Link to the KEGG* map
(Multiple genes)
ath04145 Phagosome 10
Genes directly connected with TUB7 on the network
coex z* Locus Function* CoexViewer Entrez Gene ID*
8.0 TUA2 tubulin alpha-2 chain [detail] 841425
7.6 TUA4 tubulin alpha-4 chain [detail] 839405
6.9 TUA5 tubulin alpha-5 [detail] 832098
5.4 AT1G35780 N-lysine methyltransferase [detail] 840483
Coexpressed
gene list
[Coexpressed gene list for TUB7]
Gene expression
All samples [Expression pattern for all samples]
AtGenExpress*
(Development)
266295_at
266295_at.png

X axis is samples (pdf file), and Y axis is log2-expression.
"1st Q", "mean" and "3rd Q" indecate the values for all genes on a GeneChip. Q: quartile.

AtGenExpress*
(Stress)
266295_at
266295_at.png

X axis is samples (pdf file), and Y axis is log2-expression.

AtGenExpress*
(Hormone)
266295_at
266295_at.png

X axis is samples (xls file), and Y axis is log-expression.

Link to other DBs
Entrez Gene ID 817504    
Refseq ID (protein) NP_180515.1 


The preparation time of this page was 0.2 [sec].