[][] ath   At3g21340 Gene
functional annotation
Function   Leucine-rich repeat protein kinase family protein Plant GARDENPlant GARDEN JBrowse
GO BP
GO:0048765 [list] [network] root hair cell differentiation  (143 genes)  IEA  
GO:0048588 [list] [network] developmental cell growth  (251 genes)  IEA  
GO:0009826 [list] [network] unidimensional cell growth  (356 genes)  IEA  
GO:0010015 [list] [network] root morphogenesis  (669 genes)  IEA  
GO:0016310 [list] [network] phosphorylation  (785 genes)  ISS  
GO:0048589 [list] [network] developmental growth  (1060 genes)  IEA  
GO:0009888 [list] [network] tissue development  (1806 genes)  IEA  
GO CC
GO:0005576 [list] [network] extracellular region  (3154 genes)  ISM  
GO MF
GO:0004714 [list] [network] transmembrane receptor protein tyrosine kinase activity  (42 genes)  IEA  
GO:0004713 [list] [network] protein tyrosine kinase activity  (58 genes)  IEA  
GO:0004674 [list] [network] protein serine/threonine kinase activity  (454 genes)  IEA  
GO:0016301 [list] [network] kinase activity  (1068 genes)  ISS  
GO:0005515 [list] [network] protein binding  (5066 genes)  IPI  
KEGG
Protein NP_001325421.1  NP_188771.2 
BLAST NP_001325421.1  NP_188771.2 
Orthologous [Ortholog page] AT2G04300 (ath)AT2G14440 (ath)AT2G14510 (ath)FRK1 (ath)AT2G19210 (ath)AT2G19230 (ath)AT2G28960 (ath)AT2G28970 (ath)AT2G28990 (ath)AT2G29000 (ath)MEE39 (ath)AT3G46340 (ath)AT3G46370 (ath)AT3G46400 (ath)AT3G46420 (ath)AT4G20450 (ath)RHS16 (ath)AT4G29450 (ath)AT4G29990 (ath)AT5G16900 (ath)AT5G59650 (ath)AT5G59670 (ath)AT5G59680 (ath)AT1G05700 (ath)AT1G07550 (ath)AT1G07560 (ath)AT1G49100 (ath)AT1G51790 (ath)IOS1 (ath)AT1G51805 (ath)AT1G51810 (ath)AT1G51820 (ath)AT1G51830 (ath)AT1G51850 (ath)AT1G51860 (ath)AT1G51870 (ath)RHS6 (ath)AT1G51890 (ath)AT1G51910 (ath)LOC4328315 (osa)LOC4338207 (osa)LOC4339370 (osa)LOC4339371 (osa)LOC4339374 (osa)LOC4339376 (osa)LOC4339378 (osa)LOC4346819 (osa)LOC4346820 (osa)LOC4346821 (osa)LOC4346822 (osa)LOC4346823 (osa)LOC4346825 (osa)LOC4346833 (osa)LOC4346837 (osa)LOC4346841 (osa)LOC7494617 (ppo)LOC9266163 (osa)LOC9267814 (osa)LOC9267979 (osa)LOC9272354 (osa)LOC11421236 (mtr)LOC11422007 (mtr)LOC11425516 (mtr)LOC11429446 (mtr)LOC11433438 (mtr)LOC11434037 (mtr)LOC11437028 (mtr)LOC18108501 (ppo)LOC18108503 (ppo)LOC18108531 (ppo)LOC18110286 (ppo)LOC18110288 (ppo)LOC18110448 (ppo)LOC18110542 (ppo)LOC18110545 (ppo)LOC18110550 (ppo)LOC25497008 (mtr)LOC25500355 (mtr)LOC25500358 (mtr)LOC25500359 (mtr)LOC25500361 (mtr)LOC25500364 (mtr)LOC25500366 (mtr)LOC25500367 (mtr)LOC25500376 (mtr)LOC25500764 (mtr)LOC25502465 (mtr)SIK2 (gma)LOC100775741 (gma)LOC100776284 (gma)LOC100776818 (gma)LOC100778537 (gma)LOC100779102 (gma)LOC100779474 (gma)LOC100779617 (gma)LOC100781084 (gma)LOC100781785 (gma)LOC100785345 (gma)LOC100791717 (gma)LOC100792239 (gma)LOC100793137 (gma)LOC100794504 (gma)LOC100795183 (gma)LOC100818475 (gma)LOC101257947 (sly)LOC101262429 (sly)LOC101266705 (sly)LOC102662730 (gma)LOC102663143 (gma)LOC103829493 (bra)LOC103829497 (bra)LOC103836435 (bra)LOC103843445 (bra)LOC103844100 (bra)LOC103845385 (bra)LOC103850089 (bra)LOC103851563 (bra)LOC103851564 (bra)LOC103851565 (bra)LOC103851763 (bra)LOC103853036 (bra)LOC103853548 (bra)LOC103856616 (bra)LOC103859903 (bra)LOC103861877 (bra)LOC103864933 (bra)LOC103864934 (bra)LOC103868533 (bra)LOC103868536 (bra)LOC103868540 (bra)LOC103868542 (bra)LOC103868543 (bra)LOC103868545 (bra)LOC103868632 (bra)LOC103869180 (bra)LOC103871250 (bra)LOC103871251 (bra)LOC103871253 (bra)LOC103871255 (bra)LOC103873634 (bra)LOC106794186 (gma)LOC106799536 (gma)LOC107275782 (osa)LOC107276230 (osa)LOC107276752 (osa)LOC107278492 (osa)LOC107278845 (osa)LOC112325225 (ppo)LOC112416101 (mtr)LOC112417465 (mtr)LOC112936039 (osa)LOC117125683 (bra)LOC120575758 (mtr)LOC123043522 (tae)LOC123044006 (tae)LOC123044087 (tae)LOC123044243 (tae)LOC123054720 (tae)LOC123063692 (tae)LOC123067573 (tae)LOC123079142 (tae)LOC123080188 (tae)LOC123080196 (tae)LOC123080205 (tae)LOC123080238 (tae)LOC123083057 (tae)LOC123084992 (tae)LOC123085003 (tae)LOC123086249 (tae)LOC123094168 (tae)LOC123094169 (tae)LOC123096526 (tae)LOC123096537 (tae)LOC123096545 (tae)LOC123096554 (tae)LOC123096599 (tae)LOC123096617 (tae)LOC123096813 (tae)LOC123097489 (tae)LOC123103544 (tae)LOC123106972 (tae)LOC123114350 (tae)LOC123114773 (tae)LOC123116086 (tae)LOC123120524 (tae)LOC123124720 (tae)LOC123126207 (tae)LOC123132270 (tae)LOC123132271 (tae)LOC123132273 (tae)LOC123136316 (tae)LOC123136318 (tae)LOC123136319 (tae)LOC123138953 (tae)LOC123140966 (tae)LOC123143830 (tae)LOC123143832 (tae)LOC123143833 (tae)LOC123143893 (tae)LOC123157067 (tae)LOC123160036 (tae)LOC123160179 (tae)LOC123160205 (tae)LOC123160231 (tae)LOC123162979 (tae)LOC123162990 (tae)LOC123173379 (tae)LOC123173395 (tae)LOC123173449 (tae)LOC123179719 (tae)LOC123179738 (tae)LOC123179780 (tae)LOC123180475 (tae)LOC123182688 (tae)LOC123182689 (tae)LOC123395140 (hvu)LOC123398290 (hvu)LOC123401280 (hvu)LOC123401354 (hvu)LOC123401635 (hvu)LOC123404089 (hvu)LOC123404264 (hvu)LOC123404421 (hvu)LOC123404434 (hvu)LOC123404717 (hvu)LOC123408210 (hvu)LOC123416831 (hvu)LOC123416847 (hvu)LOC123416895 (hvu)LOC123440187 (hvu)LOC123442690 (hvu)LOC123448982 (hvu)LOC123450805 (hvu)LOC123450806 (hvu)
Subcellular
localization
wolf
plas 6,  golg_plas 4,  golg 1  (predict for NP_001325421.1)
plas 7,  golg_plas 4,  golg 1  (predict for NP_188771.2)
Subcellular
localization
TargetP
scret 9  (predict for NP_001325421.1)
scret 9  (predict for NP_188771.2)
Gene coexpression
Network*for
coexpressed
genes
LCNloc
[Cytoscape]
Genes directly connected with AT3G21340 on the network
coex z* Locus Function* CoexViewer Entrez Gene ID*
7.5 ATCSLB05 Cellulose synthase family protein [detail] 827195
7.5 SHV2 COBRA-like extracellular glycosyl-phosphatidyl inositol-anchored protein family [detail] 834987
7.4 RHS8 root hair specific 8 [detail] 842651
7.1 AT2G19060 SGNH hydrolase-type esterase superfamily protein [detail] 816423
6.3 GSTU28 glutathione S-transferase TAU 28 [detail] 841805
5.9 AT2G04680 Cysteine/Histidine-rich C1 domain family protein [detail] 815011
Coexpressed
gene list
[Coexpressed gene list for AT3G21340]
Gene expression
All samples [Expression pattern for all samples]
AtGenExpress*
(Development)
256811_at
256811_at.png

X axis is samples (pdf file), and Y axis is log2-expression.
"1st Q", "mean" and "3rd Q" indecate the values for all genes on a GeneChip. Q: quartile.

AtGenExpress*
(Stress)
256811_at
256811_at.png

X axis is samples (pdf file), and Y axis is log2-expression.

AtGenExpress*
(Hormone)
256811_at
256811_at.png

X axis is samples (xls file), and Y axis is log-expression.

Link to other DBs
Entrez Gene ID 821688    
Refseq ID (protein) NP_001325421.1 
NP_188771.2 


The preparation time of this page was 0.2 [sec].