[←][→] ath   At3g23880 Gene
functional annotation
Function   F-box and associated interaction domains-containing protein      
GO BP
GO:0010114 [list] [network] response to red light  (101 genes)  IEA  
GO:0065003 [list] [network] protein-containing complex assembly  (393 genes)  IEA  
GO:0006996 [list] [network] organelle organization  (1102 genes)  IEA  
GO CC
GO:0005634 [list] [network] nucleus  (10305 genes)  HDA  
GO MF
KEGG
Protein NP_189030.1 
BLAST NP_189030.1 
Orthologous [Ortholog page] AT3G06240 (ath)  AT3G07870 (ath)  CPR1 (ath)  AT4G22390 (ath)  LOC7454236 (ppo)  LOC7455824 (ppo)  LOC7455826 (ppo)  LOC7455978 (ppo)  LOC7458266 (ppo)  LOC7458504 (ppo)  LOC7458730 (ppo)  LOC7460830 (ppo)  LOC7461646 (ppo)  LOC7461647 (ppo)  LOC7463674 (ppo)  LOC7463677 (ppo)  LOC7463678 (ppo)  LOC7464263 (ppo)  LOC7464265 (ppo)  LOC7464547 (ppo)  LOC7475192 (ppo)  LOC7476810 (ppo)  LOC7480064 (ppo)  LOC7489581 (ppo)  LOC7497785 (ppo)  LOC7497786 (ppo)  LOC11405177 (mtr)  LOC11405417 (mtr)  LOC11405811 (mtr)  LOC11406078 (mtr)  LOC11406617 (mtr)  LOC11406845 (mtr)  LOC11406951 (mtr)  LOC11407622 (mtr)  LOC11407686 (mtr)  LOC11407861 (mtr)  LOC11408490 (mtr)  LOC11408531 (mtr)  LOC11408532 (mtr)  LOC11409098 (mtr)  LOC11410563 (mtr)  LOC11410567 (mtr)  LOC11411053 (mtr)  LOC11411103 (mtr)  LOC11411209 (mtr)  LOC11411848 (mtr)  LOC11412107 (mtr)  LOC11412108 (mtr)  LOC11412119 (mtr)  LOC11412627 (mtr)  LOC11412980 (mtr)  LOC11413003 (mtr)  LOC11413093 (mtr)  LOC11414155 (mtr)  LOC11414181 (mtr)  LOC11415252 (mtr)  LOC11415262 (mtr)  LOC11415673 (mtr)  LOC11416279 (mtr)  LOC11416483 (mtr)  LOC11416669 (mtr)  LOC11416862 (mtr)  LOC11416944 (mtr)  LOC11417756 (mtr)  LOC11418374 (mtr)  LOC11418934 (mtr)  LOC11419443 (mtr)  LOC11419639 (mtr)  LOC11419741 (mtr)  LOC11420342 (mtr)  LOC11421259 (mtr)  LOC11421758 (mtr)  LOC11422914 (mtr)  LOC11423003 (mtr)  LOC11423032 (mtr)  LOC11423054 (mtr)  LOC11425099 (mtr)  LOC11427256 (mtr)  LOC11428382 (mtr)  LOC11428637 (mtr)  LOC11428893 (mtr)  LOC11429132 (mtr)  LOC11429486 (mtr)  LOC11430309 (mtr)  LOC11430448 (mtr)  LOC11431080 (mtr)  LOC11431144 (mtr)  LOC11432304 (mtr)  LOC11432657 (mtr)  LOC11433981 (mtr)  LOC11436870 (mtr)  LOC11437896 (mtr)  LOC11438079 (mtr)  LOC11438707 (mtr)  LOC11438825 (mtr)  LOC11438946 (mtr)  LOC11439269 (mtr)  LOC11439357 (mtr)  LOC11439359 (mtr)  LOC11439980 (mtr)  LOC11441329 (mtr)  LOC11441393 (mtr)  LOC11444158 (mtr)  LOC11445137 (mtr)  LOC11446062 (mtr)  LOC11446126 (mtr)  LOC11446728 (mtr)  LOC18094050 (ppo)  LOC18097312 (ppo)  LOC18099747 (ppo)  LOC18107086 (ppo)  LOC18107094 (ppo)  LOC18109128 (ppo)  LOC25479946 (mtr)  LOC25481320 (mtr)  LOC25483574 (mtr)  LOC25483595 (mtr)  LOC25483635 (mtr)  LOC25483636 (mtr)  LOC25483642 (mtr)  LOC25483646 (mtr)  LOC25483667 (mtr)  LOC25483749 (mtr)  LOC25483763 (mtr)  LOC25484109 (mtr)  LOC25484111 (mtr)  LOC25484113 (mtr)  LOC25485021 (mtr)  LOC25485032 (mtr)  LOC25485037 (mtr)  LOC25485678 (mtr)  LOC25486061 (mtr)  LOC25486218 (mtr)  LOC25486323 (mtr)  LOC25486326 (mtr)  LOC25486327 (mtr)  LOC25486329 (mtr)  LOC25486647 (mtr)  LOC25486653 (mtr)  LOC25487314 (mtr)  LOC25487316 (mtr)  LOC25488032 (mtr)  LOC25488035 (mtr)  LOC25488037 (mtr)  LOC25488040 (mtr)  LOC25488462 (mtr)  LOC25488464 (mtr)  LOC25488466 (mtr)  LOC25488468 (mtr)  LOC25488478 (mtr)  LOC25488493 (mtr)  LOC25488499 (mtr)  LOC25488500 (mtr)  LOC25488677 (mtr)  LOC25488678 (mtr)  LOC25488683 (mtr)  LOC25488685 (mtr)  LOC25488686 (mtr)  LOC25488799 (mtr)  LOC25489955 (mtr)  LOC25490440 (mtr)  LOC25491586 (mtr)  LOC25493319 (mtr)  LOC25493863 (mtr)  LOC25493864 (mtr)  LOC25494038 (mtr)  LOC25494041 (mtr)  LOC25494042 (mtr)  LOC25494046 (mtr)  LOC25494834 (mtr)  LOC25495094 (mtr)  LOC25495126 (mtr)  LOC25495846 (mtr)  LOC25496601 (mtr)  LOC25497164 (mtr)  LOC25499823 (mtr)  LOC25501098 (mtr)  LOC25502184 (mtr)  LOC100779800 (gma)  LOC100780337 (gma)  LOC100789250 (gma)  LOC100789763 (gma)  LOC100789783 (gma)  LOC100790318 (gma)  LOC100791213 (gma)  LOC100791592 (gma)  LOC100796474 (gma)  LOC100802666 (gma)  LOC100803782 (gma)  LOC100806184 (gma)  LOC100809732 (gma)  LOC100812846 (gma)  LOC100813865 (gma)  LOC100815072 (gma)  LOC100815838 (gma)  LOC101243828 (sly)  LOC101244418 (sly)  LOC101245543 (sly)  LOC101247692 (sly)  LOC101247840 (sly)  LOC101248384 (sly)  LOC101249470 (sly)  LOC101249809 (sly)  LOC101250249 (sly)  LOC101250251 (sly)  LOC101250624 (sly)  LOC101251755 (sly)  LOC101254326 (sly)  LOC101256035 (sly)  LOC101257310 (sly)  LOC101257413 (sly)  LOC101257551 (sly)  LOC101258441 (sly)  LOC101258489 (sly)  LOC101258560 (sly)  LOC101259155 (sly)  LOC101259440 (sly)  LOC101260048 (sly)  LOC101260412 (sly)  LOC101260766 (sly)  LOC101260891 (sly)  LOC101261186 (sly)  LOC101261582 (sly)  LOC101261682 (sly)  LOC101261724 (sly)  LOC101262635 (sly)  LOC101264858 (sly)  LOC101264871 (sly)  LOC101264878 (sly)  LOC101265476 (sly)  LOC101266763 (sly)  LOC101266889 (sly)  LOC101267558 (sly)  LOC102660222 (gma)  LOC102663590 (gma)  LOC102663618 (gma)  LOC102663745 (gma)  LOC102664265 (gma)  LOC102664521 (gma)  LOC102664615 (gma)  LOC102666059 (gma)  LOC102666783 (gma)  LOC102666785 (gma)  LOC102666879 (gma)  LOC102666966 (gma)  LOC102667625 (gma)  LOC102667753 (gma)  LOC102669359 (gma)  LOC102669490 (gma)  LOC102669851 (gma)  LOC102670327 (gma)  LOC102670340 (gma)  LOC102670462 (gma)  LOC103828697 (bra)  LOC103834250 (bra)  LOC103839935 (bra)  LOC103839944 (bra)  LOC103856148 (bra)  LOC103856149 (bra)  LOC103859144 (bra)  LOC103859247 (bra)  LOC103860146 (bra)  LOC103868146 (bra)  LOC104646335 (sly)  SLF5 (sly)  LOC104649068 (sly)  LOC106796262 (gma)  LOC106797043 (gma)  LOC106799253 (gma)  LOC108868761 (bra)  LOC112323254 (ppo)  LOC112324558 (ppo)  LOC112326458 (ppo)  LOC112327908 (ppo)  LOC112328859 (ppo)  LOC112419524 (mtr)  LOC112419868 (mtr)  LOC112940014 (sly)  LOC112940016 (sly)  LOC112940267 (sly)  LOC112940435 (sly)  LOC112940909 (sly)  LOC113001909 (gma)  LOC117132723 (bra)  LOC120575738 (mtr)  LOC120577556 (mtr)  LOC120579486 (mtr)  LOC120579523 (mtr)  LOC120579959 (mtr)  LOC120580159 (mtr)  LOC120580220 (mtr)  LOC120580669 (mtr)  LOC120580844 (mtr)  LOC120580950 (mtr)  LOC121173709 (gma)  LOC121173710 (gma)  LOC121173711 (gma)  LOC121173712 (gma) 
Subcellular
localization
wolf
cyto_nucl 4,  nucl 4,  cyto 4,  chlo 2  (predict for NP_189030.1)
Subcellular
localization
TargetP
other 8  (predict for NP_189030.1)
Gene coexpression
Network*for
coexpressed
genes
LCNloc
[Cytoscape]
KEGG* ID Title #genes Link to the KEGG* map
(Multiple genes)
ath04120 Ubiquitin mediated proteolysis 2
Genes directly connected with AT3G23880 on the network
coex z* Locus Function* CoexViewer Entrez Gene ID*
6.9 RMA2 RING membrane-anchor 2 [detail] 828942
6.0 AT5G18650 CHY-type/CTCHY-type/RING-type Zinc finger protein [detail] 831983
5.6 OXS3 oxidative stress 3 [detail] 835756
Coexpressed
gene list		 [Coexpressed gene list for AT3G23880]
Gene expression
All samples [Expression pattern for all samples]
AtGenExpress*
(Development)
256914_at
256914_at.png

X axis is samples (pdf file), and Y axis is log2-expression.
"1st Q", "mean" and "3rd Q" indecate the values for all genes on a GeneChip. Q: quartile.

AtGenExpress*
(Stress)
256914_at
256914_at.png

X axis is samples (pdf file), and Y axis is log2-expression.
AtGenExpress*
(Hormone)
256914_at
256914_at.png

X axis is samples (xls file), and Y axis is log-expression.
Link to other DBs
Entrez Gene ID 821971      
Refseq ID (protein) NP_189030.1 


The preparation time of this page was 0.1 [sec].