[][] ath   At3g45980 Gene
functional annotation
Function   Histone superfamily protein Plant GARDENPlant GARDEN JBrowse
GO BP
GO CC
GO:0005730 [list] [network] nucleolus  (387 genes)  HDA  
GO:0009534 [list] [network] chloroplast thylakoid  (415 genes)  HDA  
GO:0009570 [list] [network] chloroplast stroma  (705 genes)  HDA  
GO:0005829 [list] [network] cytosol  (2559 genes)  HDA  
GO:0005634 [list] [network] nucleus  (10305 genes)  ISM  
GO MF
KEGG
Protein NP_190184.1 
BLAST NP_190184.1 
Orthologous [Ortholog page] LOC543183 (tae)LOC543184 (tae)H2B-1 (sly)H2B-2 (sly)AT2G28720 (ath)AT2G37470 (ath)AT3G09480 (ath)HTB11 (ath)AT5G02570 (ath)HTB2 (ath)HTB4 (ath)HTB1 (ath)AT1G08170 (ath)LOC4324495 (osa)LOC4324500 (osa)LOC4324502 (osa)LOC4324504 (osa)LOC4324510 (osa)LOC4324512 (osa)LOC4327384 (osa)LOC4339681 (osa)LOC4345904 (osa)LOC7463471 (ppo)LOC7468455 (ppo)LOC9268195 (osa)LOC11416780 (mtr)LOC11417139 (mtr)LOC11426605 (mtr)LOC11431194 (mtr)LOC11432921 (mtr)LOC11442767 (mtr)LOC18099399 (ppo)LOC18101340 (ppo)LOC18101345 (ppo)LOC18101997 (ppo)LOC25484839 (mtr)LOC25485824 (mtr)LOC25492478 (mtr)LOC25492530 (mtr)LOC25492533 (mtr)LOC25492556 (mtr)LOC25492748 (mtr)LOC25493050 (mtr)AT3G53650 (ath)LOC100305731 (gma)LOC100305866 (gma)LOC100499734 (gma)LOC100500314 (gma)LOC100789702 (gma)LOC100793796 (gma)LOC100805396 (gma)LOC100806140 (gma)LOC100817849 (gma)LOC100820177 (gma)LOC101244346 (sly)LOC101245134 (sly)LOC101252186 (sly)LOC101253792 (sly)H2B-3 (sly)LOC101261496 (sly)LOC101264987 (sly)LOC101267024 (sly)LOC103829764 (bra)LOC103829945 (bra)LOC103841289 (bra)LOC103845413 (bra)LOC103845511 (bra)LOC103851535 (bra)LOC103856534 (bra)LOC103856593 (bra)LOC103858282 (bra)LOC103863386 (bra)LOC103864913 (bra)LOC103871565 (bra)LOC103873395 (bra)LOC104648016 (sly)LOC111828532 (gma)LOC123058767 (tae)LOC123060157 (tae)LOC123062534 (tae)LOC123065905 (tae)LOC123065907 (tae)LOC123067631 (tae)LOC123071359 (tae)LOC123071360 (tae)LOC123074963 (tae)LOC123077165 (tae)LOC123079622 (tae)LOC123079691 (tae)LOC123079692 (tae)LOC123085475 (tae)LOC123090912 (tae)LOC123092567 (tae)LOC123097871 (tae)LOC123123408 (tae)LOC123130073 (tae)LOC123131716 (tae)LOC123131742 (tae)LOC123131994 (tae)LOC123135599 (tae)LOC123135602 (tae)LOC123136072 (tae)LOC123143166 (tae)LOC123143167 (tae)LOC123143170 (tae)LOC123145258 (tae)LOC123149322 (tae)LOC123161516 (tae)LOC123182269 (tae)LOC123403140 (hvu)LOC123403540 (hvu)LOC123405990 (hvu)LOC123406969 (hvu)LOC123409969 (hvu)LOC123409970 (hvu)LOC123409971 (hvu)LOC123410923 (hvu)LOC123426815 (hvu)LOC123435801 (hvu)LOC123435817 (hvu)LOC123439792 (hvu)LOC123440449 (hvu)LOC123440491 (hvu)LOC123440547 (hvu)LOC123442703 (hvu)LOC123442706 (hvu)LOC123443358 (hvu)LOC123443409 (hvu)LOC123444939 (hvu)LOC123445412 (hvu)LOC123447601 (hvu)LOC123449496 (hvu)LOC123449853 (hvu)LOC123451652 (hvu)LOC123452195 (hvu)
Subcellular
localization
wolf
nucl 10  (predict for NP_190184.1)
Subcellular
localization
TargetP
other 9  (predict for NP_190184.1)
Gene coexpression
Network*for
coexpressed
genes
LCNloc
[Cytoscape]
Genes directly connected with HTB9 on the network
coex z* Locus Function* CoexViewer Entrez Gene ID*
16.4 HTB11 Histone superfamily protein [detail] 823746
15.3 AT3G53730 Histone superfamily protein [detail] 824540
13.0 AT2G37470 Histone superfamily protein [detail] 818324
12.3 H2AXA Histone superfamily protein [detail] 837409
9.3 GAMMA-H2AX gamma histone [detail] 841910
Coexpressed
gene list
[Coexpressed gene list for HTB9]
Gene expression
All samples [Expression pattern for all samples]
AtGenExpress*
(Development)
252561_at
252561_at.png

X axis is samples (pdf file), and Y axis is log2-expression.
"1st Q", "mean" and "3rd Q" indecate the values for all genes on a GeneChip. Q: quartile.

AtGenExpress*
(Stress)
252561_at
252561_at.png

X axis is samples (pdf file), and Y axis is log2-expression.

AtGenExpress*
(Hormone)
252561_at
252561_at.png

X axis is samples (xls file), and Y axis is log-expression.

Link to other DBs
Entrez Gene ID 823741    
Refseq ID (protein) NP_190184.1 


The preparation time of this page was 0.1 [sec].