[←][→] ath   At4g18610 Gene
functional annotation
Function   LIGHT-DEPENDENT SHORT HYPOCOTYLS-like protein (DUF640)      
GO BP
GO:0009299 [list] [network] mRNA transcription  (13 genes)  ISS  
GO:0090698 [list] [network] post-embryonic plant morphogenesis  (221 genes)  ISS  
GO:1901565 [list] [network] organonitrogen compound catabolic process  (591 genes)  IEA  
GO CC
GO:0005634 [list] [network] nucleus  (10305 genes)  ISM ISS  
GO MF
KEGG
Protein NP_001319986.1 
BLAST NP_001319986.1 
Orthologous [Ortholog page] LSH3 (ath)  LSH10 (ath)  LSH2 (ath)  LSH4 (ath)  LSH1 (ath)  LSH6 (ath)  LSH8 (ath)  LSH7 (ath)  LOC4328416 (osa)  LOC4330024 (osa)  LOC4331099 (osa)  LOC4336401 (osa)  LOC4338491 (osa)  LOC4341811 (osa)  LOC7454352 (ppo)  LOC7455905 (ppo)  LOC7455945 (ppo)  LOC7458006 (ppo)  LOC7458242 (ppo)  LOC7460096 (ppo)  LOC7467540 (ppo)  LOC7470206 (ppo)  LOC7471962 (ppo)  LOC7474992 (ppo)  LOC7480386 (ppo)  LOC7487181 (ppo)  LOC7487704 (ppo)  LOC7489106 (ppo)  LOC7496798 (ppo)  LOC9266624 (osa)  LOC11407427 (mtr)  LOC11408401 (mtr)  LOC11408456 (mtr)  LOC11409774 (mtr)  LOC11410018 (mtr)  LOC11410358 (mtr)  LOC11419093 (mtr)  LOC11434608 (mtr)  LOC18095487 (ppo)  LOC18102467 (ppo)  LOC25484251 (mtr)  LOC25485780 (mtr)  LOC25485963 (mtr)  LOC25493337 (mtr)  LOC25499270 (mtr)  LOC25499718 (mtr)  LSH5 (ath)  LOC100306082 (gma)  LOC100306225 (gma)  LOC100527164 (gma)  LOC100527409 (gma)  LOC100527554 (gma)  LOC100775798 (gma)  LOC100775838 (gma)  LOC100778283 (gma)  LOC100778886 (gma)  LOC100780494 (gma)  LOC100786135 (gma)  LOC100789834 (gma)  LOC100791424 (gma)  LOC100802715 (gma)  LOC100802937 (gma)  LOC100803605 (gma)  LOC100803965 (gma)  LOC100806134 (gma)  LOC100806493 (gma)  LOC100806497 (gma)  LOC100810350 (gma)  LOC100810655 (gma)  LOC100815968 (gma)  TFAM1 (sly)  LOC101244207 (sly)  LOC101246185 (sly)  LOC101247206 (sly)  TFAM2 (sly)  LOC101252299 (sly)  LOC101253723 (sly)  LOC101256738 (sly)  LOC101260873 (sly)  LOC101261831 (sly)  LOC101262247 (sly)  LOC101263979 (sly)  LOC102663941 (gma)  LOC103828755 (bra)  LOC103832357 (bra)  LOC103837296 (bra)  LOC103843480 (bra)  LOC103843985 (bra)  LOC103845278 (bra)  LOC103845279 (bra)  LOC103848911 (bra)  LOC103850046 (bra)  LOC103851635 (bra)  LOC103853147 (bra)  LOC103853659 (bra)  LOC103854635 (bra)  LOC103858024 (bra)  LOC103859037 (bra)  LOC103861005 (bra)  LOC103865110 (bra)  LOC103865960 (bra)  LOC103866652 (bra)  LOC103867894 (bra)  LOC103867981 (bra)  LOC103874577 (bra)  LOC107276238 (osa)  LOC107278201 (osa)  LOC107278610 (osa)  LOC117125638 (bra)  LOC123041251 (tae)  LOC123045668 (tae)  LOC123046119 (tae)  LOC123049257 (tae)  LOC123052627 (tae)  LOC123053999 (tae)  LOC123058740 (tae)  LOC123074939 (tae)  LOC123127737 (tae)  LOC123128934 (tae)  LOC123136756 (tae)  LOC123137510 (tae)  LOC123144860 (tae)  LOC123146052 (tae)  LOC123149104 (tae)  LOC123159994 (tae)  LOC123166451 (tae)  LOC123181080 (tae)  LOC123181711 (tae)  LOC123185303 (tae)  LOC123189888 (tae)  LOC123402509 (hvu)  LOC123403258 (hvu)  LOC123409615 (hvu)  LOC123411667 (hvu)  LOC123412451 (hvu)  LOC123427243 (hvu)  LOC123430078 (hvu)  LOC123440575 (hvu)  LOC123444893 (hvu) 
Subcellular
localization
wolf
nucl 10  (predict for NP_001319986.1)
Subcellular
localization
TargetP
chlo 7,  other 6  (predict for NP_001319986.1)
Gene coexpression
Network*for
coexpressed
genes
LCNloc
[Cytoscape]
KEGG* ID Title #genes Link to the KEGG* map
(Multiple genes)
ath04075 Plant hormone signal transduction 2
Genes directly connected with LSH9 on the network
coex z* Locus Function* CoexViewer Entrez Gene ID*
5.4 RABA6a RAB GTPase homolog A6A [detail] 843698
4.8 ASL9 ASYMMETRIC LEAVES 2-like 9 [detail] 838223
4.8 LSH7 LIGHT-DEPENDENT SHORT HYPOCOTYLS-like protein (DUF640) [detail] 844218
4.5 AT1G22230 nucleolar GTP-binding protein [detail] 838828
Coexpressed
gene list		 [Coexpressed gene list for LSH9]
Gene expression
All samples [Expression pattern for all samples]
Link to other DBs
Entrez Gene ID 28720146      
Refseq ID (protein) NP_001319986.1 


The preparation time of this page was 0.1 [sec].