[←][→] ath   At4g20860 Gene
functional annotation
Function   FAD-binding Berberine family protein    Plant GARDEN Plant GARDEN JBrowse
GO BP
GO:0010729 [list] [network] positive regulation of hydrogen peroxide biosynthetic process  (3 genes)  IMP  
GO:0071456 [list] [network] cellular response to hypoxia  (241 genes)  HEP  
GO:0009753 [list] [network] response to jasmonic acid  (611 genes)  IEP  
GO CC
GO:0009505 [list] [network] plant-type cell wall  (498 genes)  IDA  
GO:0005737 [list] [network] cytoplasm  (13880 genes)  ISM  
GO MF
GO:0071949 [list] [network] FAD binding  (43 genes)  IEA  
KEGG
Protein NP_193818.1 
BLAST NP_193818.1 
Orthologous [Ortholog page] LOC732592 (gma)  LOC732593 (gma)  MEE23 (ath)  AT4G20800 (ath)  AT4G20820 (ath)  AT4G20830 (ath)  AT4G20840 (ath)  AT5G44360 (ath)  AT5G44380 (ath)  AT5G44390 (ath)  AT5G44400 (ath)  AT5G44410 (ath)  AT5G44440 (ath)  AT1G11770 (ath)  AT1G26380 (ath)  AT1G26390 (ath)  AT1G26400 (ath)  AT1G26410 (ath)  AT1G26420 (ath)  AT1G01980 (ath)  AT1G30700 (ath)  AT1G30710 (ath)  AT1G30760 (ath)  AT1G34575 (ath)  LOC4341253 (osa)  LOC4341254 (osa)  LOC4341257 (osa)  LOC4341259 (osa)  LOC4341261 (osa)  LOC7457662 (ppo)  LOC7471680 (ppo)  LOC7471681 (ppo)  LOC7480379 (ppo)  LOC7480381 (ppo)  LOC7480383 (ppo)  LOC7480394 (ppo)  LOC7480395 (ppo)  LOC7480398 (ppo)  LOC7480399 (ppo)  LOC7480401 (ppo)  LOC7480403 (ppo)  LOC7480406 (ppo)  LOC7480408 (ppo)  LOC7480409 (ppo)  LOC7480417 (ppo)  LOC7480418 (ppo)  LOC7484482 (ppo)  LOC7485160 (ppo)  LOC7485161 (ppo)  LOC7485205 (ppo)  LOC7489102 (ppo)  LOC7489103 (ppo)  LOC7489112 (ppo)  LOC7489114 (ppo)  LOC7489115 (ppo)  LOC7489116 (ppo)  LOC7489117 (ppo)  LOC11406991 (mtr)  LOC11407647 (mtr)  LOC11415235 (mtr)  LOC11415951 (mtr)  LOC11416804 (mtr)  LOC11418784 (mtr)  LOC11420001 (mtr)  LOC11422032 (mtr)  LOC11422989 (mtr)  LOC11424412 (mtr)  LOC11429520 (mtr)  LOC18095776 (ppo)  LOC18096028 (ppo)  LOC18103477 (ppo)  LOC18103479 (ppo)  LOC18103480 (ppo)  LOC18103481 (ppo)  LOC18103482 (ppo)  LOC18103487 (ppo)  LOC18103492 (ppo)  LOC18103495 (ppo)  LOC18103496 (ppo)  LOC18103497 (ppo)  LOC18103499 (ppo)  LOC18103509 (ppo)  LOC18103510 (ppo)  LOC18103511 (ppo)  LOC18103513 (ppo)  LOC18105648 (ppo)  LOC18109453 (ppo)  LOC25486180 (mtr)  LOC25486316 (mtr)  LOC25486318 (mtr)  LOC25486319 (mtr)  LOC25492422 (mtr)  LOC25493091 (mtr)  LOC25493334 (mtr)  LOC25493352 (mtr)  LOC25493353 (mtr)  LOC25493354 (mtr)  LOC25493355 (mtr)  LOC25493356 (mtr)  LOC25493357 (mtr)  LOC25493364 (mtr)  LOC25493365 (mtr)  LOC25493366 (mtr)  LOC25495604 (mtr)  LOC100775353 (gma)  LOC100775893 (gma)  LOC100776438 (gma)  LOC100777594 (gma)  LOC100778568 (gma)  LOC100779395 (gma)  LOC100780114 (gma)  LOC100780461 (gma)  LOC100781004 (gma)  LOC100781731 (gma)  LOC100782093 (gma)  LOC100782292 (gma)  LOC100782631 (gma)  LOC100786800 (gma)  LOC100788228 (gma)  LOC100788233 (gma)  LOC100794074 (gma)  LOC100796276 (gma)  LOC100796809 (gma)  LOC100797188 (gma)  LOC100797739 (gma)  LOC100799990 (gma)  LOC100800519 (gma)  LOC100801058 (gma)  LOC100802131 (gma)  LOC100803041 (gma)  LOC100807459 (gma)  LOC100807998 (gma)  LOC100810481 (gma)  LOC100811019 (gma)  LOC100811558 (gma)  LOC100812087 (gma)  LOC100813175 (gma)  LOC100813706 (gma)  LOC101246398 (sly)  LOC101246685 (sly)  LOC101249413 (sly)  LOC101249763 (sly)  LOC101254601 (sly)  LOC101254908 (sly)  LOC101254965 (sly)  LOC101255262 (sly)  LOC101255854 (sly)  LOC101256448 (sly)  LOC101263376 (sly)  LOC101263972 (sly)  LOC101264289 (sly)  LOC101264571 (sly)  LOC101264701 (sly)  LOC101265002 (sly)  LOC101265308 (sly)  LOC101265606 (sly)  LOC102662170 (gma)  LOC103827902 (bra)  LOC103827906 (bra)  LOC103828799 (bra)  LOC103828803 (bra)  LOC103834173 (bra)  LOC103839175 (bra)  LOC103839178 (bra)  LOC103839179 (bra)  LOC103839182 (bra)  LOC103839321 (bra)  LOC103839322 (bra)  LOC103840305 (bra)  LOC103840312 (bra)  LOC103840313 (bra)  LOC103840613 (bra)  LOC103840614 (bra)  LOC103841228 (bra)  LOC103843225 (bra)  LOC103850258 (bra)  LOC103857550 (bra)  LOC103858368 (bra)  LOC103858377 (bra)  LOC103858400 (bra)  LOC103858408 (bra)  LOC103858430 (bra)  LOC103858724 (bra)  LOC103861201 (bra)  LOC103861202 (bra)  LOC103865354 (bra)  LOC103867418 (bra)  LOC103871928 (bra)  LOC104645788 (sly)  LOC104646055 (sly)  LOC107275394 (osa)  LOC108869423 (bra)  LOC112323320 (ppo)  LOC112323321 (ppo)  LOC112323322 (ppo)  LOC112323328 (ppo)  LOC112323330 (ppo)  LOC112324786 (ppo)  LOC112324789 (ppo)  LOC112325984 (ppo)  LOC112329148 (ppo)  LOC112421407 (mtr)  LOC117125831 (bra)  LOC120580904 (mtr)  LOC123039084 (tae)  LOC123043821 (tae)  LOC123044031 (tae)  LOC123048809 (tae)  LOC123051687 (tae)  LOC123051908 (tae)  LOC123056682 (tae)  LOC123069860 (tae)  LOC123101225 (tae)  LOC123104138 (tae)  LOC123121890 (tae)  LOC123151640 (tae)  LOC123151641 (tae)  LOC123151651 (tae)  LOC123154502 (tae)  LOC123154697 (tae)  LOC123159831 (tae)  LOC123160014 (tae)  LOC123160305 (tae)  LOC123160322 (tae)  LOC123160325 (tae)  LOC123160531 (tae)  LOC123166878 (tae)  LOC123166970 (tae)  LOC123167086 (tae)  LOC123167432 (tae)  LOC123168236 (tae)  LOC123169320 (tae)  LOC123171182 (tae)  LOC123172934 (tae)  LOC123178742 (tae)  LOC123182957 (tae)  LOC123183295 (tae)  LOC123184816 (tae)  LOC123184818 (tae)  LOC123396132 (hvu)  LOC123407824 (hvu)  LOC123409363 (hvu)  LOC123411150 (hvu)  LOC123411227 (hvu)  LOC123411684 (hvu)  LOC123413019 (hvu)  LOC123421037 (hvu)  LOC123425140 (hvu)  LOC123425397 (hvu)  LOC123429002 (hvu)  LOC123429003 (hvu)  LOC123429523 (hvu) 
Subcellular
localization
wolf
vacu 5,  chlo 3,  nucl 1,  plas 1,  golg 1,  nucl_plas 1,  golg_plas 1  (predict for NP_193818.1)
Subcellular
localization
TargetP
scret 6  (predict for NP_193818.1)
Gene coexpression
Network*for
coexpressed
genes
LCNloc
[Cytoscape]
KEGG* ID Title #genes Link to the KEGG* map
(Multiple genes)
ath04016 MAPK signaling pathway - plant 2
ath04626 Plant-pathogen interaction 2
Genes directly connected with AT4G20860 on the network
coex z* Locus Function* CoexViewer Entrez Gene ID*
5.8 AT1G30700 FAD-binding Berberine family protein [detail] 839950
5.3 IOS1 Leucine-rich repeat protein kinase family protein [detail] 841606
5.2 PUB22 plant U-box 22 [detail] 824410
4.8 AT5G19230 Glycoprotein membrane precursor GPI-anchored [detail] 832043
Coexpressed
gene list		 [Coexpressed gene list for AT4G20860]
Gene expression
All samples [Expression pattern for all samples]
AtGenExpress*
(Development)
254447_at
254447_at.png

X axis is samples (pdf file), and Y axis is log2-expression.
"1st Q", "mean" and "3rd Q" indecate the values for all genes on a GeneChip. Q: quartile.

AtGenExpress*
(Stress)
254447_at
254447_at.png

X axis is samples (pdf file), and Y axis is log2-expression.
AtGenExpress*
(Hormone)
254447_at
254447_at.png

X axis is samples (xls file), and Y axis is log-expression.
Link to other DBs
Entrez Gene ID 827834      
Refseq ID (protein) NP_193818.1 


The preparation time of this page was 0.1 [sec].