[][] ath   At4g27960 Gene
functional annotation
Function   ubiquitin conjugating enzyme 9 Plant GARDENPlant GARDEN JBrowse
GO BP
GO:0006511 [list] [network] ubiquitin-dependent protein catabolic process  (230 genes)  IDA TAS  
GO CC
GO:0005634 [list] [network] nucleus  (10305 genes)  ISM  
GO MF
GO:0004842 [list] [network] ubiquitin-protein transferase activity  (261 genes)  IDA  
KEGG
Protein NP_567791.1  NP_849462.1 
BLAST NP_567791.1  NP_849462.1 
Orthologous [Ortholog page] LOC543171 (tae)LOC547652 (gma)LOC780682 (tae)UBC29 (ath)UBC11 (ath)UBC12 (ath)UBC8 (ath)UBC10 (ath)UBC30 (ath)UBC28 (ath)LOC4327162 (osa)LOC4327450 (osa)LOC4327451 (osa)LOC4328114 (osa)LOC4328940 (osa)LOC4330556 (osa)LOC4337331 (osa)LOC4341133 (osa)LOC4346639 (osa)LOC7467425 (ppo)LOC7470402 (ppo)LOC7472487 (ppo)LOC7479274 (ppo)LOC7484638 (ppo)LOC7489805 (ppo)LOC7494655 (ppo)LOC7497821 (ppo)LOC11420397 (mtr)LOC11432845 (mtr)LOC11436401 (mtr)LOC11437634 (mtr)LOC11443623 (mtr)LOC18103563 (ppo)LOC18105670 (ppo)LOC25501549 (mtr)UBC3 (sly)UBC (sly)LOC100305945 (gma)LOC100499741 (gma)LOC100499824 (gma)LOC100499891 (gma)LOC100500665 (gma)LOC100527105 (gma)LOC100777678 (gma)LOC100783492 (gma)LOC100787053 (gma)LOC100788548 (gma)LOC100789422 (gma)LOC100790317 (gma)LOC100802703 (gma)LOC100805577 (gma)LOC100806349 (gma)LOC100809895 (gma)LOC100817810 (gma)LOC100818920 (gma)UBC11 (sly)LOC101249087 (sly)LOC101250739 (sly)LOC101252287 (sly)LOC101254567 (sly)LOC101257090 (sly)LOC101260872 (sly)LOC101264951 (sly)LOC101265051 (sly)LOC101265499 (sly)LOC103834781 (bra)LOC103838144 (bra)LOC103838220 (bra)LOC103844808 (bra)LOC103845050 (bra)LOC103846025 (bra)LOC103848719 (bra)LOC103852040 (bra)LOC103856951 (bra)LOC103857087 (bra)LOC103859333 (bra)LOC103860482 (bra)LOC103867752 (bra)LOC103870601 (bra)LOC123061638 (tae)LOC123070256 (tae)LOC123078708 (tae)LOC123079569 (tae)LOC123103437 (tae)LOC123116053 (tae)LOC123124682 (tae)LOC123130205 (tae)LOC123135884 (tae)LOC123137059 (tae)LOC123143404 (tae)LOC123147877 (tae)LOC123163058 (tae)LOC123169481 (tae)LOC123182373 (tae)LOC123190930 (tae)LOC123398194 (hvu)LOC123402149 (hvu)LOC123407329 (hvu)LOC123428296 (hvu)LOC123444007 (hvu)LOC123444640 (hvu)LOC123444715 (hvu)
Subcellular
localization
wolf
cyto 7,  nucl 1,  mito 1,  extr 1,  E.R. 1  (predict for NP_567791.1)
nucl 4,  cyto_nucl 3,  chlo 1,  mito 1,  chlo_mito 1  (predict for NP_849462.1)
Subcellular
localization
TargetP
scret 6  (predict for NP_567791.1)
other 8  (predict for NP_849462.1)
Gene coexpression
Network*for
coexpressed
genes
LCNloc
[Cytoscape]
KEGG* ID Title #genes Link to the KEGG* map
(Multiple genes)
ath04144 Endocytosis 6
ath04016 MAPK signaling pathway - plant 2
ath04070 Phosphatidylinositol signaling system 2
ath04626 Plant-pathogen interaction 2
Genes directly connected with UBC9 on the network
coex z* Locus Function* CoexViewer Entrez Gene ID*
6.2 RCE1 RUB1 conjugating enzyme 1 [detail] 829833
6.2 ARF1 ADP-ribosylation factor 1 [detail] 838957
5.8 AT4G10140 uncharacterized protein [detail] 826605
Coexpressed
gene list
[Coexpressed gene list for UBC9]
Gene expression
All samples [Expression pattern for all samples]
Link to other DBs
Entrez Gene ID 828909    
Refseq ID (protein) NP_567791.1 
NP_849462.1 


The preparation time of this page was 0.1 [sec].