[][] ath   AT4G29180 Gene
functional annotation
Function   root hair specific 16
GO BP
GO:0006468 [list] [network] protein phosphorylation  (921 genes)  IEA  
GO:0016310 [list] [network] phosphorylation  (1279 genes)  ISS  
GO CC
GO:0005576 [list] [network] extracellular region  (3363 genes)  ISM  
GO:0016021 [list] [network] integral component of membrane  (4803 genes)  IEA  
GO MF
GO:0004674 [list] [network] protein serine/threonine kinase activity  (801 genes)  IEA  
GO:0016301 [list] [network] kinase activity  (1362 genes)  ISS  
GO:0005524 [list] [network] ATP binding  (2003 genes)  IEA  
GO:0005515 [list] [network] protein binding  (4605 genes)  IPI  
KEGG
Protein NP_001190865.1  NP_001328257.1  NP_194647.2 
BLAST NP_001190865.1  NP_001328257.1  NP_194647.2 
Orthologous [Ortholog page] AT2G04300 (ath)AT2G14440 (ath)AT2G14510 (ath)FRK1 (ath)AT2G19210 (ath)AT2G19230 (ath)AT2G28960 (ath)AT2G28970 (ath)AT2G28990 (ath)AT2G29000 (ath)AT3G21340 (ath)AT3G46350 (ath)AT3G46370 (ath)AT4G29450 (ath)AT4G29990 (ath)AT5G16900 (ath)AT5G59650 (ath)AT5G59670 (ath)AT5G59680 (ath)AT1G05700 (ath)AT1G07550 (ath)AT1G07560 (ath)AT1G49100 (ath)AT1G51790 (ath)IOS1 (ath)AT1G51805 (ath)AT1G51810 (ath)AT1G51820 (ath)AT1G51830 (ath)AT1G51840 (ath)AT1G51850 (ath)AT1G51860 (ath)AT1G51870 (ath)RHS6 (ath)AT1G51890 (ath)AT1G51910 (ath)LOC4328315 (osa)LOC4339370 (osa)LOC4339371 (osa)LOC4339374 (osa)LOC4339376 (osa)LOC4339378 (osa)LOC4346817 (osa)LOC9270191 (osa)LOC9272354 (osa)LOC11421236 (mtr)LOC11422007 (mtr)LOC11425516 (mtr)LOC11425517 (mtr)LOC11429446 (mtr)LOC11433438 (mtr)LOC11434037 (mtr)LOC25497008 (mtr)LOC25500355 (mtr)LOC25500358 (mtr)LOC25500359 (mtr)LOC25500361 (mtr)LOC25500364 (mtr)LOC25500366 (mtr)LOC25500367 (mtr)LOC25500376 (mtr)LOC25500764 (mtr)LOC25500765 (mtr)LOC25502465 (mtr)SIK2 (gma)LOC100242932 (vvi)LOC100244634 (vvi)LOC100246311 (vvi)LOC100246405 (vvi)LOC100249701 (vvi)LOC100251452 (vvi)LOC100260016 (vvi)LOC100261686 (vvi)LOC100266874 (vvi)LOC100266960 (vvi)LOC100275543 (zma)LOC100775741 (gma)LOC100776284 (gma)LOC100776818 (gma)LOC100778537 (gma)LOC100779102 (gma)LOC100779474 (gma)LOC100779594 (gma)LOC100779617 (gma)LOC100781084 (gma)LOC100781785 (gma)LOC100785345 (gma)LOC100791717 (gma)LOC100792239 (gma)LOC100793137 (gma)LOC100794504 (gma)LOC100795183 (gma)LOC100818475 (gma)LOC101257947 (sly)LOC101262429 (sly)LOC101266705 (sly)LOC102660013 (gma)LOC102662730 (gma)LOC102663143 (gma)LOC103626627 (zma)LOC103634037 (zma)LOC103829493 (bra)LOC103829497 (bra)LOC103836435 (bra)LOC103843445 (bra)LOC103843938 (bra)LOC103844100 (bra)LOC103845385 (bra)LOC103845386 (bra)LOC103850089 (bra)LOC103851561 (bra)LOC103851563 (bra)LOC103851564 (bra)LOC103851565 (bra)LOC103853036 (bra)LOC103853548 (bra)LOC103854870 (bra)LOC103856616 (bra)LOC103856900 (bra)LOC103859903 (bra)LOC103861877 (bra)LOC103864933 (bra)LOC103864934 (bra)LOC103868533 (bra)LOC103868536 (bra)LOC103868540 (bra)LOC103868542 (bra)LOC103868543 (bra)LOC103868545 (bra)LOC103868632 (bra)LOC103869180 (bra)LOC103871250 (bra)LOC103871251 (bra)LOC103871253 (bra)LOC103871255 (bra)LOC104880223 (vvi)LOC104880225 (vvi)LOC106794186 (gma)LOC106799536 (gma)LOC107275782 (osa)LOC107276230 (osa)LOC107278846 (osa)LOC108870913 (bra)LOC112416101 (mtr)LOC112417465 (mtr)LOC112417487 (mtr)LOC113002309 (gma)LOC113002392 (gma)
Subcellular
localization
wolf
plas 4,  nucl 1,  vacu 1,  golg 1,  chlo 1,  mito 1,  E.R. 1,  cyto_nucl 1,  chlo_mito 1,  cysk_nucl 1  (predict for NP_001190865.1)
plas 4,  nucl 1,  vacu 1,  golg 1,  chlo 1,  mito 1,  E.R. 1,  cyto_nucl 1,  chlo_mito 1,  cysk_nucl 1  (predict for NP_001328257.1)
plas 4,  vacu 1,  golg 1,  chlo 1,  nucl 1,  mito 1,  extr 1,  E.R. 1,  chlo_mito 1  (predict for NP_194647.2)
Subcellular
localization
TargetP
scret 9  (predict for NP_001190865.1)
scret 9  (predict for NP_001328257.1)
scret 9  (predict for NP_194647.2)
Gene coexpression
Network*for
coexpressed
genes
LCNloc
[Cytoscape]
Genes directly connected with RHS16 on the network
coex z* Locus Function* Coexpression
detail
Entrez Gene ID*
9.2 PERK13 root hair specific 10 [detail] 843382
9.1 SHV2 COBRA-like extracellular glycosyl-phosphatidyl inositol-anchored protein family [detail] 834987
9.0 EXPA18 expansin A18 [detail] 842601
7.0 MRH2 Armadillo/beta-catenin repeat family protein / kinesin motor family protein [detail] 824652
Coexpressed
gene list
[Coexpressed gene list for RHS16]
Gene expression
All samples [Expression pattern for all samples]
AtGenExpress*
(Development)
253734_at
253734_at.png

X axis is samples (pdf file), and Y axis is log2-expression.
"1st Q", "mean" and "3rd Q" indecate the values for all genes on a GeneChip. Q: quartile.

AtGenExpress*
(Stress)
253734_at
253734_at.png

X axis is samples (pdf file), and Y axis is log2-expression.

AtGenExpress*
(Hormone)
253734_at
253734_at.png

X axis is samples (xls file), and Y axis is log-expression.

Link to other DBs
Entrez Gene ID 829039    
Refseq ID (protein) NP_001190865.1 
NP_001328257.1 
NP_194647.2 


The preparation time of this page was 0.2 [sec].