[←][→] ath   At4g29180 Gene
functional annotation
Function   root hair specific 16    Plant GARDEN Plant GARDEN JBrowse
GO BP
GO:0048765 [list] [network] root hair cell differentiation  (143 genes)  IEA  
GO:0009932 [list] [network] cell tip growth  (188 genes)  IEA  
GO:0048588 [list] [network] developmental cell growth  (251 genes)  IEA  
GO:0000904 [list] [network] cell morphogenesis involved in differentiation  (269 genes)  IEA  
GO:0006468 [list] [network] protein phosphorylation  (639 genes)  IEA  
GO:0016310 [list] [network] phosphorylation  (785 genes)  ISS  
GO:0048589 [list] [network] developmental growth  (1060 genes)  IEA  
GO:0030154 [list] [network] cell differentiation  (1176 genes)  IEA  
GO:0048364 [list] [network] root development  (1192 genes)  IEA  
GO:0009888 [list] [network] tissue development  (1806 genes)  IEA  
GO CC
GO:0005576 [list] [network] extracellular region  (3154 genes)  ISM  
GO MF
GO:0004674 [list] [network] protein serine/threonine kinase activity  (454 genes)  IEA  
GO:0016301 [list] [network] kinase activity  (1068 genes)  ISS  
GO:0005515 [list] [network] protein binding  (5066 genes)  IPI  
KEGG
Protein NP_001190865.1  NP_001328257.1  NP_194647.2 
BLAST NP_001190865.1  NP_001328257.1  NP_194647.2 
Orthologous [Ortholog page] AT2G04300 (ath)  AT2G14440 (ath)  AT2G14510 (ath)  FRK1 (ath)  AT2G19210 (ath)  AT2G19230 (ath)  AT2G28960 (ath)  AT2G28970 (ath)  AT2G28990 (ath)  AT2G29000 (ath)  AT3G21340 (ath)  MEE39 (ath)  AT3G46340 (ath)  AT3G46370 (ath)  AT3G46400 (ath)  AT3G46420 (ath)  AT4G20450 (ath)  AT4G29450 (ath)  AT4G29990 (ath)  AT5G16900 (ath)  AT5G59650 (ath)  AT5G59670 (ath)  AT5G59680 (ath)  AT1G05700 (ath)  AT1G07550 (ath)  AT1G07560 (ath)  AT1G49100 (ath)  AT1G51790 (ath)  IOS1 (ath)  AT1G51805 (ath)  AT1G51810 (ath)  AT1G51820 (ath)  AT1G51830 (ath)  AT1G51850 (ath)  AT1G51860 (ath)  AT1G51870 (ath)  RHS6 (ath)  AT1G51890 (ath)  AT1G51910 (ath)  LOC4328315 (osa)  LOC4338207 (osa)  LOC4339370 (osa)  LOC4339371 (osa)  LOC4339374 (osa)  LOC4339376 (osa)  LOC4339378 (osa)  LOC4346819 (osa)  LOC4346820 (osa)  LOC4346821 (osa)  LOC4346822 (osa)  LOC4346823 (osa)  LOC4346825 (osa)  LOC4346833 (osa)  LOC4346837 (osa)  LOC4346841 (osa)  LOC7494617 (ppo)  LOC9266163 (osa)  LOC9267814 (osa)  LOC9267979 (osa)  LOC9272354 (osa)  LOC11421236 (mtr)  LOC11422007 (mtr)  LOC11425516 (mtr)  LOC11429446 (mtr)  LOC11433438 (mtr)  LOC11434037 (mtr)  LOC11437028 (mtr)  LOC18108501 (ppo)  LOC18108503 (ppo)  LOC18108531 (ppo)  LOC18110286 (ppo)  LOC18110288 (ppo)  LOC18110448 (ppo)  LOC18110542 (ppo)  LOC18110545 (ppo)  LOC18110550 (ppo)  LOC25497008 (mtr)  LOC25500355 (mtr)  LOC25500358 (mtr)  LOC25500359 (mtr)  LOC25500361 (mtr)  LOC25500364 (mtr)  LOC25500366 (mtr)  LOC25500367 (mtr)  LOC25500376 (mtr)  LOC25500764 (mtr)  LOC25502465 (mtr)  SIK2 (gma)  LOC100775741 (gma)  LOC100776284 (gma)  LOC100776818 (gma)  LOC100778537 (gma)  LOC100779102 (gma)  LOC100779474 (gma)  LOC100779617 (gma)  LOC100781084 (gma)  LOC100781785 (gma)  LOC100785345 (gma)  LOC100791717 (gma)  LOC100792239 (gma)  LOC100793137 (gma)  LOC100794504 (gma)  LOC100795183 (gma)  LOC100818475 (gma)  LOC101257947 (sly)  LOC101262429 (sly)  LOC101266705 (sly)  LOC102662730 (gma)  LOC102663143 (gma)  LOC103829493 (bra)  LOC103829497 (bra)  LOC103836435 (bra)  LOC103843445 (bra)  LOC103844100 (bra)  LOC103845385 (bra)  LOC103850089 (bra)  LOC103851563 (bra)  LOC103851564 (bra)  LOC103851565 (bra)  LOC103851763 (bra)  LOC103853036 (bra)  LOC103853548 (bra)  LOC103856616 (bra)  LOC103859903 (bra)  LOC103861877 (bra)  LOC103864933 (bra)  LOC103864934 (bra)  LOC103868533 (bra)  LOC103868536 (bra)  LOC103868540 (bra)  LOC103868542 (bra)  LOC103868543 (bra)  LOC103868545 (bra)  LOC103868632 (bra)  LOC103869180 (bra)  LOC103871250 (bra)  LOC103871251 (bra)  LOC103871253 (bra)  LOC103871255 (bra)  LOC103873634 (bra)  LOC106794186 (gma)  LOC106799536 (gma)  LOC107275782 (osa)  LOC107276230 (osa)  LOC107276752 (osa)  LOC107278492 (osa)  LOC107278845 (osa)  LOC112325225 (ppo)  LOC112416101 (mtr)  LOC112417465 (mtr)  LOC112936039 (osa)  LOC117125683 (bra)  LOC120575758 (mtr)  LOC123043522 (tae)  LOC123044006 (tae)  LOC123044087 (tae)  LOC123044243 (tae)  LOC123054720 (tae)  LOC123063692 (tae)  LOC123067573 (tae)  LOC123079142 (tae)  LOC123080188 (tae)  LOC123080196 (tae)  LOC123080205 (tae)  LOC123080238 (tae)  LOC123083057 (tae)  LOC123084992 (tae)  LOC123085003 (tae)  LOC123086249 (tae)  LOC123094168 (tae)  LOC123094169 (tae)  LOC123096526 (tae)  LOC123096537 (tae)  LOC123096545 (tae)  LOC123096554 (tae)  LOC123096599 (tae)  LOC123096617 (tae)  LOC123096813 (tae)  LOC123097489 (tae)  LOC123103544 (tae)  LOC123106972 (tae)  LOC123114350 (tae)  LOC123114773 (tae)  LOC123116086 (tae)  LOC123120524 (tae)  LOC123124720 (tae)  LOC123126207 (tae)  LOC123132270 (tae)  LOC123132271 (tae)  LOC123132273 (tae)  LOC123136316 (tae)  LOC123136318 (tae)  LOC123136319 (tae)  LOC123138953 (tae)  LOC123140966 (tae)  LOC123143830 (tae)  LOC123143832 (tae)  LOC123143833 (tae)  LOC123143893 (tae)  LOC123157067 (tae)  LOC123160036 (tae)  LOC123160179 (tae)  LOC123160205 (tae)  LOC123160231 (tae)  LOC123162979 (tae)  LOC123162990 (tae)  LOC123173379 (tae)  LOC123173395 (tae)  LOC123173449 (tae)  LOC123179719 (tae)  LOC123179738 (tae)  LOC123179780 (tae)  LOC123180475 (tae)  LOC123182688 (tae)  LOC123182689 (tae)  LOC123395140 (hvu)  LOC123398290 (hvu)  LOC123401280 (hvu)  LOC123401354 (hvu)  LOC123401635 (hvu)  LOC123404089 (hvu)  LOC123404264 (hvu)  LOC123404421 (hvu)  LOC123404434 (hvu)  LOC123404717 (hvu)  LOC123408210 (hvu)  LOC123416831 (hvu)  LOC123416847 (hvu)  LOC123416895 (hvu)  LOC123440187 (hvu)  LOC123442690 (hvu)  LOC123448982 (hvu)  LOC123450805 (hvu)  LOC123450806 (hvu) 
Subcellular
localization
wolf
plas 4,  nucl 1,  vacu 1,  golg 1,  chlo 1,  mito 1,  E.R. 1,  cyto_nucl 1,  chlo_mito 1,  cysk_nucl 1  (predict for NP_001190865.1)
plas 4,  nucl 1,  vacu 1,  golg 1,  chlo 1,  mito 1,  E.R. 1,  cyto_nucl 1,  chlo_mito 1,  cysk_nucl 1  (predict for NP_001328257.1)
plas 4,  vacu 1,  golg 1,  chlo 1,  nucl 1,  mito 1,  extr 1,  E.R. 1,  chlo_mito 1  (predict for NP_194647.2)
Subcellular
localization
TargetP
scret 9  (predict for NP_001190865.1)
scret 9  (predict for NP_001328257.1)
scret 9  (predict for NP_194647.2)
Gene coexpression
Network*for
coexpressed
genes
LCNloc
[Cytoscape]
KEGG* ID Title #genes Link to the KEGG* map
(Multiple genes)
ath00940 Phenylpropanoid biosynthesis 2
Genes directly connected with RHS16 on the network
coex z* Locus Function* CoexViewer Entrez Gene ID*
9.1 AT3G12540 ternary complex factor MIP1 leucine-zipper protein (Protein of unknown function, DUF547) [detail] 820433
8.5 PERK13 root hair specific 10 [detail] 843382
8.5 AT4G33730 CAP (Cysteine-rich secretory proteins, Antigen 5, and Pathogenesis-related 1 protein) superfamily protein [detail] 829515
8.0 AT5G61550 U-box domain-containing protein kinase family protein [detail] 836276
7.3 MRH2 Armadillo/beta-catenin repeat family protein / kinesin motor family protein [detail] 824652
Coexpressed
gene list		 [Coexpressed gene list for RHS16]
Gene expression
All samples [Expression pattern for all samples]
AtGenExpress*
(Development)
253734_at
253734_at.png

X axis is samples (pdf file), and Y axis is log2-expression.
"1st Q", "mean" and "3rd Q" indecate the values for all genes on a GeneChip. Q: quartile.

AtGenExpress*
(Stress)
253734_at
253734_at.png

X axis is samples (pdf file), and Y axis is log2-expression.
AtGenExpress*
(Hormone)
253734_at
253734_at.png

X axis is samples (xls file), and Y axis is log-expression.
Link to other DBs
Entrez Gene ID 829039      
Refseq ID (protein) NP_001190865.1 
NP_001328257.1 
NP_194647.2 


The preparation time of this page was 0.1 [sec].