[][] ath   AT4G38840 Gene
functional annotation
Function   SAUR-like auxin-responsive protein family
GO BP
GO:0009733 [list] [network] response to auxin  (407 genes)  IEA  
GO:0009409 [list] [network] response to cold  (411 genes)  IEP  
GO CC
GO:0005886 [list] [network] plasma membrane  (3771 genes)  IDA  
GO:0009507 [list] [network] chloroplast  (5095 genes)  ISM  
GO MF
KEGG ath04075 [list] [network] Plant hormone signal transduction (273 genes)
Protein NP_195595.1 
BLAST NP_195595.1 
Orthologous [Ortholog page] AT2G21200 (ath)AT2G21210 (ath)SAUR26 (ath)SAUR27 (ath)SAUR28 (ath)AT4G34770 (ath)AT4G34790 (ath)AT4G34810 (ath)SAUR15 (ath)SAUR22 (ath)SAUR23 (ath)SAUR19 (ath)SAUR20 (ath)AT5G18030 (ath)LOC4344531 (osa)AT4G38825 (ath)LOC7453611 (ppo)LOC7453619 (ppo)LOC7453621 (ppo)LOC7453623 (ppo)LOC7463979 (ppo)LOC7463980 (ppo)LOC7477849 (ppo)LOC7477850 (ppo)LOC7477851 (ppo)LOC7494278 (ppo)LOC7494283 (ppo)LOC7494285 (ppo)LOC7494286 (ppo)LOC11413106 (mtr)LOC11422795 (mtr)LOC11435675 (mtr)LOC11437674 (mtr)LOC11438950 (mtr)LOC11439583 (mtr)LOC11439661 (mtr)LOC11440204 (mtr)LOC11440224 (mtr)LOC11440225 (mtr)LOC11440226 (mtr)LOC11440228 (mtr)LOC11440231 (mtr)LOC11440594 (mtr)LOC11440613 (mtr)LOC11442478 (mtr)LOC11443218 (mtr)LOC11443225 (mtr)LOC11443609 (mtr)LOC11444161 (mtr)LOC11444193 (mtr)LOC11444364 (mtr)LOC11444906 (mtr)LOC11445398 (mtr)LOC11445399 (mtr)LOC11445400 (mtr)LOC25502486 (mtr)SAUR29 (ath)AT4G34800 (ath)SAUR24 (ath)LOC100240974 (vvi)LOC100241748 (vvi)LOC100241903 (vvi)LOC100243412 (vvi)LOC100243525 (vvi)LOC100244422 (vvi)LOC100245466 (vvi)LOC100246872 (vvi)LOC100247037 (vvi)LOC100248668 (vvi)LOC100249577 (vvi)LOC100250384 (vvi)LOC100252008 (vvi)LOC100252164 (vvi)LOC100252964 (vvi)LOC100253710 (vvi)LOC100253871 (vvi)LOC100255446 (vvi)LOC100256454 (vvi)LOC100256532 (vvi)LOC100258859 (vvi)LOC100259012 (vvi)LOC100259796 (vvi)LOC100261544 (vvi)LOC100261630 (vvi)LOC100263233 (vvi)LOC100264029 (vvi)LOC100264191 (vvi)LOC100264992 (vvi)LOC100265736 (vvi)LOC100265851 (vvi)LOC100266822 (vvi)LOC100267560 (vvi)LOC100306459 (gma)LOC100500377 (gma)LOC100500483 (gma)LOC100526895 (gma)LOC100527277 (gma)LOC100527820 (gma)LOC100775873 (gma)LOC100776943 (gma)LOC100777479 (gma)LOC100778121 (gma)LOC100779223 (gma)LOC100780289 (gma)LOC100781277 (gma)LOC100782363 (gma)LOC100782833 (gma)LOC100783438 (gma)LOC100784233 (gma)LOC100785114 (gma)LOC100786095 (gma)LOC100786685 (gma)LOC100787155 (gma)LOC100787768 (gma)LOC100789272 (gma)LOC100789280 (gma)LOC100793401 (gma)LOC100793927 (gma)LOC100795597 (gma)LOC100797634 (gma)LOC100797800 (gma)LOC100798690 (gma)LOC100802934 (gma)LOC100803474 (gma)LOC100806671 (gma)LOC100811334 (gma)LOC100814912 (gma)LOC100815438 (gma)LOC100815976 (gma)LOC100816803 (gma)LOC100817347 (gma)LOC100817559 (gma)LOC100817568 (gma)LOC100820621 (gma)LOC101055584 (sly)LOC101243847 (sly)LOC101244440 (sly)LOC101247761 (sly)LOC101248621 (sly)LOC101249685 (sly)LOC101249687 (sly)LOC101249968 (sly)LOC101251524 (sly)LOC101251827 (sly)LOC101267669 (sly)LOC102662892 (gma)LOC102663761 (gma)LOC103653123 (zma)LOC103828085 (bra)LOC103834323 (bra)LOC103834391 (bra)LOC103834414 (bra)LOC103834513 (bra)LOC103834524 (bra)LOC103834602 (bra)LOC103845871 (bra)LOC103845872 (bra)LOC103845874 (bra)LOC103845876 (bra)LOC103845877 (bra)LOC103845878 (bra)LOC103845879 (bra)LOC103845880 (bra)LOC103845881 (bra)LOC103845882 (bra)LOC103845883 (bra)LOC103851147 (bra)LOC103851148 (bra)LOC103851150 (bra)LOC103851151 (bra)LOC103851152 (bra)LOC103851153 (bra)LOC103851154 (bra)LOC103851155 (bra)LOC103851156 (bra)LOC103851158 (bra)LOC103854000 (bra)LOC103854001 (bra)LOC103856275 (bra)LOC103856276 (bra)LOC103856277 (bra)LOC103856278 (bra)LOC103856279 (bra)LOC103856281 (bra)LOC103856282 (bra)LOC103856290 (bra)LOC103857635 (bra)LOC103862374 (bra)LOC103862378 (bra)LOC104644302 (sly)LOC104645434 (sly)LOC104645435 (sly)LOC104645436 (sly)LOC104645438 (sly)LOC104645439 (sly)LOC106794448 (gma)LOC106794512 (gma)LOC106795237 (gma)LOC106795238 (gma)LOC106795371 (gma)LOC106798359 (gma)LOC106798970 (gma)LOC106798972 (gma)LOC106798973 (gma)LOC106798974 (gma)LOC106799178 (gma)LOC107277215 (osa)LOC108871385 (bra)LOC109118704 (sly)LOC109122367 (vvi)LOC109122431 (vvi)LOC109122468 (vvi)LOC109122469 (vvi)LOC109122524 (vvi)LOC112940306 (sly)LOC112940538 (sly)LOC112941374 (sly)LOC112997597 (gma)LOC112997793 (gma)LOC112997795 (gma)LOC112997796 (gma)LOC112997797 (gma)LOC112998524 (gma)LOC112998536 (gma)LOC112998537 (gma)LOC112998546 (gma)LOC112998555 (gma)LOC112998583 (gma)LOC112998584 (gma)LOC113001050 (gma)LOC113001051 (gma)LOC113001439 (gma)LOC113001848 (gma)LOC113001933 (gma)LOC113001953 (gma)LOC113001954 (gma)LOC113001957 (gma)LOC113001958 (gma)LOC113001959 (gma)LOC113001960 (gma)LOC113001961 (gma)LOC113001962 (gma)LOC113001963 (gma)LOC113001964 (gma)LOC113001965 (gma)LOC113001966 (gma)LOC113002344 (gma)LOC113002386 (gma)
Subcellular
localization
wolf
chlo 4,  mito 3,  nucl 2,  cyto_nucl 1,  mito_plas 1  (predict for NP_195595.1)
Subcellular
localization
TargetP
mito 7,  chlo 5  (predict for NP_195595.1)
Gene coexpression
Network*for
coexpressed
genes
LCNloc
[Cytoscape]
KEGG* ID Title #genes Link to the KEGG* map
(Multiple genes)
ath04075 Plant hormone signal transduction 6
Genes directly connected with AT4G38840 on the network
coex z* Locus Function* Coexpression
detail
Entrez Gene ID*
13.7 AT4G38860 SAUR-like auxin-responsive protein family [detail] 830041
12.0 SAUR15 SAUR-like auxin-responsive protein family [detail] 830040
10.8 AT1G29430 SAUR-like auxin-responsive protein family [detail] 839819
10.2 AT2G21210 SAUR-like auxin-responsive protein family [detail] 816658
7.0 AT4G34760 SAUR-like auxin-responsive protein family [detail] 829628
6.2 ZFP8 zinc finger protein 8 [detail] 818794
Coexpressed
gene list
[Coexpressed gene list for AT4G38840]
Gene expression
All samples [Expression pattern for all samples]
AtGenExpress*
(Development)
252972_at
252972_at.png

X axis is samples (pdf file), and Y axis is log2-expression.
"1st Q", "mean" and "3rd Q" indecate the values for all genes on a GeneChip. Q: quartile.

AtGenExpress*
(Stress)
252972_at
252972_at.png

X axis is samples (pdf file), and Y axis is log2-expression.

AtGenExpress*
(Hormone)
252972_at
252972_at.png

X axis is samples (xls file), and Y axis is log-expression.

Link to other DBs
Entrez Gene ID 830039    
Refseq ID (protein) NP_195595.1 


The preparation time of this page was 0.3 [sec].