[][] ath   At4g38850 Gene
functional annotation
Function   SAUR-like auxin-responsive protein family Plant GARDENPlant GARDEN JBrowse
GO BP
GO:0009733 [list] [network] response to auxin  (384 genes)  IEP  
GO CC
GO:0005739 [list] [network] mitochondrion  (4228 genes)  ISM  
GO MF
GO:0005515 [list] [network] protein binding  (5066 genes)  IPI  
KEGG ath04075 [list] [network] Plant hormone signal transduction (291 genes)
Protein NP_195596.1 
BLAST NP_195596.1 
Orthologous [Ortholog page] AT2G21200 (ath)AT2G21210 (ath)SAUR26 (ath)SAUR27 (ath)SAUR28 (ath)AT4G34770 (ath)AT4G34790 (ath)AT4G34810 (ath)AT4G38840 (ath)SAUR22 (ath)SAUR23 (ath)SAUR19 (ath)SAUR20 (ath)AT5G18030 (ath)LOC4344531 (osa)AT4G38825 (ath)LOC7453611 (ppo)LOC7453616 (ppo)LOC7453619 (ppo)LOC7453621 (ppo)LOC7453623 (ppo)LOC7463978 (ppo)LOC7463979 (ppo)LOC7463980 (ppo)LOC7477849 (ppo)LOC7477850 (ppo)LOC7477851 (ppo)LOC7494278 (ppo)LOC7494281 (ppo)LOC7494283 (ppo)LOC7494285 (ppo)LOC7494286 (ppo)LOC7494287 (ppo)LOC11413106 (mtr)LOC11422795 (mtr)LOC11437674 (mtr)LOC11438950 (mtr)LOC11439583 (mtr)LOC11439661 (mtr)LOC11440204 (mtr)LOC11440224 (mtr)LOC11440225 (mtr)LOC11440226 (mtr)LOC11440228 (mtr)LOC11440594 (mtr)LOC11440613 (mtr)LOC11442478 (mtr)LOC11443218 (mtr)LOC11443225 (mtr)LOC11443609 (mtr)LOC11444161 (mtr)LOC11444193 (mtr)LOC11444364 (mtr)LOC11445398 (mtr)LOC11445399 (mtr)LOC11445400 (mtr)LOC18097894 (ppo)LOC18110006 (ppo)LOC25502486 (mtr)LOC25502487 (mtr)SAUR29 (ath)AT4G34800 (ath)SAUR24 (ath)LOC100306459 (gma)LOC100500377 (gma)LOC100500483 (gma)LOC100500615 (gma)LOC100526895 (gma)LOC100527277 (gma)LOC100527820 (gma)LOC100775873 (gma)LOC100776943 (gma)LOC100777479 (gma)LOC100778121 (gma)LOC100779223 (gma)LOC100780289 (gma)LOC100781277 (gma)LOC100782363 (gma)LOC100783438 (gma)LOC100784233 (gma)LOC100785114 (gma)LOC100786095 (gma)LOC100786685 (gma)LOC100787155 (gma)LOC100787768 (gma)LOC100789272 (gma)LOC100789280 (gma)LOC100793401 (gma)LOC100793927 (gma)LOC100795597 (gma)LOC100797634 (gma)LOC100797800 (gma)LOC100798690 (gma)LOC100802934 (gma)LOC100803474 (gma)LOC100806671 (gma)LOC100811334 (gma)LOC100814912 (gma)LOC100815438 (gma)LOC100815976 (gma)LOC100816803 (gma)LOC100817347 (gma)LOC100817559 (gma)LOC100817568 (gma)LOC100820621 (gma)LOC101055584 (sly)LOC101243847 (sly)LOC101244440 (sly)LOC101247761 (sly)LOC101248621 (sly)LOC101249685 (sly)LOC101249687 (sly)LOC101249968 (sly)LOC101251524 (sly)LOC101251827 (sly)LOC101267669 (sly)LOC102662892 (gma)LOC102663761 (gma)LOC103828085 (bra)LOC103834323 (bra)LOC103834391 (bra)LOC103834414 (bra)LOC103834513 (bra)LOC103834524 (bra)LOC103834602 (bra)LOC103845871 (bra)LOC103845872 (bra)LOC103845874 (bra)LOC103845876 (bra)LOC103845877 (bra)LOC103845878 (bra)LOC103845879 (bra)LOC103845880 (bra)LOC103845881 (bra)LOC103845882 (bra)LOC103845883 (bra)LOC103851147 (bra)LOC103851148 (bra)LOC103851150 (bra)LOC103851151 (bra)LOC103851152 (bra)LOC103851153 (bra)LOC103851154 (bra)LOC103851155 (bra)LOC103851156 (bra)LOC103851158 (bra)LOC103854000 (bra)LOC103854001 (bra)LOC103856275 (bra)LOC103856276 (bra)LOC103856277 (bra)LOC103856278 (bra)LOC103856279 (bra)LOC103856281 (bra)LOC103856282 (bra)LOC103856290 (bra)LOC103857635 (bra)LOC103862374 (bra)LOC103862378 (bra)LOC104644302 (sly)LOC104645434 (sly)LOC104645435 (sly)LOC104645436 (sly)LOC104645438 (sly)LOC104645439 (sly)LOC106794448 (gma)LOC106794512 (gma)LOC106795237 (gma)LOC106795238 (gma)LOC106795371 (gma)LOC106798359 (gma)LOC106798970 (gma)LOC106798972 (gma)LOC106798973 (gma)LOC106798974 (gma)LOC106799178 (gma)LOC107277215 (osa)LOC108871385 (bra)LOC109118704 (sly)LOC112326013 (ppo)LOC112940306 (sly)LOC112940538 (sly)LOC112941374 (sly)LOC112997793 (gma)LOC112997795 (gma)LOC112997796 (gma)LOC112997797 (gma)LOC112998524 (gma)LOC112998525 (gma)LOC112998536 (gma)LOC112998537 (gma)LOC112998546 (gma)LOC112998555 (gma)LOC112998583 (gma)LOC112998584 (gma)LOC113001050 (gma)LOC113001439 (gma)LOC113001848 (gma)LOC113001933 (gma)LOC113001953 (gma)LOC113001954 (gma)LOC113001957 (gma)LOC113001958 (gma)LOC113001959 (gma)LOC113001961 (gma)LOC113001962 (gma)LOC113001963 (gma)LOC113001965 (gma)LOC113001966 (gma)LOC113002344 (gma)LOC113002386 (gma)LOC120580015 (mtr)LOC120580119 (mtr)LOC120580261 (mtr)LOC121172779 (gma)LOC121172857 (gma)LOC121175301 (gma)LOC123151027 (tae)LOC123152372 (tae)LOC123158006 (tae)LOC123159726 (tae)LOC123167063 (tae)LOC123168365 (tae)LOC123411059 (hvu)LOC123411060 (hvu)
Subcellular
localization
wolf
nucl 4,  cyto_nucl 3,  mito 2,  chlo 1,  mito_plas 1  (predict for NP_195596.1)
Subcellular
localization
TargetP
mito 5  (predict for NP_195596.1)
Gene coexpression
Network*for
coexpressed
genes
LCNloc
[Cytoscape]
KEGG* ID Title #genes Link to the KEGG* map
(Multiple genes)
ath04075 Plant hormone signal transduction 12
Genes directly connected with SAUR15 on the network
coex z* Locus Function* CoexViewer Entrez Gene ID*
17.5 AT1G29460 SAUR-like auxin-responsive protein family [detail] 839822
17.4 AT1G29450 SAUR-like auxin-responsive protein family [detail] 839821
16.0 SAUR27 SAUR-like auxin-responsive protein family [detail] 821121
13.8 AT4G38860 SAUR-like auxin-responsive protein family [detail] 830041
12.4 AT4G38840 SAUR-like auxin-responsive protein family [detail] 830039
9.4 PRE1 basic helix-loop-helix (bHLH) DNA-binding family protein [detail] 833982
8.0 RGF9 root meristem growth factor [detail] 836598
Coexpressed
gene list
[Coexpressed gene list for SAUR15]
Gene expression
All samples [Expression pattern for all samples]
AtGenExpress*
(Development)
252970_at
252970_at.png

X axis is samples (pdf file), and Y axis is log2-expression.
"1st Q", "mean" and "3rd Q" indecate the values for all genes on a GeneChip. Q: quartile.

AtGenExpress*
(Stress)
252970_at
252970_at.png

X axis is samples (pdf file), and Y axis is log2-expression.

AtGenExpress*
(Hormone)
252970_at
252970_at.png

X axis is samples (xls file), and Y axis is log-expression.

Link to other DBs
Entrez Gene ID 830040    
Refseq ID (protein) NP_195596.1 


The preparation time of this page was 0.1 [sec].