[←][→] ath   At4g40030 Gene
functional annotation
Function   Histone superfamily protein    Plant GARDEN Plant GARDEN JBrowse
GO BP
GO:0080111 [list] [network] DNA demethylation  (19 genes)  IGI  
GO CC
GO:0000786 [list] [network] nucleosome  (9 genes)  IEA  
GO:0005886 [list] [network] plasma membrane  (2529 genes)  HDA  
GO:0005634 [list] [network] nucleus  (10305 genes)  ISM  
GO MF
GO:0030527 [list] [network] structural constituent of chromatin  (16 genes)  IEA  
GO:0046982 [list] [network] protein heterodimerization activity  (97 genes)  IEA  
GO:0003677 [list] [network] DNA binding  (1277 genes)  IEA  
KEGG
Protein NP_001078516.1  NP_001078517.1  NP_001328124.1  NP_195713.1 
BLAST NP_001078516.1  NP_001078517.1  NP_001328124.1  NP_195713.1 
Orthologous [Ortholog page] LOC544102 (sly)  AT3G27360 (ath)  AT4G40040 (ath)  AT5G10390 (ath)  AT5G10400 (ath)  AT5G10980 (ath)  HTR11 (ath)  AT5G65360 (ath)  AT1G09200 (ath)  AT1G13370 (ath)  MGH3 (ath)  AT1G75600 (ath)  LOC4325069 (osa)  LOC4333019 (osa)  LOC4336000 (osa)  LOC4338913 (osa)  LOC4340006 (osa)  LOC4340203 (osa)  LOC4349820 (osa)  LOC7455189 (ppo)  LOC7458004 (ppo)  LOC7466789 (ppo)  LOC7477652 (ppo)  LOC7490669 (ppo)  LOC7493256 (ppo)  LOC7495534 (ppo)  LOC7496045 (ppo)  LOC9269345 (osa)  LOC9271591 (osa)  LOC11405531 (mtr)  LOC11408671 (mtr)  LOC11409321 (mtr)  LOC11409357 (mtr)  LOC11409976 (mtr)  LOC11410249 (mtr)  LOC11413536 (mtr)  LOC11419237 (mtr)  LOC11430310 (mtr)  LOC11430980 (mtr)  LOC11433985 (mtr)  LOC11435575 (mtr)  LOC11436749 (mtr)  LOC11437960 (mtr)  LOC18094306 (ppo)  LOC18096107 (ppo)  LOC18097281 (ppo)  LOC18099681 (ppo)  LOC25492607 (mtr)  LOC25493065 (mtr)  LOC25493536 (mtr)  LOC25502181 (mtr)  LOC25502270 (mtr)  LOC100305466 (gma)  LOC100306416 (gma)  LOC100781420 (gma)  LOC100783277 (gma)  LOC100783845 (gma)  LOC100785082 (gma)  LOC100788696 (gma)  LOC100789332 (gma)  LOC100797506 (gma)  LOC100807058 (gma)  LOC100809785 (gma)  LOC100810646 (gma)  LOC100817768 (gma)  LOC100818932 (gma)  LOC101245793 (sly)  LOC101250929 (sly)  LOC101252717 (sly)  LOC101253224 (sly)  LOC101254197 (sly)  LOC101260571 (sly)  LOC101262275 (sly)  LOC101263309 (sly)  LOC101263845 (sly)  LOC101267861 (sly)  LOC101268556 (sly)  LOC102661475 (gma)  LOC102669107 (gma)  LOC103830640 (bra)  LOC103836349 (bra)  LOC103837572 (bra)  LOC103839289 (bra)  LOC103850291 (bra)  LOC103850326 (bra)  LOC103852966 (bra)  LOC103854530 (bra)  LOC103854831 (bra)  LOC103855863 (bra)  LOC103855894 (bra)  LOC107276414 (osa)  LOC112326641 (ppo)  LOC112326872 (ppo)  LOC123045447 (tae)  LOC123045621 (tae)  LOC123053099 (tae)  LOC123053276 (tae)  LOC123053464 (tae)  LOC123056226 (tae)  LOC123057731 (tae)  LOC123060632 (tae)  LOC123062714 (tae)  LOC123064940 (tae)  LOC123064951 (tae)  LOC123065019 (tae)  LOC123065156 (tae)  LOC123065167 (tae)  LOC123077766 (tae)  LOC123079871 (tae)  LOC123083067 (tae)  LOC123084869 (tae)  LOC123085076 (tae)  LOC123088195 (tae)  LOC123088199 (tae)  LOC123088208 (tae)  LOC123093219 (tae)  LOC123098255 (tae)  LOC123098485 (tae)  LOC123111760 (tae)  LOC123121324 (tae)  LOC123125859 (tae)  LOC123129777 (tae)  LOC123129797 (tae)  LOC123130177 (tae)  LOC123131739 (tae)  LOC123131853 (tae)  LOC123134870 (tae)  LOC123135593 (tae)  LOC123137526 (tae)  LOC123142494 (tae)  LOC123143161 (tae)  LOC123143162 (tae)  LOC123150061 (tae)  LOC123150701 (tae)  LOC123150820 (tae)  LOC123154129 (tae)  LOC123156021 (tae)  LOC123157145 (tae)  LOC123157517 (tae)  LOC123159021 (tae)  LOC123161499 (tae)  LOC123166502 (tae)  LOC123166703 (tae)  LOC123167174 (tae)  LOC123167447 (tae)  LOC123169031 (tae)  LOC123169919 (tae)  LOC123172808 (tae)  LOC123189368 (tae)  LOC123401492 (hvu)  LOC123402877 (hvu)  LOC123406049 (hvu)  LOC123407026 (hvu)  LOC123407027 (hvu)  LOC123407571 (hvu)  LOC123407579 (hvu)  LOC123407601 (hvu)  LOC123407840 (hvu)  LOC123407879 (hvu)  LOC123407880 (hvu)  LOC123409950 (hvu)  LOC123410250 (hvu)  LOC123410467 (hvu)  LOC123410874 (hvu)  LOC123411359 (hvu)  LOC123411529 (hvu)  LOC123413075 (hvu)  LOC123413076 (hvu)  LOC123413522 (hvu)  LOC123424186 (hvu)  LOC123426702 (hvu)  LOC123426872 (hvu)  LOC123426873 (hvu)  LOC123427282 (hvu)  LOC123440459 (hvu)  LOC123440480 (hvu)  LOC123444127 (hvu)  LOC123444237 (hvu)  LOC123444810 (hvu)  LOC123446355 (hvu)  LOC123449322 (hvu)  LOC123449497 (hvu)  LOC123452879 (hvu) 
Subcellular
localization
wolf
cyto 6,  nucl 4  (predict for NP_001078516.1)
nucl 8,  chlo 1  (predict for NP_001078517.1)
nucl 8,  chlo 1  (predict for NP_001328124.1)
nucl 8,  chlo 1  (predict for NP_195713.1)
Subcellular
localization
TargetP
chlo 3  (predict for NP_001078516.1)
chlo 6,  mito 3  (predict for NP_001078517.1)
chlo 6,  mito 3  (predict for NP_001328124.1)
chlo 6,  mito 3  (predict for NP_195713.1)
Gene coexpression
Network*for
coexpressed
genes
LCNloc
[Cytoscape]
Genes directly connected with AT4G40030 on the network
coex z* Locus Function* CoexViewer Entrez Gene ID*
10.2 AT4G40040 Histone superfamily protein [detail] 830165
5.7 AT2G30620 winged-helix DNA-binding transcription factor family protein [detail] 817612
5.3 AT5G42190 E3 ubiquitin ligase SCF complex subunit SKP1/ASK1 family protein [detail] 834224
Coexpressed
gene list		 [Coexpressed gene list for AT4G40030]
Gene expression
All samples [Expression pattern for all samples]
AtGenExpress*
(Development)
252824_at
252824_at.png

X axis is samples (pdf file), and Y axis is log2-expression.
"1st Q", "mean" and "3rd Q" indecate the values for all genes on a GeneChip. Q: quartile.

AtGenExpress*
(Stress)
252824_at
252824_at.png

X axis is samples (pdf file), and Y axis is log2-expression.
AtGenExpress*
(Hormone)
252824_at
252824_at.png

X axis is samples (xls file), and Y axis is log-expression.
Link to other DBs
Entrez Gene ID 830164      
Refseq ID (protein) NP_001078516.1 
NP_001078517.1 
NP_001328124.1 
NP_195713.1 


The preparation time of this page was 0.2 [sec].