[][] ath   At5g09810 Gene
functional annotation
Function   actin 7
GO BP
GO:0006893 [list] [network] Golgi to plasma membrane transport  (7 genes)  IMP  
GO:0048767 [list] [network] root hair elongation  (78 genes)  IMP  
GO:0009845 [list] [network] seed germination  (99 genes)  IMP  
GO:0010053 [list] [network] root epidermal cell differentiation  (172 genes)  IMP  
GO:0007010 [list] [network] cytoskeleton organization  (205 genes)  TAS  
GO:0009733 [list] [network] response to auxin  (384 genes)  IEP  
GO:0008104 [list] [network] protein localization  (419 genes)  IMP  
GO:0051301 [list] [network] cell division  (442 genes)  IMP  
GO:0009611 [list] [network] response to wounding  (816 genes)  IEP  
GO:0048364 [list] [network] root development  (1192 genes)  IMP  
GO:0009416 [list] [network] response to light stimulus  (1981 genes)  IEP  
GO CC
GO:0005856 [list] [network] cytoskeleton  (230 genes)  ISS  
GO:0005730 [list] [network] nucleolus  (387 genes)  HDA  
GO:0009505 [list] [network] plant-type cell wall  (498 genes)  HDA  
GO:0009941 [list] [network] chloroplast envelope  (582 genes)  HDA  
GO:0009570 [list] [network] chloroplast stroma  (705 genes)  HDA  
GO:0009506 [list] [network] plasmodesma  (871 genes)  HDA  
GO:0005886 [list] [network] plasma membrane  (2529 genes)  HDA  
GO:0005829 [list] [network] cytosol  (2559 genes)  HDA IDA  
GO:0005739 [list] [network] mitochondrion  (4228 genes)  HDA  
GO:0005737 [list] [network] cytoplasm  (13880 genes)  ISM  
GO MF
GO:0005200 [list] [network] structural constituent of cytoskeleton  (24 genes)  ISS  
GO:0005515 [list] [network] protein binding  (5066 genes)  IPI  
KEGG
Protein NP_196543.1 
BLAST NP_196543.1 
Orthologous [Ortholog page] LOC542814 (tae)LOC543120 (tae)ACT1 (ath)ACT9 (ath)AT2G42100 (ath)AT2G42170 (ath)ACT11 (ath)ACT2 (ath)ACT12 (ath)ACT3 (ath)ACT4 (ath)ACT8 (ath)LOC4325068 (osa)LOC4333919 (osa)LOC4334702 (osa)LOC4337566 (osa)LOC4338914 (osa)LOC4349087 (osa)LOC4349863 (osa)LOC4351585 (osa)LOC4352927 (osa)LOC7458147 (ppo)LOC7467546 (ppo)LOC7479526 (ppo)LOC7483974 (ppo)LOC7489063 (ppo)LOC7490729 (ppo)LOC7492024 (ppo)LOC9269066 (osa)LOC11425201 (mtr)LOC11428527 (mtr)LOC11431140 (mtr)LOC11441933 (mtr)LOC18100314 (ppo)LOC18108099 (ppo)LOC25479628 (mtr)LOC25487878 (mtr)LOC25495077 (mtr)LOC100777460 (gma)LOC100777705 (gma)LOC100778206 (gma)LOC100781142 (gma)LOC100781831 (gma)LOC100787265 (gma)LOC100789000 (gma)LOC100792119 (gma)LOC100797704 (gma)LOC100798052 (gma)SOY69 (gma)LOC100799890 (gma)LOC100806695 (gma)LOC100807341 (gma)LOC100811630 (gma)LOC100813210 (gma)LOC100813437 (gma)LOC100815472 (gma)LOC101249734 (sly)LOC101250165 (sly)LOC101253675 (sly)LOC101255046 (sly)LOC101255728 (sly)actin (sly)LOC101262163 (sly)Tom52 (sly)LOC101264220 (sly)ACT (sly)LOC101264618 (sly)LOC103838412 (bra)LOC103841298 (bra)LOC103845362 (bra)LOC103846860 (bra)LOC103850356 (bra)LOC103851581 (bra)LOC103855835 (bra)LOC103856636 (bra)LOC103857724 (bra)LOC103859774 (bra)LOC103863285 (bra)LOC103865617 (bra)LOC103867177 (bra)ACT1 (bra)LOC103870277 (bra)LOC103873303 (bra)LOC103873596 (bra)LOC103873698 (bra)LOC112325314 (ppo)LOC123048645 (tae)LOC123057740 (tae)LOC123062711 (tae)LOC123071529 (tae)LOC123079869 (tae)LOC123087081 (tae)LOC123090883 (tae)LOC123095909 (tae)LOC123101898 (tae)LOC123102963 (tae)LOC123103657 (tae)LOC123110037 (tae)LOC123111117 (tae)LOC123114174 (tae)LOC123119001 (tae)LOC123120107 (tae)LOC123123661 (tae)LOC123124811 (tae)LOC123179078 (tae)LOC123179877 (tae)LOC123181307 (tae)LOC123182166 (tae)LOC123185737 (tae)LOC123394939 (hvu)LOC123398932 (hvu)LOC123399877 (hvu)LOC123430406 (hvu)LOC123434401 (hvu)LOC123444811 (hvu)LOC123446308 (hvu)LOC123447531 (hvu)
Subcellular
localization
wolf
cysk 10  (predict for NP_196543.1)
Subcellular
localization
TargetP
other 8  (predict for NP_196543.1)
Gene coexpression
Network*for
coexpressed
genes
LCNloc
[Cytoscape]
KEGG* ID Title #genes Link to the KEGG* map
(Multiple genes)
ath03050 Proteasome 3
Genes directly connected with ACT7 on the network
coex z* Locus Function* CoexViewer Entrez Gene ID*
7.2 KAB1 potassium channel beta subunit 1 [detail] 839450
7.0 ATS9 non-ATPase subunit 9 [detail] 839789
6.9 AT4G12650 Endomembrane protein 70 protein family [detail] 826878
Coexpressed
gene list
[Coexpressed gene list for ACT7]
Gene expression
All samples [Expression pattern for all samples]
AtGenExpress*
(Development)
AFFX-Athal-Actin_3_f_at
AFFX-Athal-Actin_3_f_at.png

X axis is samples (pdf file), and Y axis is log2-expression.
"1st Q", "mean" and "3rd Q" indecate the values for all genes on a GeneChip. Q: quartile.

AtGenExpress*
(Stress)
AFFX-Athal-Actin_3_f_at
AFFX-Athal-Actin_3_f_at.png

X axis is samples (pdf file), and Y axis is log2-expression.

AtGenExpress*
(Hormone)
AFFX-Athal-Actin_3_f_at
AFFX-Athal-Actin_3_f_at.png

X axis is samples (xls file), and Y axis is log-expression.

Link to other DBs
Entrez Gene ID 830841    
Refseq ID (protein) NP_196543.1 


The preparation time of this page was 0.1 [sec].