[←][→] ath   At5g10400 Gene
functional annotation
Function   Histone superfamily protein    Plant GARDEN Plant GARDEN JBrowse
GO BP
GO CC
GO:0005886 [list] [network] plasma membrane  (2529 genes)  HDA  
GO:0005634 [list] [network] nucleus  (10305 genes)  ISM  
GO MF
KEGG
Protein NP_568228.1 
BLAST NP_568228.1 
Orthologous [Ortholog page] LOC544102 (sly)  AT3G27360 (ath)  AT4G40030 (ath)  AT4G40040 (ath)  AT5G10390 (ath)  AT5G10980 (ath)  HTR11 (ath)  AT5G65360 (ath)  AT1G09200 (ath)  AT1G13370 (ath)  MGH3 (ath)  AT1G75600 (ath)  LOC4325069 (osa)  LOC4333019 (osa)  LOC4336000 (osa)  LOC4338913 (osa)  LOC4340006 (osa)  LOC4340203 (osa)  LOC4349820 (osa)  LOC7455189 (ppo)  LOC7458004 (ppo)  LOC7466789 (ppo)  LOC7477652 (ppo)  LOC7490669 (ppo)  LOC7493256 (ppo)  LOC7495534 (ppo)  LOC7496045 (ppo)  LOC9269345 (osa)  LOC9271591 (osa)  LOC11405531 (mtr)  LOC11408671 (mtr)  LOC11409321 (mtr)  LOC11409357 (mtr)  LOC11409976 (mtr)  LOC11410249 (mtr)  LOC11413536 (mtr)  LOC11419237 (mtr)  LOC11430310 (mtr)  LOC11430980 (mtr)  LOC11433985 (mtr)  LOC11435575 (mtr)  LOC11436749 (mtr)  LOC11437960 (mtr)  LOC18094306 (ppo)  LOC18096107 (ppo)  LOC18097281 (ppo)  LOC18099681 (ppo)  LOC25492607 (mtr)  LOC25493065 (mtr)  LOC25493536 (mtr)  LOC25502181 (mtr)  LOC25502270 (mtr)  LOC100305466 (gma)  LOC100306416 (gma)  LOC100781420 (gma)  LOC100783277 (gma)  LOC100783845 (gma)  LOC100785082 (gma)  LOC100788696 (gma)  LOC100789332 (gma)  LOC100797506 (gma)  LOC100807058 (gma)  LOC100809785 (gma)  LOC100810646 (gma)  LOC100817768 (gma)  LOC100818932 (gma)  LOC101245793 (sly)  LOC101250929 (sly)  LOC101252717 (sly)  LOC101253224 (sly)  LOC101254197 (sly)  LOC101260571 (sly)  LOC101262275 (sly)  LOC101263309 (sly)  LOC101263845 (sly)  LOC101267861 (sly)  LOC101268556 (sly)  LOC102661475 (gma)  LOC102669107 (gma)  LOC103830640 (bra)  LOC103836349 (bra)  LOC103837572 (bra)  LOC103839289 (bra)  LOC103850291 (bra)  LOC103850326 (bra)  LOC103852966 (bra)  LOC103854530 (bra)  LOC103854831 (bra)  LOC103855863 (bra)  LOC103855894 (bra)  LOC107276414 (osa)  LOC112326641 (ppo)  LOC112326872 (ppo)  LOC123045447 (tae)  LOC123045621 (tae)  LOC123053099 (tae)  LOC123053276 (tae)  LOC123053464 (tae)  LOC123056226 (tae)  LOC123057731 (tae)  LOC123060632 (tae)  LOC123062714 (tae)  LOC123064940 (tae)  LOC123064951 (tae)  LOC123065019 (tae)  LOC123065156 (tae)  LOC123065167 (tae)  LOC123077766 (tae)  LOC123079871 (tae)  LOC123083067 (tae)  LOC123084869 (tae)  LOC123085076 (tae)  LOC123088195 (tae)  LOC123088199 (tae)  LOC123088208 (tae)  LOC123093219 (tae)  LOC123098255 (tae)  LOC123098485 (tae)  LOC123111760 (tae)  LOC123121324 (tae)  LOC123125859 (tae)  LOC123129777 (tae)  LOC123129797 (tae)  LOC123130177 (tae)  LOC123131739 (tae)  LOC123131853 (tae)  LOC123134870 (tae)  LOC123135593 (tae)  LOC123137526 (tae)  LOC123142494 (tae)  LOC123143161 (tae)  LOC123143162 (tae)  LOC123150061 (tae)  LOC123150701 (tae)  LOC123150820 (tae)  LOC123154129 (tae)  LOC123156021 (tae)  LOC123157145 (tae)  LOC123157517 (tae)  LOC123159021 (tae)  LOC123161499 (tae)  LOC123166502 (tae)  LOC123166703 (tae)  LOC123167174 (tae)  LOC123167447 (tae)  LOC123169031 (tae)  LOC123169919 (tae)  LOC123172808 (tae)  LOC123189368 (tae)  LOC123401492 (hvu)  LOC123402877 (hvu)  LOC123406049 (hvu)  LOC123407026 (hvu)  LOC123407027 (hvu)  LOC123407571 (hvu)  LOC123407579 (hvu)  LOC123407601 (hvu)  LOC123407840 (hvu)  LOC123407879 (hvu)  LOC123407880 (hvu)  LOC123409950 (hvu)  LOC123410250 (hvu)  LOC123410467 (hvu)  LOC123410874 (hvu)  LOC123411359 (hvu)  LOC123411529 (hvu)  LOC123413075 (hvu)  LOC123413076 (hvu)  LOC123413522 (hvu)  LOC123424186 (hvu)  LOC123426702 (hvu)  LOC123426872 (hvu)  LOC123426873 (hvu)  LOC123427282 (hvu)  LOC123440459 (hvu)  LOC123440480 (hvu)  LOC123444127 (hvu)  LOC123444237 (hvu)  LOC123444810 (hvu)  LOC123446355 (hvu)  LOC123449322 (hvu)  LOC123449497 (hvu)  LOC123452879 (hvu) 
Subcellular
localization
wolf
nucl 8,  chlo 1  (predict for NP_568228.1)
Subcellular
localization
TargetP
chlo 7,  mito 3  (predict for NP_568228.1)
Gene coexpression
Network*for
coexpressed
genes
LCNloc
[Cytoscape]
Genes directly connected with AT5G10400 on the network
coex z* Locus Function* CoexViewer Entrez Gene ID*
17.4 HTA6 histone H2A 6 [detail] 836109
17.2 AT1G09200 Histone superfamily protein [detail] 837440
16.9 AT5G65360 Histone superfamily protein [detail] 836661
15.6 AT3G27360 Histone superfamily protein [detail] 822357
10.5 AT3G53650 Histone superfamily protein [detail] 28719403
6.0 HMGA high mobility group A [detail] 838055
Coexpressed
gene list		 [Coexpressed gene list for AT5G10400]
Gene expression
All samples [Expression pattern for all samples]
AtGenExpress*
(Development)
250433_at
250433_at.png

X axis is samples (pdf file), and Y axis is log2-expression.
"1st Q", "mean" and "3rd Q" indecate the values for all genes on a GeneChip. Q: quartile.

AtGenExpress*
(Stress)
250433_at
250433_at.png

X axis is samples (pdf file), and Y axis is log2-expression.
AtGenExpress*
(Hormone)
250433_at
250433_at.png

X axis is samples (xls file), and Y axis is log-expression.
Link to other DBs
Entrez Gene ID 830904      
Refseq ID (protein) NP_568228.1 


The preparation time of this page was 0.1 [sec].