[←][→] ath   At5g10980 Gene
functional annotation
Function   Histone superfamily protein    Plant GARDEN Plant GARDEN JBrowse
GO BP
GO:0080111 [list] [network] DNA demethylation  (19 genes)  IGI  
GO CC
GO:0030875 [list] [network] rDNA protrusion  (5 genes)  IDA  
GO:0005730 [list] [network] nucleolus  (387 genes)  IDA  
GO:0005886 [list] [network] plasma membrane  (2529 genes)  HDA  
GO:0005634 [list] [network] nucleus  (10305 genes)  IDA ISM  
GO MF
GO:0030527 [list] [network] structural constituent of chromatin  (16 genes)  IEA  
GO:0046982 [list] [network] protein heterodimerization activity  (97 genes)  IEA  
GO:0005515 [list] [network] protein binding  (5066 genes)  IPI  
KEGG
Protein NP_196659.1 
BLAST NP_196659.1 
Orthologous [Ortholog page] LOC544102 (sly)  AT3G27360 (ath)  AT4G40030 (ath)  AT4G40040 (ath)  AT5G10390 (ath)  AT5G10400 (ath)  HTR11 (ath)  AT5G65360 (ath)  AT1G09200 (ath)  AT1G13370 (ath)  MGH3 (ath)  AT1G75600 (ath)  LOC4325069 (osa)  LOC4333019 (osa)  LOC4336000 (osa)  LOC4338913 (osa)  LOC4340006 (osa)  LOC4340203 (osa)  LOC4349820 (osa)  LOC7455189 (ppo)  LOC7458004 (ppo)  LOC7466789 (ppo)  LOC7477652 (ppo)  LOC7490669 (ppo)  LOC7493256 (ppo)  LOC7495534 (ppo)  LOC7496045 (ppo)  LOC9269345 (osa)  LOC9271591 (osa)  LOC11405531 (mtr)  LOC11408671 (mtr)  LOC11409321 (mtr)  LOC11409357 (mtr)  LOC11409976 (mtr)  LOC11410249 (mtr)  LOC11413536 (mtr)  LOC11419237 (mtr)  LOC11430310 (mtr)  LOC11430980 (mtr)  LOC11433985 (mtr)  LOC11435575 (mtr)  LOC11436749 (mtr)  LOC11437960 (mtr)  LOC18094306 (ppo)  LOC18096107 (ppo)  LOC18097281 (ppo)  LOC18099681 (ppo)  LOC25492607 (mtr)  LOC25493065 (mtr)  LOC25493536 (mtr)  LOC25502181 (mtr)  LOC25502270 (mtr)  LOC100305466 (gma)  LOC100306416 (gma)  LOC100781420 (gma)  LOC100783277 (gma)  LOC100783845 (gma)  LOC100785082 (gma)  LOC100788696 (gma)  LOC100789332 (gma)  LOC100797506 (gma)  LOC100807058 (gma)  LOC100809785 (gma)  LOC100810646 (gma)  LOC100817768 (gma)  LOC100818932 (gma)  LOC101245793 (sly)  LOC101250929 (sly)  LOC101252717 (sly)  LOC101253224 (sly)  LOC101254197 (sly)  LOC101260571 (sly)  LOC101262275 (sly)  LOC101263309 (sly)  LOC101263845 (sly)  LOC101267861 (sly)  LOC101268556 (sly)  LOC102661475 (gma)  LOC102669107 (gma)  LOC103830640 (bra)  LOC103836349 (bra)  LOC103837572 (bra)  LOC103839289 (bra)  LOC103850291 (bra)  LOC103850326 (bra)  LOC103852966 (bra)  LOC103854530 (bra)  LOC103854831 (bra)  LOC103855863 (bra)  LOC103855894 (bra)  LOC107276414 (osa)  LOC112326641 (ppo)  LOC112326872 (ppo)  LOC123045447 (tae)  LOC123045621 (tae)  LOC123053099 (tae)  LOC123053276 (tae)  LOC123053464 (tae)  LOC123056226 (tae)  LOC123057731 (tae)  LOC123060632 (tae)  LOC123062714 (tae)  LOC123064940 (tae)  LOC123064951 (tae)  LOC123065019 (tae)  LOC123065156 (tae)  LOC123065167 (tae)  LOC123077766 (tae)  LOC123079871 (tae)  LOC123083067 (tae)  LOC123084869 (tae)  LOC123085076 (tae)  LOC123088195 (tae)  LOC123088199 (tae)  LOC123088208 (tae)  LOC123093219 (tae)  LOC123098255 (tae)  LOC123098485 (tae)  LOC123111760 (tae)  LOC123121324 (tae)  LOC123125859 (tae)  LOC123129777 (tae)  LOC123129797 (tae)  LOC123130177 (tae)  LOC123131739 (tae)  LOC123131853 (tae)  LOC123134870 (tae)  LOC123135593 (tae)  LOC123137526 (tae)  LOC123142494 (tae)  LOC123143161 (tae)  LOC123143162 (tae)  LOC123150061 (tae)  LOC123150701 (tae)  LOC123150820 (tae)  LOC123154129 (tae)  LOC123156021 (tae)  LOC123157145 (tae)  LOC123157517 (tae)  LOC123159021 (tae)  LOC123161499 (tae)  LOC123166502 (tae)  LOC123166703 (tae)  LOC123167174 (tae)  LOC123167447 (tae)  LOC123169031 (tae)  LOC123169919 (tae)  LOC123172808 (tae)  LOC123189368 (tae)  LOC123401492 (hvu)  LOC123402877 (hvu)  LOC123406049 (hvu)  LOC123407026 (hvu)  LOC123407027 (hvu)  LOC123407571 (hvu)  LOC123407579 (hvu)  LOC123407601 (hvu)  LOC123407840 (hvu)  LOC123407879 (hvu)  LOC123407880 (hvu)  LOC123409950 (hvu)  LOC123410250 (hvu)  LOC123410467 (hvu)  LOC123410874 (hvu)  LOC123411359 (hvu)  LOC123411529 (hvu)  LOC123413075 (hvu)  LOC123413076 (hvu)  LOC123413522 (hvu)  LOC123424186 (hvu)  LOC123426702 (hvu)  LOC123426872 (hvu)  LOC123426873 (hvu)  LOC123427282 (hvu)  LOC123440459 (hvu)  LOC123440480 (hvu)  LOC123444127 (hvu)  LOC123444237 (hvu)  LOC123444810 (hvu)  LOC123446355 (hvu)  LOC123449322 (hvu)  LOC123449497 (hvu)  LOC123452879 (hvu) 
Subcellular
localization
wolf
nucl 8,  chlo 1  (predict for NP_196659.1)
Subcellular
localization
TargetP
chlo 6,  mito 3  (predict for NP_196659.1)
Gene coexpression
Network*for
coexpressed
genes
LCNloc
[Cytoscape]
Genes directly connected with AT5G10980 on the network
coex z* Locus Function* CoexViewer Entrez Gene ID*
13.3 AT3G53730 Histone superfamily protein [detail] 824540
12.1 AT1G06760 winged-helix DNA-binding transcription factor family protein [detail] 837187
11.9 RAT5 Histone superfamily protein [detail] 835553
10.9 AT4G40040 Histone superfamily protein [detail] 830165
Coexpressed
gene list		 [Coexpressed gene list for AT5G10980]
Gene expression
All samples [Expression pattern for all samples]
AtGenExpress*
(Development)
250397_at
250397_at.png

X axis is samples (pdf file), and Y axis is log2-expression.
"1st Q", "mean" and "3rd Q" indecate the values for all genes on a GeneChip. Q: quartile.

AtGenExpress*
(Stress)
250397_at
250397_at.png

X axis is samples (pdf file), and Y axis is log2-expression.
AtGenExpress*
(Hormone)
250397_at
250397_at.png

X axis is samples (xls file), and Y axis is log-expression.
Link to other DBs
Entrez Gene ID 830965      
Refseq ID (protein) NP_196659.1 


The preparation time of this page was 0.1 [sec].