[][] ath   At5g18600 Gene
functional annotation
Function   Thioredoxin superfamily protein Plant GARDENPlant GARDEN JBrowse
GO BP
GO:0000122 [list] [network] negative regulation of transcription by RNA polymerase II  (13 genes)  IDA  
GO CC
GO:0005737 [list] [network] cytoplasm  (13880 genes)  ISM  
GO MF
GO:0005515 [list] [network] protein binding  (5066 genes)  IPI  
KEGG
Protein NP_197361.1 
BLAST NP_197361.1 
Orthologous [Ortholog page] ROXY1 (ath)AT4G15660 (ath)AT4G15670 (ath)AT4G15680 (ath)AT4G15690 (ath)AT4G15700 (ath)ROXY2 (ath)LOC4325734 (osa)LOC4326522 (osa)LOC4329462 (osa)LOC4335686 (osa)LOC4352425 (osa)AT3G21460 (ath)LOC7456256 (ppo)LOC7460570 (ppo)LOC7475965 (ppo)LOC7496554 (ppo)LOC11409074 (mtr)LOC11411742 (mtr)LOC11415168 (mtr)LOC11438296 (mtr)LOC11440320 (mtr)LOC11440323 (mtr)LOC11441859 (mtr)LOC11443355 (mtr)LOC18101857 (ppo)LOC18101860 (ppo)LOC100784069 (gma)LOC100784603 (gma)LOC100790463 (gma)LOC100790980 (gma)LOC100797942 (gma)LOC100808865 (gma)LOC100810642 (gma)LOC100811183 (gma)LOC100815509 (gma)LOC100818015 (gma)LOC100818026 (gma)LOC101244989 (sly)LOC101245287 (sly)LOC101247917 (sly)LOC101263930 (sly)LOC101267713 (sly)LOC101268133 (sly)LOC103833517 (bra)LOC103833518 (bra)LOC103845821 (bra)LOC103846515 (bra)LOC103850910 (bra)LOC103851186 (bra)LOC103856057 (bra)LOC103856321 (bra)LOC103858882 (bra)LOC103859905 (bra)LOC103859906 (bra)LOC103870428 (bra)LOC103870440 (bra)LOC103870450 (bra)LOC103870461 (bra)LOC107276177 (osa)LOC112325098 (ppo)LOC112416785 (mtr)LOC112940699 (sly)LOC123041344 (tae)LOC123049339 (tae)LOC123059210 (tae)LOC123059215 (tae)LOC123059219 (tae)LOC123059220 (tae)LOC123063308 (tae)LOC123066419 (tae)LOC123066424 (tae)LOC123072283 (tae)LOC123072284 (tae)LOC123072285 (tae)LOC123075460 (tae)LOC123075468 (tae)LOC123075469 (tae)LOC123075470 (tae)LOC123075472 (tae)LOC123075473 (tae)LOC123096892 (tae)LOC123102637 (tae)LOC123106501 (tae)LOC123106502 (tae)LOC123106505 (tae)LOC123106506 (tae)LOC123106508 (tae)LOC123106509 (tae)LOC123106510 (tae)LOC123106511 (tae)LOC123106705 (tae)LOC123106706 (tae)LOC123106708 (tae)LOC123110822 (tae)LOC123115653 (tae)LOC123115654 (tae)LOC123115656 (tae)LOC123115657 (tae)LOC123115660 (tae)LOC123115661 (tae)LOC123115845 (tae)LOC123115847 (tae)LOC123115849 (tae)LOC123119393 (tae)LOC123124286 (tae)LOC123124287 (tae)LOC123124288 (tae)LOC123124289 (tae)LOC123124290 (tae)LOC123124291 (tae)LOC123124465 (tae)LOC123124466 (tae)LOC123124468 (tae)LOC123124469 (tae)LOC123185439 (tae)LOC123396032 (hvu)LOC123396033 (hvu)LOC123396779 (hvu)LOC123397775 (hvu)LOC123398308 (hvu)LOC123398814 (hvu)LOC123398816 (hvu)LOC123430220 (hvu)LOC123440812 (hvu)LOC123440814 (hvu)LOC123440816 (hvu)LOC123440817 (hvu)LOC123445378 (hvu)
Subcellular
localization
wolf
cyto 5,  chlo 3,  extr 1,  chlo_mito 1  (predict for NP_197361.1)
Subcellular
localization
TargetP
other 5  (predict for NP_197361.1)
Gene coexpression
Network*for
coexpressed
genes
LCNloc
[Cytoscape]
Genes directly connected with AT5G18600 on the network
coex z* Locus Function* CoexViewer Entrez Gene ID*
12.4 AT4G15690 Thioredoxin superfamily protein [detail] 827246
11.8 AT4G15700 Thioredoxin superfamily protein [detail] 827247
9.6 AT2G32880 TRAF-like family protein [detail] 817849
5.5 SPL4 squamosa promoter binding protein-like 4 [detail] 841749
Coexpressed
gene list
[Coexpressed gene list for AT5G18600]
Gene expression
All samples [Expression pattern for all samples]
AtGenExpress*
(Development)
249996_at
249996_at.png

X axis is samples (pdf file), and Y axis is log2-expression.
"1st Q", "mean" and "3rd Q" indecate the values for all genes on a GeneChip. Q: quartile.

AtGenExpress*
(Stress)
249996_at
249996_at.png

X axis is samples (pdf file), and Y axis is log2-expression.

AtGenExpress*
(Hormone)
249996_at
249996_at.png

X axis is samples (xls file), and Y axis is log-expression.

Link to other DBs
Entrez Gene ID 831978    
Refseq ID (protein) NP_197361.1 


The preparation time of this page was 0.1 [sec].