[←][→] ath   At5g38930 Gene
functional annotation
Function   RmlC-like cupins superfamily protein    Plant GARDEN Plant GARDEN JBrowse
GO BP
GO CC
GO:0009505 [list] [network] plant-type cell wall  (498 genes)  HDA  
GO:0005576 [list] [network] extracellular region  (3154 genes)  ISM  
GO MF
GO:0030145 [list] [network] manganese ion binding  (44 genes)  IEA  
KEGG
Protein NP_198709.1 
BLAST NP_198709.1 
Orthologous [Ortholog page] AT3G04200 (ath)  AT3G05950 (ath)  GLP9 (ath)  AT5G38910 (ath)  AT5G38940 (ath)  AT5G38960 (ath)  GLP6 (ath)  AT5G39110 (ath)  AT5G39120 (ath)  AT5G39130 (ath)  AT5G39150 (ath)  AT5G39160 (ath)  AT5G39180 (ath)  GER2 (ath)  LOC4329389 (osa)  LOC4329390 (osa)  LOC4329391 (osa)  LOC4337008 (osa)  LOC7453557 (ppo)  LOC7469831 (ppo)  LOC7469832 (ppo)  LOC7474642 (ppo)  LOC7474643 (ppo)  LOC7474644 (ppo)  LOC7480413 (ppo)  LOC7480420 (ppo)  LOC7487706 (ppo)  LOC7487730 (ppo)  LOC7489692 (ppo)  LOC7489693 (ppo)  LOC11412593 (mtr)  LOC11414422 (mtr)  LOC11414568 (mtr)  LOC11419235 (mtr)  LOC11422481 (mtr)  LOC11424092 (mtr)  LOC11424098 (mtr)  LOC11425078 (mtr)  LOC11425316 (mtr)  LOC11426661 (mtr)  LOC11433625 (mtr)  LOC11433956 (mtr)  LOC11439325 (mtr)  LOC18096031 (ppo)  LOC18103504 (ppo)  LOC18103515 (ppo)  LOC18103516 (ppo)  LOC18103521 (ppo)  LOC18104102 (ppo)  LOC18104137 (ppo)  LOC18108197 (ppo)  LOC18108199 (ppo)  LOC18108201 (ppo)  LOC18109093 (ppo)  LOC25486309 (mtr)  LOC25486310 (mtr)  LOC25486313 (mtr)  LOC100306389 (gma)  GER3 (gma)  GER12 (gma)  GER2 (gma)  GER13 (gma)  GER14 (gma)  LOC100780252 (gma)  LOC100780789 (gma)  LOC100782768 (gma)  LOC100783871 (gma)  LOC100786576 (gma)  GER4 (gma)  LOC100788721 (gma)  GER11 (gma)  LOC100797415 (gma)  GER6 (gma)  LOC100803440 (gma)  LOC100814242 (gma)  GER20 (gma)  LOC100818120 (gma)  LOC100820481 (gma)  LOC101253136 (sly)  LOC101253431 (sly)  LOC101253729 (sly)  LOC101253951 (sly)  LOC101254252 (sly)  LOC102660582 (gma)  LOC103833457 (bra)  LOC103838740 (bra)  LOC103850001 (bra)  LOC103850135 (bra)  LOC103850187 (bra)  LOC103854691 (bra)  LOC103863820 (bra)  LOC103864164 (bra)  LOC103864208 (bra)  LOC112323815 (ppo)  LOC112323840 (ppo)  LOC112323842 (ppo)  LOC112323843 (ppo)  LOC112323844 (ppo)  LOC112323845 (ppo)  LOC112323846 (ppo)  LOC112323882 (ppo)  LOC112325192 (ppo)  LOC112325612 (ppo)  LOC112326061 (ppo)  LOC123041641 (tae)  LOC123042086 (tae)  LOC123042088 (tae)  LOC123049608 (tae)  LOC123050039 (tae)  LOC123050041 (tae)  LOC123083951 (tae)  LOC123084060 (tae)  LOC123084166 (tae)  LOC123084272 (tae)  LOC123084380 (tae)  LOC123086668 (tae)  LOC123086675 (tae)  LOC123086683 (tae)  LOC123086694 (tae)  LOC123086699 (tae)  LOC123106717 (tae)  LOC123106728 (tae)  LOC123131534 (tae)  LOC123133292 (tae)  LOC123134569 (tae)  LOC123138385 (tae)  LOC123148826 (tae)  LOC123156679 (tae)  LOC123156680 (tae)  LOC123156691 (tae)  LOC123159756 (tae)  LOC123164370 (tae)  LOC123164376 (tae)  LOC123164385 (tae)  LOC123164391 (tae)  LOC123164394 (tae)  LOC123164401 (tae)  LOC123164409 (tae)  LOC123164694 (tae)  LOC123164830 (tae)  LOC123164831 (tae)  LOC123164837 (tae)  LOC123172090 (tae)  LOC123186091 (tae)  LOC123186092 (tae)  LOC123405541 (hvu)  LOC123405552 (hvu)  LOC123405572 (hvu)  LOC123412769 (hvu)  LOC123412890 (hvu)  LOC123430574 (hvu)  LOC123430805 (hvu)  LOC123430806 (hvu) 
Subcellular
localization
wolf
plas 4,  extr 1,  golg 1,  chlo 1,  mito 1,  vacu 1,  E.R. 1,  chlo_mito 1,  E.R._vacu 1  (predict for NP_198709.1)
Subcellular
localization
TargetP
scret 9  (predict for NP_198709.1)
Gene coexpression
Network*for
coexpressed
genes
LCNloc
[Cytoscape]
KEGG* ID Title #genes Link to the KEGG* map
(Multiple genes)
ath00940 Phenylpropanoid biosynthesis 2
Genes directly connected with AT5G38930 on the network
coex z* Locus Function* CoexViewer Entrez Gene ID*
17.3 AT5G38940 RmlC-like cupins superfamily protein [detail] 833886
10.9 PRB1 basic pathogenesis-related protein 1 [detail] 815945
10.5 AT3G05727 S locus-related glycoprotein 1 (SLR1) binding pollen coat protein family [detail] 3768785
4.7 AT3G10290 Nucleotide-sugar transporter family protein [detail] 820191
4.2 GAD4 glutamate decarboxylase 4 [detail] 814732
Coexpressed
gene list		 [Coexpressed gene list for AT5G38930]
Gene expression
All samples [Expression pattern for all samples]
Link to other DBs
Entrez Gene ID 833885      
Refseq ID (protein) NP_198709.1 


The preparation time of this page was 0.1 [sec].