[←][→] ath   At5g39130 Gene
functional annotation
Function   RmlC-like cupins superfamily protein    Plant GARDEN Plant GARDEN JBrowse
GO BP
GO CC
GO:0005576 [list] [network] extracellular region  (3154 genes)  ISM  
GO MF
GO:0030145 [list] [network] manganese ion binding  (44 genes)  IEA  
KEGG
Protein NP_198729.1 
BLAST NP_198729.1 
Orthologous [Ortholog page] AT3G04200 (ath)  AT3G05950 (ath)  GLP9 (ath)  AT5G38910 (ath)  AT5G38930 (ath)  AT5G38940 (ath)  AT5G38960 (ath)  GLP6 (ath)  AT5G39110 (ath)  AT5G39120 (ath)  AT5G39150 (ath)  AT5G39160 (ath)  AT5G39180 (ath)  GER2 (ath)  LOC4329389 (osa)  LOC4329390 (osa)  LOC4329391 (osa)  LOC4337008 (osa)  LOC7453557 (ppo)  LOC7469831 (ppo)  LOC7469832 (ppo)  LOC7474642 (ppo)  LOC7474643 (ppo)  LOC7474644 (ppo)  LOC7480413 (ppo)  LOC7480420 (ppo)  LOC7487706 (ppo)  LOC7487730 (ppo)  LOC7489692 (ppo)  LOC7489693 (ppo)  LOC11412593 (mtr)  LOC11414422 (mtr)  LOC11414568 (mtr)  LOC11419235 (mtr)  LOC11422481 (mtr)  LOC11424092 (mtr)  LOC11424098 (mtr)  LOC11425078 (mtr)  LOC11425316 (mtr)  LOC11426661 (mtr)  LOC11433625 (mtr)  LOC11433956 (mtr)  LOC11439325 (mtr)  LOC18096031 (ppo)  LOC18103504 (ppo)  LOC18103515 (ppo)  LOC18103516 (ppo)  LOC18103521 (ppo)  LOC18104102 (ppo)  LOC18104137 (ppo)  LOC18108197 (ppo)  LOC18108199 (ppo)  LOC18108201 (ppo)  LOC18109093 (ppo)  LOC25486309 (mtr)  LOC25486310 (mtr)  LOC25486313 (mtr)  LOC100306389 (gma)  GER3 (gma)  GER12 (gma)  GER2 (gma)  GER13 (gma)  GER14 (gma)  LOC100780252 (gma)  LOC100780789 (gma)  LOC100782768 (gma)  LOC100783871 (gma)  LOC100786576 (gma)  GER4 (gma)  LOC100788721 (gma)  GER11 (gma)  LOC100797415 (gma)  GER6 (gma)  LOC100803440 (gma)  LOC100814242 (gma)  GER20 (gma)  LOC100818120 (gma)  LOC100820481 (gma)  LOC101253136 (sly)  LOC101253431 (sly)  LOC101253729 (sly)  LOC101253951 (sly)  LOC101254252 (sly)  LOC102660582 (gma)  LOC103833457 (bra)  LOC103838740 (bra)  LOC103850001 (bra)  LOC103850135 (bra)  LOC103850187 (bra)  LOC103854691 (bra)  LOC103863820 (bra)  LOC103864164 (bra)  LOC103864208 (bra)  LOC112323815 (ppo)  LOC112323840 (ppo)  LOC112323842 (ppo)  LOC112323843 (ppo)  LOC112323844 (ppo)  LOC112323845 (ppo)  LOC112323846 (ppo)  LOC112323882 (ppo)  LOC112325192 (ppo)  LOC112325612 (ppo)  LOC112326061 (ppo)  LOC123041641 (tae)  LOC123042086 (tae)  LOC123042088 (tae)  LOC123049608 (tae)  LOC123050039 (tae)  LOC123050041 (tae)  LOC123083951 (tae)  LOC123084060 (tae)  LOC123084166 (tae)  LOC123084272 (tae)  LOC123084380 (tae)  LOC123086668 (tae)  LOC123086675 (tae)  LOC123086683 (tae)  LOC123086694 (tae)  LOC123086699 (tae)  LOC123106717 (tae)  LOC123106728 (tae)  LOC123131534 (tae)  LOC123133292 (tae)  LOC123134569 (tae)  LOC123138385 (tae)  LOC123148826 (tae)  LOC123156679 (tae)  LOC123156680 (tae)  LOC123156691 (tae)  LOC123159756 (tae)  LOC123164370 (tae)  LOC123164376 (tae)  LOC123164385 (tae)  LOC123164391 (tae)  LOC123164394 (tae)  LOC123164401 (tae)  LOC123164409 (tae)  LOC123164694 (tae)  LOC123164830 (tae)  LOC123164831 (tae)  LOC123164837 (tae)  LOC123172090 (tae)  LOC123186091 (tae)  LOC123186092 (tae)  LOC123405541 (hvu)  LOC123405552 (hvu)  LOC123405572 (hvu)  LOC123412769 (hvu)  LOC123412890 (hvu)  LOC123430574 (hvu)  LOC123430805 (hvu)  LOC123430806 (hvu) 
Subcellular
localization
wolf
extr 3,  chlo 2,  cyto 1,  mito 1,  E.R. 1,  cyto_E.R. 1  (predict for NP_198729.1)
Subcellular
localization
TargetP
scret 9  (predict for NP_198729.1)
Gene coexpression
Network*for
coexpressed
genes
LCNloc
[Cytoscape]
Genes directly connected with AT5G39130 on the network
coex z* Locus Function* CoexViewer Entrez Gene ID*
17.2 AT5G39160 RmlC-like cupins superfamily protein [detail] 833910
17.2 GER2 germin-like protein 2 [detail] 833914
6.4 AT5G39180 RmlC-like cupins superfamily protein [detail] 833912
6.3 AT5G39150 RmlC-like cupins superfamily protein [detail] 833908
6.1 AT5G39120 RmlC-like cupins superfamily protein [detail] 833905
6.0 AT3G19780 uncharacterized protein [detail] 821515
5.3 MES6 methyl esterase 6 [detail] 816887
Coexpressed
gene list		 [Coexpressed gene list for AT5G39130]
Gene expression
All samples [Expression pattern for all samples]
AtGenExpress*
(Development)
249491_at
249491_at.png

X axis is samples (pdf file), and Y axis is log2-expression.
"1st Q", "mean" and "3rd Q" indecate the values for all genes on a GeneChip. Q: quartile.

AtGenExpress*
(Stress)
249491_at
249491_at.png

X axis is samples (pdf file), and Y axis is log2-expression.
AtGenExpress*
(Hormone)
249491_at
249491_at.png

X axis is samples (xls file), and Y axis is log-expression.
Link to other DBs
Entrez Gene ID 833906      
Refseq ID (protein) NP_198729.1 


The preparation time of this page was 0.2 [sec].