[←][→] ath   At5g39160 Gene
functional annotation
Function   RmlC-like cupins superfamily protein    Plant GARDEN Plant GARDEN JBrowse
GO BP
GO CC
GO:0005576 [list] [network] extracellular region  (3154 genes)  ISM  
GO MF
GO:0030145 [list] [network] manganese ion binding  (44 genes)  IEA  
KEGG
Protein NP_001031983.1  NP_001190438.1  NP_198732.2 
BLAST NP_001031983.1  NP_001190438.1  NP_198732.2 
Orthologous [Ortholog page] AT3G04200 (ath)  AT3G05950 (ath)  GLP9 (ath)  AT5G38910 (ath)  AT5G38930 (ath)  AT5G38940 (ath)  AT5G38960 (ath)  GLP6 (ath)  AT5G39110 (ath)  AT5G39120 (ath)  AT5G39130 (ath)  AT5G39150 (ath)  AT5G39180 (ath)  GER2 (ath)  LOC4329389 (osa)  LOC4329390 (osa)  LOC4329391 (osa)  LOC4337008 (osa)  LOC7453557 (ppo)  LOC7469831 (ppo)  LOC7469832 (ppo)  LOC7474642 (ppo)  LOC7474643 (ppo)  LOC7474644 (ppo)  LOC7480413 (ppo)  LOC7480420 (ppo)  LOC7487706 (ppo)  LOC7487730 (ppo)  LOC7489692 (ppo)  LOC7489693 (ppo)  LOC11412593 (mtr)  LOC11414422 (mtr)  LOC11414568 (mtr)  LOC11419235 (mtr)  LOC11422481 (mtr)  LOC11424092 (mtr)  LOC11424098 (mtr)  LOC11425078 (mtr)  LOC11425316 (mtr)  LOC11426661 (mtr)  LOC11433625 (mtr)  LOC11433956 (mtr)  LOC11439325 (mtr)  LOC18096031 (ppo)  LOC18103504 (ppo)  LOC18103515 (ppo)  LOC18103516 (ppo)  LOC18103521 (ppo)  LOC18104102 (ppo)  LOC18104137 (ppo)  LOC18108197 (ppo)  LOC18108199 (ppo)  LOC18108201 (ppo)  LOC18109093 (ppo)  LOC25486309 (mtr)  LOC25486310 (mtr)  LOC25486313 (mtr)  LOC100306389 (gma)  GER3 (gma)  GER12 (gma)  GER2 (gma)  GER13 (gma)  GER14 (gma)  LOC100780252 (gma)  LOC100780789 (gma)  LOC100782768 (gma)  LOC100783871 (gma)  LOC100786576 (gma)  GER4 (gma)  LOC100788721 (gma)  GER11 (gma)  LOC100797415 (gma)  GER6 (gma)  LOC100803440 (gma)  LOC100814242 (gma)  GER20 (gma)  LOC100818120 (gma)  LOC100820481 (gma)  LOC101253136 (sly)  LOC101253431 (sly)  LOC101253729 (sly)  LOC101253951 (sly)  LOC101254252 (sly)  LOC102660582 (gma)  LOC103833457 (bra)  LOC103838740 (bra)  LOC103850001 (bra)  LOC103850135 (bra)  LOC103850187 (bra)  LOC103854691 (bra)  LOC103863820 (bra)  LOC103864164 (bra)  LOC103864208 (bra)  LOC112323815 (ppo)  LOC112323840 (ppo)  LOC112323842 (ppo)  LOC112323843 (ppo)  LOC112323844 (ppo)  LOC112323845 (ppo)  LOC112323846 (ppo)  LOC112323882 (ppo)  LOC112325192 (ppo)  LOC112325612 (ppo)  LOC112326061 (ppo)  LOC123041641 (tae)  LOC123042086 (tae)  LOC123042088 (tae)  LOC123049608 (tae)  LOC123050039 (tae)  LOC123050041 (tae)  LOC123083951 (tae)  LOC123084060 (tae)  LOC123084166 (tae)  LOC123084272 (tae)  LOC123084380 (tae)  LOC123086668 (tae)  LOC123086675 (tae)  LOC123086683 (tae)  LOC123086694 (tae)  LOC123086699 (tae)  LOC123106717 (tae)  LOC123106728 (tae)  LOC123131534 (tae)  LOC123133292 (tae)  LOC123134569 (tae)  LOC123138385 (tae)  LOC123148826 (tae)  LOC123156679 (tae)  LOC123156680 (tae)  LOC123156691 (tae)  LOC123159756 (tae)  LOC123164370 (tae)  LOC123164376 (tae)  LOC123164385 (tae)  LOC123164391 (tae)  LOC123164394 (tae)  LOC123164401 (tae)  LOC123164409 (tae)  LOC123164694 (tae)  LOC123164830 (tae)  LOC123164831 (tae)  LOC123164837 (tae)  LOC123172090 (tae)  LOC123186091 (tae)  LOC123186092 (tae)  LOC123405541 (hvu)  LOC123405552 (hvu)  LOC123405572 (hvu)  LOC123412769 (hvu)  LOC123412890 (hvu)  LOC123430574 (hvu)  LOC123430805 (hvu)  LOC123430806 (hvu) 
Subcellular
localization
wolf
chlo 2,  cyto 2,  vacu 2,  mito 1,  cyto_nucl 1,  E.R._vacu 1,  cyto_E.R. 1  (predict for NP_001031983.1)
chlo 3,  cyto 1,  mito 1,  vacu 1,  E.R. 1,  E.R._vacu 1,  cyto_E.R. 1  (predict for NP_001190438.1)
chlo 3,  cyto 1,  mito 1,  vacu 1,  E.R. 1,  E.R._vacu 1,  cyto_E.R. 1  (predict for NP_198732.2)
Subcellular
localization
TargetP
scret 9  (predict for NP_001031983.1)
scret 9  (predict for NP_001190438.1)
scret 9  (predict for NP_198732.2)
Gene coexpression
Network*for
coexpressed
genes
LCNloc
[Cytoscape]
Genes directly connected with AT5G39160 on the network
coex z* Locus Function* CoexViewer Entrez Gene ID*
22.0 GER2 germin-like protein 2 [detail] 833914
17.2 AT5G39130 RmlC-like cupins superfamily protein [detail] 833906
5.6 AT5G39180 RmlC-like cupins superfamily protein [detail] 833912
Coexpressed
gene list		 [Coexpressed gene list for AT5G39160]
Gene expression
All samples [Expression pattern for all samples]
Link to other DBs
Entrez Gene ID 833910      
Refseq ID (protein) NP_001031983.1 
NP_001190438.1 
NP_198732.2 


The preparation time of this page was 0.1 [sec].