[][] ath   At5g39760 Gene
functional annotation
Function   homeobox protein 23 Plant GARDENPlant GARDEN JBrowse
GO BP
GO:0001173 [list] [network] DNA-templated transcriptional start site selection  (2 genes)  IEP  
GO:0009739 [list] [network] response to gibberellin  (116 genes)  IEP  
GO:0009637 [list] [network] response to blue light  (160 genes)  IDA  
GO:0045893 [list] [network] positive regulation of DNA-templated transcription  (272 genes)  IEP  
GO CC
GO:0005634 [list] [network] nucleus  (10305 genes)  IDA ISM ISS  
GO MF
GO:0008134 [list] [network] transcription factor binding  (27 genes)  IPI  
GO:0042803 [list] [network] protein homodimerization activity  (227 genes)  IDA ISS  
GO:0000976 [list] [network] transcription cis-regulatory region binding  (708 genes)  IPI  
GO:0003677 [list] [network] DNA binding  (1277 genes)  ISS  
GO:0005515 [list] [network] protein binding  (5066 genes)  IPI  
KEGG
Protein NP_568570.1 
BLAST NP_568570.1 
Orthologous [Ortholog page] HB21 (ath)HB24 (ath)HB34 (ath)HB22 (ath)HB30 (ath)HB26 (ath)HB25 (ath)HB31 (ath)ZFHD1 (ath)LOC4339713 (osa)LOC4345673 (osa)LOC4345845 (osa)LOC4347054 (osa)LOC4347315 (osa)LOC4350177 (osa)LOC4351766 (osa)LOC7460689 (ppo)LOC7463056 (ppo)LOC7467187 (ppo)LOC7467413 (ppo)LOC7468872 (ppo)LOC7472590 (ppo)LOC7473187 (ppo)LOC7477614 (ppo)LOC7479741 (ppo)LOC7492939 (ppo)LOC7495973 (ppo)LOC11405810 (mtr)LOC11407679 (mtr)LOC11410439 (mtr)LOC11413632 (mtr)LOC11422400 (mtr)LOC11423707 (mtr)LOC11427388 (mtr)LOC11435175 (mtr)LOC18096609 (ppo)LOC18098374 (ppo)LOC18099272 (ppo)LOC18104419 (ppo)LOC25484510 (mtr)LOC100776421 (gma)LOC100781241 (gma)LOC100781788 (gma)LOC100782326 (gma)LOC100785050 (gma)LOC100786999 (gma)LOC100788836 (gma)LOC100789367 (gma)LOC100789447 (gma)LOC100789893 (gma)LOC100793926 (gma)LOC100794438 (gma)LOC100795063 (gma)LOC100798992 (gma)LOC100800005 (gma)LOC100801455 (gma)LOC100801990 (gma)LOC100803037 (gma)LOC100805652 (gma)LOC100808910 (gma)LOC100810719 (gma)LOC100811041 (gma)LOC100814730 (gma)LOC100814924 (gma)LOC100817446 (gma)LOC100820567 (gma)LOC101246239 (sly)LOC101247612 (sly)LOC101255246 (sly)LOC101261565 (sly)LOC101267309 (sly)LOC101268060 (sly)LOC101268347 (sly)LOC101268680 (sly)LOC102660309 (gma)LOC103834899 (bra)LOC103837039 (bra)LOC103837578 (bra)LOC103837853 (bra)LOC103842967 (bra)LOC103846431 (bra)LOC103852596 (bra)LOC103853989 (bra)LOC103855300 (bra)LOC103856558 (bra)LOC103862371 (bra)LOC103863915 (bra)LOC103872237 (bra)LOC103873973 (bra)LOC103875120 (bra)LOC104647583 (sly)LOC123074237 (tae)LOC123077678 (tae)LOC123082337 (tae)LOC123086753 (tae)LOC123091228 (tae)LOC123096213 (tae)LOC123098097 (tae)LOC123103890 (tae)LOC123104027 (tae)LOC123112118 (tae)LOC123112256 (tae)LOC123121651 (tae)LOC123121775 (tae)LOC123157942 (tae)LOC123177626 (tae)LOC123182313 (tae)LOC123398257 (hvu)LOC123398911 (hvu)LOC123420622 (hvu)LOC123424649 (hvu)LOC123447836 (hvu)
Subcellular
localization
wolf
nucl 6,  cyto 1,  pero 1,  cyto_pero 1  (predict for NP_568570.1)
Subcellular
localization
TargetP
other 8,  chlo 3  (predict for NP_568570.1)
Gene coexpression
Network*for
coexpressed
genes
LCNloc
[Cytoscape]
Genes directly connected with HB23 on the network
coex z* Locus Function* CoexViewer Entrez Gene ID*
9.4 HB34 homeobox protein 34 [detail] 822527
5.6 AT5G64640 Plant invertase/pectin methylesterase inhibitor superfamily [detail] 836585
5.2 HB24 homeobox protein 24 [detail] 816350
Coexpressed
gene list
[Coexpressed gene list for HB23]
Gene expression
All samples [Expression pattern for all samples]
AtGenExpress*
(Development)
249422_at
249422_at.png

X axis is samples (pdf file), and Y axis is log2-expression.
"1st Q", "mean" and "3rd Q" indecate the values for all genes on a GeneChip. Q: quartile.

AtGenExpress*
(Stress)
249422_at
249422_at.png

X axis is samples (pdf file), and Y axis is log2-expression.

AtGenExpress*
(Hormone)
249422_at
249422_at.png

X axis is samples (xls file), and Y axis is log-expression.

Link to other DBs
Entrez Gene ID 833972    
Refseq ID (protein) NP_568570.1 


The preparation time of this page was 0.1 [sec].