[][] ath   At5g48070 Gene
functional annotation
Function   xyloglucan endotransglucosylase/hydrolase 20
GO BP
GO:0010411 [list] [network] xyloglucan metabolic process  (48 genes)  IEA  
GO:0071365 [list] [network] cellular response to auxin stimulus  (88 genes)  IEP  
GO:0042546 [list] [network] cell wall biogenesis  (399 genes)  IEA  
GO:0016049 [list] [network] cell growth  (527 genes)  IGI  
GO CC
GO:0005576 [list] [network] extracellular region  (3154 genes)  ISM  
GO MF
GO:0016762 [list] [network] xyloglucan:xyloglucosyl transferase activity  (32 genes)  IEA  
GO:0030247 [list] [network] polysaccharide binding  (94 genes)  ISS  
GO:0004553 [list] [network] hydrolase activity, hydrolyzing O-glycosyl compounds  (302 genes)  IEA  
KEGG
Protein NP_199618.1 
BLAST NP_199618.1 
Orthologous [Ortholog page] XET2 (sly)BR1 (sly)XTH3 (sly)LOC543916 (sly)tXET-B2 (sly)tXET-B1 (sly)19-1-5 (gma)LOC547802 (gma)LOC606356 (tae)XET1 (gma)XTH16 (ath)XTH15 (ath)XTR6 (ath)XTH24 (ath)XTH18 (ath)XTH19 (ath)XTH25 (ath)TCH4 (ath)XTH17 (ath)LOC4336908 (osa)LOC4341940 (osa)LOC4341942 (osa)LOC4341944 (osa)LOC7461592 (ppo)LOC7464633 (ppo)LOC7466318 (ppo)LOC7478884 (ppo)LOC7479149 (ppo)LOC7480728 (ppo)LOC7480729 (ppo)LOC7483597 (ppo)LOC7485485 (ppo)LOC7488597 (ppo)LOC7488984 (ppo)LOC7488985 (ppo)LOC7488987 (ppo)LOC11424731 (mtr)LOC11429072 (mtr)LOC11432735 (mtr)LOC11441778 (mtr)LOC11445531 (mtr)LOC11446044 (mtr)LOC11446464 (mtr)LOC11446611 (mtr)LOC18100514 (ppo)LOC18100515 (ppo)LOC25501785 (mtr)LOC100499905 (gma)LOC100778237 (gma)LOC100778340 (gma)LOC100782104 (gma)LOC100782365 (gma)LOC100784191 (gma)LOC100785313 (gma)LOC100787440 (gma)LOC100799115 (gma)LOC100800017 (gma)LOC100800547 (gma)LOC100801634 (gma)LOC100807063 (gma)LOC100811671 (gma)LOC101245668 (sly)LOC101245962 (sly)LOC101255416 (sly)LOC101256574 (sly)LOC101258345 (sly)LOC101258632 (sly)LOC101258926 (sly)XTH9 (sly)LOC101265927 (sly)LOC102661404 (gma)LOC103828713 (bra)LOC103833791 (bra)LOC103834677 (bra)LOC103834678 (bra)LOC103834679 (bra)LOC103845188 (bra)LOC103845191 (bra)LOC103845192 (bra)LOC103846545 (bra)LOC103851703 (bra)LOC103851704 (bra)LOC103851705 (bra)LOC103851777 (bra)LOC103852789 (bra)LOC103861948 (bra)LOC103861949 (bra)LOC103861950 (bra)LOC103863560 (bra)LOC103863575 (bra)LOC112325846 (ppo)LOC112327961 (ppo)LOC123148727 (tae)LOC123148734 (tae)LOC123148736 (tae)LOC123148737 (tae)LOC123148738 (tae)LOC123148743 (tae)LOC123153362 (tae)LOC123153374 (tae)LOC123158862 (tae)LOC123158975 (tae)LOC123158976 (tae)LOC123162241 (tae)LOC123162722 (tae)LOC123162724 (tae)LOC123164298 (tae)LOC123164299 (tae)LOC123166841 (tae)LOC123167634 (tae)LOC123168995 (tae)LOC123407036 (hvu)LOC123407038 (hvu)LOC123410403 (hvu)LOC123410404 (hvu)LOC123410684 (hvu)LOC123412802 (hvu)
Subcellular
localization
wolf
vacu 4,  cyto 1,  mito 1,  plas 1,  mito_plas 1,  cyto_plas 1  (predict for NP_199618.1)
Subcellular
localization
TargetP
scret 9,  mito 4  (predict for NP_199618.1)
Gene coexpression
Network*for
coexpressed
genes
LCNloc
[Cytoscape]
KEGG* ID Title #genes Link to the KEGG* map
(Multiple genes)
ath00940 Phenylpropanoid biosynthesis 7
Genes directly connected with XTH20 on the network
coex z* Locus Function* CoexViewer Entrez Gene ID*
4.8 EDA21 embryo sac development arrest 21 [detail] 826940
4.6 TPR12 Tetratricopeptide repeat (TPR)-like superfamily protein [detail] 844148
4.5 AT4G08780 Peroxidase superfamily protein [detail] 826448
Coexpressed
gene list
[Coexpressed gene list for XTH20]
Gene expression
All samples [Expression pattern for all samples]
AtGenExpress*
(Development)
248732_at
248732_at.png

X axis is samples (pdf file), and Y axis is log2-expression.
"1st Q", "mean" and "3rd Q" indecate the values for all genes on a GeneChip. Q: quartile.

AtGenExpress*
(Stress)
248732_at
248732_at.png

X axis is samples (pdf file), and Y axis is log2-expression.

AtGenExpress*
(Hormone)
248732_at
248732_at.png

X axis is samples (xls file), and Y axis is log-expression.

Link to other DBs
Entrez Gene ID 834859    
Refseq ID (protein) NP_199618.1 


The preparation time of this page was 0.1 [sec].