[][] ath   At5g56370 Gene
functional annotation
Function   F-box/RNI-like/FBD-like domains-containing protein Plant GARDENPlant GARDEN JBrowse
GO BP
GO:0018205 [list] [network] peptidyl-lysine modification  (120 genes)  IEA  
GO:0016570 [list] [network] histone modification  (148 genes)  IEA  
GO:0048316 [list] [network] seed development  (1294 genes)  IEA  
GO CC
GO MF
KEGG
Protein NP_001330650.1  NP_200448.1  NP_974942.1 
BLAST NP_001330650.1  NP_200448.1  NP_974942.1 
Orthologous [Ortholog page] AT2G04230 (ath)AT2G26860 (ath)AT3G26920 (ath)AT3G26930 (ath)AT3G49020 (ath)AT3G49030 (ath)AT3G50710 (ath)AT3G51530 (ath)AT3G52680 (ath)AT3G52690 (ath)AT3G54910 (ath)AT4G09920 (ath)AT4G10400 (ath)AT4G10410 (ath)AT4G10420 (ath)AT4G13965 (ath)AT4G15060 (ath)AT4G00315 (ath)AT4G00160 (ath)AT4G26340 (ath)AT4G26350 (ath)AT5G38565 (ath)AT5G38570 (ath)AT5G38580 (ath)AT5G38590 (ath)AT5G50270 (ath)AT5G56325 (ath)AT5G56380 (ath)AT5G56390 (ath)AT5G56400 (ath)AT5G56410 (ath)AT5G56420 (ath)AT5G56440 (ath)AT5G56690 (ath)AT5G56700 (ath)AT5G56810 (ath)AT5G56820 (ath)AT5G60610 (ath)AT5G62970 (ath)AT1G32375 (ath)AT1G50980 (ath)AT1G55030 (ath)AT1G55660 (ath)LOC4345291 (osa)AT5G56452 (ath)AT3G26922 (ath)LOC9266886 (osa)LOC11413726 (mtr)LOC11414794 (mtr)LOC11419777 (mtr)LOC11419778 (mtr)LOC11421855 (mtr)LOC11423075 (mtr)LOC11423575 (mtr)LOC11423588 (mtr)LOC11423589 (mtr)LOC11423850 (mtr)LOC11424583 (mtr)LOC11425125 (mtr)LOC11425566 (mtr)LOC11430332 (mtr)LOC11431961 (mtr)LOC11432126 (mtr)LOC11432164 (mtr)LOC11432426 (mtr)LOC11432595 (mtr)LOC11432817 (mtr)LOC11434685 (mtr)LOC11435452 (mtr)LOC11441487 (mtr)LOC11441934 (mtr)LOC11442468 (mtr)LOC11443901 (mtr)LOC11444775 (mtr)LOC11444992 (mtr)LOC25482939 (mtr)LOC25483444 (mtr)LOC25485404 (mtr)LOC25485823 (mtr)LOC25490043 (mtr)LOC25492327 (mtr)LOC25492329 (mtr)LOC25494331 (mtr)LOC25497415 (mtr)LOC25497436 (mtr)LOC25497437 (mtr)LOC25497981 (mtr)LOC25498241 (mtr)LOC25498279 (mtr)LOC25498312 (mtr)LOC25499685 (mtr)AT3G49040 (ath)LOC100780535 (gma)LOC100792817 (gma)LOC100794386 (gma)LOC101247567 (sly)LOC101247617 (sly)LOC101252019 (sly)LOC101264417 (sly)LOC102661462 (gma)LOC102661539 (gma)LOC102665056 (gma)LOC103832496 (bra)LOC103833442 (bra)LOC103837190 (bra)LOC103840156 (bra)LOC103841196 (bra)LOC103841399 (bra)LOC103841400 (bra)LOC103841402 (bra)LOC103841456 (bra)LOC103841459 (bra)LOC103841726 (bra)LOC103841937 (bra)LOC103843504 (bra)LOC103844442 (bra)LOC103845079 (bra)LOC103846132 (bra)LOC103847623 (bra)LOC103850768 (bra)LOC103851807 (bra)LOC103851809 (bra)LOC103851827 (bra)LOC103851828 (bra)LOC103851829 (bra)LOC103851831 (bra)LOC103851832 (bra)LOC103851835 (bra)LOC103851921 (bra)LOC103851923 (bra)LOC103852111 (bra)LOC103852136 (bra)LOC103852138 (bra)LOC103852139 (bra)LOC103856768 (bra)LOC103856796 (bra)LOC103856797 (bra)LOC103856799 (bra)LOC103856923 (bra)LOC103856925 (bra)LOC103856926 (bra)LOC103856929 (bra)LOC103856930 (bra)LOC103856935 (bra)LOC103856936 (bra)LOC103857150 (bra)LOC103857151 (bra)LOC103857152 (bra)LOC103857209 (bra)LOC103861622 (bra)LOC103863449 (bra)LOC103864657 (bra)LOC103864754 (bra)LOC103865921 (bra)LOC103866077 (bra)LOC103866090 (bra)LOC103866312 (bra)LOC103868551 (bra)LOC103871084 (bra)LOC103871266 (bra)LOC103871677 (bra)LOC103871678 (bra)LOC103872138 (bra)LOC103873678 (bra)LOC103875264 (bra)LOC106795655 (gma)LOC107275344 (osa)LOC108870128 (bra)LOC108870344 (bra)LOC108870613 (bra)LOC112416630 (mtr)LOC112420449 (mtr)LOC117125689 (bra)LOC117128101 (bra)LOC117131459 (bra)LOC117132363 (bra)LOC117133510 (bra)LOC120576963 (mtr)LOC120576964 (mtr)LOC120576965 (mtr)LOC120577041 (mtr)LOC120577073 (mtr)LOC120579622 (mtr)LOC120580690 (mtr)LOC123066405 (tae)LOC123076506 (tae)
Subcellular
localization
wolf
cyto 6,  nucl 2,  chlo 1  (predict for NP_001330650.1)
cyto 5,  nucl 2,  chlo 1,  nucl_plas 1  (predict for NP_200448.1)
cyto 5,  nucl 2,  chlo 1,  nucl_plas 1  (predict for NP_974942.1)
Subcellular
localization
TargetP
other 7  (predict for NP_001330650.1)
other 7  (predict for NP_200448.1)
other 7  (predict for NP_974942.1)
Gene coexpression
Network*for
coexpressed
genes
LCNloc
[Cytoscape]
Genes directly connected with AT5G56370 on the network
coex z* Locus Function* CoexViewer Entrez Gene ID*
8.9 AT5G56380 F-box/RNI-like/FBD-like domains-containing protein [detail] 835739
6.8 AT5G05060 Cystatin/monellin superfamily protein [detail] 830388
5.4 AT1G65370 TRAF-like family protein [detail] 842848
4.5 MAF4 K-box region and MADS-box transcription factor family protein [detail] 836631
Coexpressed
gene list
[Coexpressed gene list for AT5G56370]
Gene expression
All samples [Expression pattern for all samples]
AtGenExpress*
(Development)
248015_at
248015_at.png

X axis is samples (pdf file), and Y axis is log2-expression.
"1st Q", "mean" and "3rd Q" indecate the values for all genes on a GeneChip. Q: quartile.

AtGenExpress*
(Stress)
248015_at
248015_at.png

X axis is samples (pdf file), and Y axis is log2-expression.

AtGenExpress*
(Hormone)
248015_at
248015_at.png

X axis is samples (xls file), and Y axis is log-expression.

Link to other DBs
Entrez Gene ID 835738    
Refseq ID (protein) NP_001330650.1 
NP_200448.1 
NP_974942.1 


The preparation time of this page was 0.1 [sec].