[][] ath   At5g56380 Gene
functional annotation
Function   F-box/RNI-like/FBD-like domains-containing protein
GO BP
GO CC
GO MF
KEGG
Protein NP_001332756.1  NP_200449.2 
BLAST NP_001332756.1  NP_200449.2 
Orthologous [Ortholog page] AT2G04230 (ath)AT2G26860 (ath)AT3G26920 (ath)AT3G26930 (ath)AT3G49020 (ath)AT3G49030 (ath)AT3G50710 (ath)AT3G51530 (ath)AT3G52680 (ath)AT3G52690 (ath)AT3G54910 (ath)AT4G09920 (ath)AT4G10400 (ath)AT4G10410 (ath)AT4G10420 (ath)AT4G13965 (ath)AT4G15060 (ath)AT4G00315 (ath)AT4G00160 (ath)AT4G26340 (ath)AT4G26350 (ath)AT5G38565 (ath)AT5G38570 (ath)AT5G38580 (ath)AT5G38590 (ath)AT5G50270 (ath)AT5G56325 (ath)AT5G56370 (ath)AT5G56390 (ath)AT5G56400 (ath)AT5G56410 (ath)AT5G56420 (ath)AT5G56440 (ath)AT5G56690 (ath)AT5G56700 (ath)AT5G56810 (ath)AT5G56820 (ath)AT5G60610 (ath)AT5G62970 (ath)AT1G32375 (ath)AT1G50980 (ath)AT1G55030 (ath)AT1G55660 (ath)LOC4345291 (osa)AT5G56452 (ath)AT3G26922 (ath)LOC9266886 (osa)LOC11413726 (mtr)LOC11414794 (mtr)LOC11419777 (mtr)LOC11419778 (mtr)LOC11421855 (mtr)LOC11423075 (mtr)LOC11423575 (mtr)LOC11423588 (mtr)LOC11423589 (mtr)LOC11423850 (mtr)LOC11424583 (mtr)LOC11425125 (mtr)LOC11425566 (mtr)LOC11430332 (mtr)LOC11431961 (mtr)LOC11432126 (mtr)LOC11432164 (mtr)LOC11432426 (mtr)LOC11432595 (mtr)LOC11432817 (mtr)LOC11434685 (mtr)LOC11435452 (mtr)LOC11441487 (mtr)LOC11441934 (mtr)LOC11442468 (mtr)LOC11443901 (mtr)LOC11444775 (mtr)LOC11444992 (mtr)LOC25482939 (mtr)LOC25483444 (mtr)LOC25485404 (mtr)LOC25485823 (mtr)LOC25490043 (mtr)LOC25492327 (mtr)LOC25492329 (mtr)LOC25494331 (mtr)LOC25497415 (mtr)LOC25497436 (mtr)LOC25497437 (mtr)LOC25497981 (mtr)LOC25498241 (mtr)LOC25498279 (mtr)LOC25498312 (mtr)LOC25499685 (mtr)AT3G49040 (ath)LOC100780535 (gma)LOC100792817 (gma)LOC100794386 (gma)LOC101247567 (sly)LOC101247617 (sly)LOC101252019 (sly)LOC101264417 (sly)LOC102661462 (gma)LOC102661539 (gma)LOC102665056 (gma)LOC103832496 (bra)LOC103833442 (bra)LOC103837190 (bra)LOC103840156 (bra)LOC103841196 (bra)LOC103841399 (bra)LOC103841400 (bra)LOC103841402 (bra)LOC103841456 (bra)LOC103841459 (bra)LOC103841726 (bra)LOC103841937 (bra)LOC103843504 (bra)LOC103844442 (bra)LOC103845079 (bra)LOC103846132 (bra)LOC103847623 (bra)LOC103850768 (bra)LOC103851807 (bra)LOC103851809 (bra)LOC103851827 (bra)LOC103851828 (bra)LOC103851829 (bra)LOC103851831 (bra)LOC103851832 (bra)LOC103851835 (bra)LOC103851921 (bra)LOC103851923 (bra)LOC103852111 (bra)LOC103852136 (bra)LOC103852138 (bra)LOC103852139 (bra)LOC103856768 (bra)LOC103856796 (bra)LOC103856797 (bra)LOC103856799 (bra)LOC103856923 (bra)LOC103856925 (bra)LOC103856926 (bra)LOC103856929 (bra)LOC103856930 (bra)LOC103856935 (bra)LOC103856936 (bra)LOC103857150 (bra)LOC103857151 (bra)LOC103857152 (bra)LOC103857209 (bra)LOC103861622 (bra)LOC103863449 (bra)LOC103864657 (bra)LOC103864754 (bra)LOC103865921 (bra)LOC103866077 (bra)LOC103866090 (bra)LOC103866312 (bra)LOC103868551 (bra)LOC103871084 (bra)LOC103871266 (bra)LOC103871677 (bra)LOC103871678 (bra)LOC103872138 (bra)LOC103873678 (bra)LOC103875264 (bra)LOC106795655 (gma)LOC107275344 (osa)LOC108870128 (bra)LOC108870344 (bra)LOC108870613 (bra)LOC112416630 (mtr)LOC112420449 (mtr)LOC117125689 (bra)LOC117128101 (bra)LOC117131459 (bra)LOC117132363 (bra)LOC117133510 (bra)LOC120576963 (mtr)LOC120576964 (mtr)LOC120576965 (mtr)LOC120577041 (mtr)LOC120577073 (mtr)LOC120579622 (mtr)LOC120580690 (mtr)LOC123066405 (tae)LOC123076506 (tae)
Subcellular
localization
wolf
nucl 7,  chlo 1,  mito 1,  cysk 1  (predict for NP_001332756.1)
nucl 7,  chlo 1,  mito 1,  cysk 1  (predict for NP_200449.2)
Subcellular
localization
TargetP
other 8  (predict for NP_001332756.1)
other 8  (predict for NP_200449.2)
Gene coexpression
Network*for
coexpressed
genes
LCNloc
[Cytoscape]
Genes directly connected with AT5G56380 on the network
coex z* Locus Function* CoexViewer Entrez Gene ID*
8.9 AT5G56370 F-box/RNI-like/FBD-like domains-containing protein [detail] 835738
7.3 AT5G51730 RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein [detail] 835247
7.2 AT4G07455 uncharacterized protein [detail] 28719924
7.0 AT1G65370 TRAF-like family protein [detail] 842848
6.9 AT5G55790 uncharacterized protein [detail] 835673
5.9 AT3G27990 [detail] 825531
5.7 AT5G65850 F-box and associated interaction domains-containing protein [detail] 836714
5.5 AT5G05060 Cystatin/monellin superfamily protein [detail] 830388
5.2 AT3G25013 Synaptobrevin family protein [detail] 6240559
4.7 AT2G07042 [detail] 6241285
Coexpressed
gene list
[Coexpressed gene list for AT5G56380]
Gene expression
All samples [Expression pattern for all samples]
AtGenExpress*
(Development)
248016_at
248016_at.png

X axis is samples (pdf file), and Y axis is log2-expression.
"1st Q", "mean" and "3rd Q" indecate the values for all genes on a GeneChip. Q: quartile.

AtGenExpress*
(Stress)
248016_at
248016_at.png

X axis is samples (pdf file), and Y axis is log2-expression.

AtGenExpress*
(Hormone)
248016_at
248016_at.png

X axis is samples (xls file), and Y axis is log-expression.

Link to other DBs
Entrez Gene ID 835739    
Refseq ID (protein) NP_001332756.1 
NP_200449.2 


The preparation time of this page was 0.1 [sec].