[][] ath   At5g59870 Gene
functional annotation
Function   histone H2A 6 Plant GARDENPlant GARDEN JBrowse
GO BP
GO:0070828 [list] [network] heterochromatin organization  (65 genes)  IGI  
GO CC
GO:0005721 [list] [network] pericentric heterochromatin  (2 genes)  IDA  
GO:0000792 [list] [network] heterochromatin  (13 genes)  IDA  
GO:0005730 [list] [network] nucleolus  (387 genes)  HDA  
GO:0009506 [list] [network] plasmodesma  (871 genes)  HDA  
GO:0009536 [list] [network] plastid  (5425 genes)  HDA  
GO:0005634 [list] [network] nucleus  (10305 genes)  ISM  
GO MF
GO:0003682 [list] [network] chromatin binding  (105 genes)  IDA  
KEGG
Protein NP_200795.1 
BLAST NP_200795.1 
Orthologous [Ortholog page] HTA12 (ath)HTA7 (ath)LOC4324481 (osa)LOC4332433 (osa)LOC4337607 (osa)LOC4339022 (osa)LOC7481741 (ppo)LOC11411375 (mtr)LOC11417382 (mtr)LOC11417443 (mtr)LOC11418081 (mtr)LOC11419991 (mtr)LOC11432258 (mtr)LOC11438704 (mtr)LOC18098681 (ppo)LOC18099970 (ppo)LOC25492532 (mtr)LOC25492555 (mtr)LOC100305705 (gma)LOC100306579 (gma)LOC100527768 (gma)LOC100783903 (gma)LOC100784431 (gma)LOC100797700 (gma)LOC100803534 (gma)HTA6 (sly)LOC101265669 (sly)LOC101265996 (sly)LOC103837172 (bra)LOC103845409 (bra)LOC103850452 (bra)LOC103851537 (bra)LOC103854667 (bra)LOC103856597 (bra)LOC103874518 (bra)LOC123059234 (tae)LOC123060340 (tae)LOC123085477 (tae)LOC123085479 (tae)LOC123085480 (tae)LOC123092566 (tae)LOC123094949 (tae)LOC123097868 (tae)LOC123097869 (tae)LOC123104024 (tae)LOC123105570 (tae)LOC123108064 (tae)LOC123108162 (tae)LOC123112253 (tae)LOC123117244 (tae)LOC123117254 (tae)LOC123117269 (tae)LOC123117395 (tae)LOC123121772 (tae)LOC123124718 (tae)LOC123125743 (tae)LOC123125929 (tae)LOC123130534 (tae)LOC123131713 (tae)LOC123131856 (tae)LOC123132238 (tae)LOC123132240 (tae)LOC123136168 (tae)LOC123136284 (tae)LOC123136287 (tae)LOC123136793 (tae)LOC123143195 (tae)LOC123143786 (tae)LOC123143789 (tae)LOC123148841 (tae)LOC123148842 (tae)LOC123149915 (tae)LOC123158925 (tae)LOC123160271 (tae)LOC123160486 (tae)LOC123161248 (tae)LOC123161338 (tae)LOC123161411 (tae)LOC123168063 (tae)LOC123168552 (tae)LOC123168885 (tae)LOC123168964 (tae)LOC123169359 (tae)LOC123180015 (tae)LOC123182278 (tae)LOC123187371 (tae)LOC123397487 (hvu)LOC123398894 (hvu)LOC123398895 (hvu)LOC123399039 (hvu)LOC123401065 (hvu)LOC123401066 (hvu)LOC123401191 (hvu)LOC123401489 (hvu)LOC123401672 (hvu)LOC123402968 (hvu)LOC123403084 (hvu)LOC123403105 (hvu)LOC123403336 (hvu)LOC123403568 (hvu)LOC123403854 (hvu)LOC123404950 (hvu)LOC123405988 (hvu)LOC123405991 (hvu)LOC123411387 (hvu)LOC123411479 (hvu)LOC123411592 (hvu)LOC123413521 (hvu)LOC123413589 (hvu)LOC123418612 (hvu)LOC123418613 (hvu)LOC123418614 (hvu)LOC123445340 (hvu)LOC123447786 (hvu)LOC123448093 (hvu)LOC123448991 (hvu)LOC123448992 (hvu)LOC123449406 (hvu)LOC123452682 (hvu)LOC123452822 (hvu)LOC123452909 (hvu)
Subcellular
localization
wolf
nucl 8,  chlo 2  (predict for NP_200795.1)
Subcellular
localization
TargetP
other 6,  chlo 5  (predict for NP_200795.1)
Gene coexpression
Network*for
coexpressed
genes
LCNloc
[Cytoscape]
Genes directly connected with HTA6 on the network
coex z* Locus Function* CoexViewer Entrez Gene ID*
26.1 AT1G09200 Histone superfamily protein [detail] 837440
24.1 AT5G65360 Histone superfamily protein [detail] 836661
19.1 AT5G10390 Histone superfamily protein [detail] 830903
17.4 AT5G10400 Histone superfamily protein [detail] 830904
17.0 HTB2 histone B2 [detail] 832352
16.9 AT3G46320 Histone superfamily protein [detail] 823777
15.5 HTA13 histone H2A 13 [detail] 821614
14.5 HTA11 histone H2A 11 [detail] 824621
12.5 AT3G54750 downstream neighbor of Son [detail] 824640
11.0 HTA8 histone H2A 8 [detail] 818463
Coexpressed
gene list
[Coexpressed gene list for HTA6]
Gene expression
All samples [Expression pattern for all samples]
AtGenExpress*
(Development)
247651_at
247651_at.png

X axis is samples (pdf file), and Y axis is log2-expression.
"1st Q", "mean" and "3rd Q" indecate the values for all genes on a GeneChip. Q: quartile.

AtGenExpress*
(Stress)
247651_at
247651_at.png

X axis is samples (pdf file), and Y axis is log2-expression.

AtGenExpress*
(Hormone)
247651_at
247651_at.png

X axis is samples (xls file), and Y axis is log-expression.

Link to other DBs
Entrez Gene ID 836109    
Refseq ID (protein) NP_200795.1 


The preparation time of this page was 0.2 [sec].