[][] ath   At5g65360 Gene
functional annotation
Function   Histone superfamily protein Plant GARDENPlant GARDEN JBrowse
GO BP
GO:0048523 [list] [network] negative regulation of cellular process  (960 genes)  IEA  
GO CC
GO:0010369 [list] [network] chromocenter  (12 genes)  IDA  
GO:0009536 [list] [network] plastid  (5425 genes)  HDA  
GO:0005634 [list] [network] nucleus  (10305 genes)  ISM  
GO MF
GO:0030527 [list] [network] structural constituent of chromatin  (16 genes)  IEA  
GO:0046982 [list] [network] protein heterodimerization activity  (97 genes)  IEA  
GO:0005515 [list] [network] protein binding  (5066 genes)  IPI  
KEGG
Protein NP_201339.1 
BLAST NP_201339.1 
Orthologous [Ortholog page] LOC544102 (sly)AT3G27360 (ath)AT4G40030 (ath)AT4G40040 (ath)AT5G10390 (ath)AT5G10400 (ath)AT5G10980 (ath)HTR11 (ath)AT1G09200 (ath)AT1G13370 (ath)MGH3 (ath)AT1G75600 (ath)LOC4325069 (osa)LOC4333019 (osa)LOC4336000 (osa)LOC4338913 (osa)LOC4340006 (osa)LOC4340203 (osa)LOC4349820 (osa)LOC7455189 (ppo)LOC7458004 (ppo)LOC7466789 (ppo)LOC7477652 (ppo)LOC7490669 (ppo)LOC7493256 (ppo)LOC7495534 (ppo)LOC7496045 (ppo)LOC9269345 (osa)LOC9271591 (osa)LOC11405531 (mtr)LOC11408671 (mtr)LOC11409321 (mtr)LOC11409357 (mtr)LOC11409976 (mtr)LOC11410249 (mtr)LOC11413536 (mtr)LOC11419237 (mtr)LOC11430310 (mtr)LOC11430980 (mtr)LOC11433985 (mtr)LOC11435575 (mtr)LOC11436749 (mtr)LOC11437960 (mtr)LOC18094306 (ppo)LOC18096107 (ppo)LOC18097281 (ppo)LOC18099681 (ppo)LOC25492607 (mtr)LOC25493065 (mtr)LOC25493536 (mtr)LOC25502181 (mtr)LOC25502270 (mtr)LOC100305466 (gma)LOC100306416 (gma)LOC100781420 (gma)LOC100783277 (gma)LOC100783845 (gma)LOC100785082 (gma)LOC100788696 (gma)LOC100789332 (gma)LOC100797506 (gma)LOC100807058 (gma)LOC100809785 (gma)LOC100810646 (gma)LOC100817768 (gma)LOC100818932 (gma)LOC101245793 (sly)LOC101250929 (sly)LOC101252717 (sly)LOC101253224 (sly)LOC101254197 (sly)LOC101260571 (sly)LOC101262275 (sly)LOC101263309 (sly)LOC101263845 (sly)LOC101267861 (sly)LOC101268556 (sly)LOC102661475 (gma)LOC102669107 (gma)LOC103830640 (bra)LOC103836349 (bra)LOC103837572 (bra)LOC103839289 (bra)LOC103850291 (bra)LOC103850326 (bra)LOC103852966 (bra)LOC103854530 (bra)LOC103854831 (bra)LOC103855863 (bra)LOC103855894 (bra)LOC107276414 (osa)LOC112326641 (ppo)LOC112326872 (ppo)LOC123045447 (tae)LOC123045621 (tae)LOC123053099 (tae)LOC123053276 (tae)LOC123053464 (tae)LOC123056226 (tae)LOC123057731 (tae)LOC123060632 (tae)LOC123062714 (tae)LOC123064940 (tae)LOC123064951 (tae)LOC123065019 (tae)LOC123065156 (tae)LOC123065167 (tae)LOC123077766 (tae)LOC123079871 (tae)LOC123083067 (tae)LOC123084869 (tae)LOC123085076 (tae)LOC123088195 (tae)LOC123088199 (tae)LOC123088208 (tae)LOC123093219 (tae)LOC123098255 (tae)LOC123098485 (tae)LOC123111760 (tae)LOC123121324 (tae)LOC123125859 (tae)LOC123129777 (tae)LOC123129797 (tae)LOC123130177 (tae)LOC123131739 (tae)LOC123131853 (tae)LOC123134870 (tae)LOC123135593 (tae)LOC123137526 (tae)LOC123142494 (tae)LOC123143161 (tae)LOC123143162 (tae)LOC123150061 (tae)LOC123150701 (tae)LOC123150820 (tae)LOC123154129 (tae)LOC123156021 (tae)LOC123157145 (tae)LOC123157517 (tae)LOC123159021 (tae)LOC123161499 (tae)LOC123166502 (tae)LOC123166703 (tae)LOC123167174 (tae)LOC123167447 (tae)LOC123169031 (tae)LOC123169919 (tae)LOC123172808 (tae)LOC123189368 (tae)LOC123401492 (hvu)LOC123402877 (hvu)LOC123406049 (hvu)LOC123407026 (hvu)LOC123407027 (hvu)LOC123407571 (hvu)LOC123407579 (hvu)LOC123407601 (hvu)LOC123407840 (hvu)LOC123407879 (hvu)LOC123407880 (hvu)LOC123409950 (hvu)LOC123410250 (hvu)LOC123410467 (hvu)LOC123410874 (hvu)LOC123411359 (hvu)LOC123411529 (hvu)LOC123413075 (hvu)LOC123413076 (hvu)LOC123413522 (hvu)LOC123424186 (hvu)LOC123426702 (hvu)LOC123426872 (hvu)LOC123426873 (hvu)LOC123427282 (hvu)LOC123440459 (hvu)LOC123440480 (hvu)LOC123444127 (hvu)LOC123444237 (hvu)LOC123444810 (hvu)LOC123446355 (hvu)LOC123449322 (hvu)LOC123449497 (hvu)LOC123452879 (hvu)
Subcellular
localization
wolf
nucl 8,  chlo 1  (predict for NP_201339.1)
Subcellular
localization
TargetP
chlo 7,  mito 3  (predict for NP_201339.1)
Gene coexpression
Network*for
coexpressed
genes
LCNloc
[Cytoscape]
Genes directly connected with AT5G65360 on the network
coex z* Locus Function* CoexViewer Entrez Gene ID*
24.9 AT1G09200 Histone superfamily protein [detail] 837440
24.1 HTA6 histone H2A 6 [detail] 836109
19.3 AT5G10390 Histone superfamily protein [detail] 830903
17.5 HTB2 histone B2 [detail] 832352
16.9 AT5G10400 Histone superfamily protein [detail] 830904
16.0 AT3G45930 Histone superfamily protein [detail] 823736
14.8 HTA13 histone H2A 13 [detail] 821614
13.1 HTB1 Histone superfamily protein [detail] 837293
9.0 GAMMA-H2AX gamma histone [detail] 841910
6.6 HTR11 histone 3 11 [detail] 836660
Coexpressed
gene list
[Coexpressed gene list for AT5G65360]
Gene expression
All samples [Expression pattern for all samples]
AtGenExpress*
(Development)
247192_at
247192_at.png

X axis is samples (pdf file), and Y axis is log2-expression.
"1st Q", "mean" and "3rd Q" indecate the values for all genes on a GeneChip. Q: quartile.

AtGenExpress*
(Stress)
247192_at
247192_at.png

X axis is samples (pdf file), and Y axis is log2-expression.

AtGenExpress*
(Hormone)
247192_at
247192_at.png

X axis is samples (xls file), and Y axis is log-expression.

Link to other DBs
Entrez Gene ID 836661    
Refseq ID (protein) NP_201339.1 


The preparation time of this page was 0.1 [sec].