[][] gma   GLYMA_14G006100 Gene
functional annotation
Function   polygalacturonase
GO BP
GO CC
GO MF
KEGG gmx00040 [list] [network] Pentose and glucuronate interconversions (207 genes)
Protein XP_003544118.1  XP_014622079.1  XP_025981115.1  XP_025981116.1 
BLAST XP_003544118.1  XP_014622079.1  XP_025981115.1  XP_025981116.1 
Orthologous [Ortholog page] LOC542387 (zma)LOC732772 (zma)AT2G15450 (ath)AT2G15460 (ath)AT2G15470 (ath)AT2G26620 (ath)AT2G33160 (ath)AT2G40310 (ath)AT3G07820 (ath)AT3G07830 (ath)AT3G07840 (ath)AT3G07850 (ath)AT3G14040 (ath)AT4G13760 (ath)AT4G18180 (ath)AT5G48140 (ath)AT1G17150 (ath)AT1G43080 (ath)AT1G43090 (ath)AT1G43100 (ath)AT1G78400 (ath)LOC4323970 (osa)LOC4328617 (osa)LOC4341242 (osa)LOC4341243 (osa)LOC4341514 (osa)LOC4341515 (osa)LOC4345285 (osa)LOC7468605 (ppo)LOC7477987 (ppo)LOC7481681 (ppo)LOC7491350 (ppo)LOC11415149 (mtr)LOC11422898 (mtr)LOC11427911 (mtr)LOC11434881 (mtr)LOC25490499 (mtr)LOC25500883 (mtr)LOC100191230 (zma)LOC100242022 (vvi)LOC100242658 (vvi)LOC100243609 (vvi)LOC100247162 (vvi)LOC100247792 (vvi)LOC100251285 (vvi)LOC100254136 (vvi)LOC100259750 (vvi)LOC100264306 (vvi)LOC100264944 (vvi)LOC100267512 (vvi)LOC100273711 (zma)LOC100273946 (zma)LOC100285881 (zma)LOC100779447 (gma)LOC100779556 (gma)LOC100780097 (gma)LOC100780628 (gma)LOC100784156 (gma)LOC100795460 (gma)LOC100810484 (gma)LOC100812594 (gma)LOC100819348 (gma)LOC101244096 (sly)LOC101245486 (sly)LOC101248339 (sly)LOC101248624 (sly)LOC101249384 (sly)LOC101249539 (sly)LOC101268588 (sly)LOC103626843 (zma)LOC103626848 (zma)LOC103629730 (zma)LOC103629733 (zma)LOC103629734 (zma)LOC103629735 (zma)LOC103629743 (zma)LOC103631311 (zma)LOC103639332 (zma)LOC103653359 (zma)LOC103828990 (bra)LOC103831485 (bra)LOC103832320 (bra)LOC103849010 (bra)LOC103849020 (bra)LOC103849039 (bra)LOC103854518 (bra)LOC103857474 (bra)LOC103857926 (bra)LOC103858095 (bra)LOC103858475 (bra)LOC103859243 (bra)LOC103859244 (bra)LOC103859245 (bra)LOC103860974 (bra)LOC103863172 (bra)LOC103865247 (bra)LOC103865787 (bra)MF16 (bra)LOC103872502 (bra)LOC103874929 (bra)LOC109121790 (vvi)LOC109123473 (vvi)
Subcellular
localization
wolf
extr 9,  chlo 1,  cyto 1  (predict for XP_003544118.1)
cyto 7,  chlo 1,  mito 1,  plas 1,  cysk 1,  chlo_mito 1,  cysk_plas 1,  mito_plas 1  (predict for XP_014622079.1)
cyto 8,  chlo 1,  plas 1,  vacu 1  (predict for XP_025981115.1)
cyto 8,  chlo 1,  plas 1,  vacu 1  (predict for XP_025981116.1)
Subcellular
localization
TargetP
scret 9  (predict for XP_003544118.1)
mito 6  (predict for XP_014622079.1)
other 5,  mito 4  (predict for XP_025981115.1)
other 5,  mito 4  (predict for XP_025981116.1)
Gene coexpression
Network*for
coexpressed
genes
LCNloc
[Cytoscape]
Genes directly connected with LOC100788863 on the network
coex z* Locus Function* Coexpression
detail
Entrez Gene ID*
3.9 LOC100779123 uncharacterized LOC100779123 [detail] 100779123
3.4 LOC100803778 uncharacterized LOC100803778 [detail] 100803778
3.1 LOC100792278 agamous-like MADS-box protein AGL18 [detail] 100792278
Coexpressed
gene list
[Coexpressed gene list for LOC100788863]
Gene expression
All samples [Expression pattern for all samples]
Link to other DBs
Entrez Gene ID 100788863    
Refseq ID (protein) XP_003544118.1 
XP_014622079.1 
XP_025981115.1 
XP_025981116.1 


The preparation time of this page was 0.2 [sec].