[][] bra   103870629 Gene
functional annotation
Function   exopolygalacturonase clone GBGA483
GO BP
GO CC
GO MF
KEGG brp00040 [list] [network] Pentose and glucuronate interconversions (206 genes)
Protein XP_009147020.1  XP_018514307.1 
BLAST XP_009147020.1  XP_018514307.1 
Orthologous [Ortholog page] LOC542387 (zma)LOC732772 (zma)AT2G15450 (ath)AT2G15460 (ath)AT2G15470 (ath)AT2G26620 (ath)AT2G33160 (ath)AT2G40310 (ath)AT3G07820 (ath)AT3G07830 (ath)AT3G07840 (ath)AT3G07850 (ath)AT3G14040 (ath)AT4G13760 (ath)AT4G18180 (ath)AT5G48140 (ath)AT1G17150 (ath)AT1G43080 (ath)AT1G43090 (ath)AT1G43100 (ath)AT1G78400 (ath)LOC4323970 (osa)LOC4328617 (osa)LOC4341242 (osa)LOC4341243 (osa)LOC4341514 (osa)LOC4341515 (osa)LOC4345285 (osa)LOC7468605 (ppo)LOC7477987 (ppo)LOC7481681 (ppo)LOC7491350 (ppo)LOC11415149 (mtr)LOC11422898 (mtr)LOC11427911 (mtr)LOC11434881 (mtr)LOC25490499 (mtr)LOC25500883 (mtr)LOC100191230 (zma)LOC100242022 (vvi)LOC100242658 (vvi)LOC100243609 (vvi)LOC100247162 (vvi)LOC100247792 (vvi)LOC100251285 (vvi)LOC100254136 (vvi)LOC100259750 (vvi)LOC100264306 (vvi)LOC100264944 (vvi)LOC100267512 (vvi)LOC100273711 (zma)LOC100273946 (zma)LOC100285881 (zma)LOC100779447 (gma)LOC100779556 (gma)LOC100780097 (gma)LOC100780628 (gma)LOC100784156 (gma)LOC100788863 (gma)LOC100795460 (gma)LOC100810484 (gma)LOC100812594 (gma)LOC100819348 (gma)LOC101244096 (sly)LOC101245486 (sly)LOC101248339 (sly)LOC101248624 (sly)LOC101249384 (sly)LOC101249539 (sly)LOC101268588 (sly)LOC103626843 (zma)LOC103626848 (zma)LOC103629730 (zma)LOC103629733 (zma)LOC103629734 (zma)LOC103629735 (zma)LOC103629743 (zma)LOC103631311 (zma)LOC103639332 (zma)LOC103653359 (zma)LOC103828990 (bra)LOC103831485 (bra)LOC103832320 (bra)LOC103849010 (bra)LOC103849020 (bra)LOC103849039 (bra)LOC103854518 (bra)LOC103857474 (bra)LOC103857926 (bra)LOC103858095 (bra)LOC103858475 (bra)LOC103859243 (bra)LOC103859244 (bra)LOC103859245 (bra)LOC103860974 (bra)LOC103863172 (bra)LOC103865247 (bra)LOC103865787 (bra)LOC103872502 (bra)LOC103874929 (bra)LOC109121790 (vvi)LOC109123473 (vvi)
Subcellular
localization
wolf
extr 3,  vacu 2,  mito 1,  E.R. 1,  chlo 1,  golg 1,  cyto_nucl 1,  cyto_mito 1,  E.R._plas 1,  mito_plas 1  (predict for XP_009147020.1)
extr 3,  vacu 2,  mito 1,  E.R. 1,  chlo 1,  golg 1,  cyto_nucl 1,  cyto_mito 1,  E.R._plas 1,  mito_plas 1  (predict for XP_018514307.1)
Subcellular
localization
TargetP
scret 7  (predict for XP_009147020.1)
scret 7  (predict for XP_018514307.1)
Gene coexpression
Network*for
coexpressed
genes
LCNloc
[Cytoscape]
KEGG* ID Title #genes Link to the KEGG* map
(Multiple genes)
bra00040 Pentose and glucuronate interconversions 6
Genes directly connected with MF16 on the network
coex z* Locus Function* Coexpression
detail
Entrez Gene ID*
8.3 LOC103849010 polygalacturonase [detail] 103849010
6.5 LOC103859244 polygalacturonase [detail] 103859244
6.0 LOC103847061 pectinesterase PPME1 [detail] 103847061
Coexpressed
gene list
[Coexpressed gene list for MF16]
Gene expression
All samples [Expression pattern for all samples]
Link to other DBs
Entrez Gene ID 103870629    
Refseq ID (protein) XP_009147020.1 
XP_018514307.1 


The preparation time of this page was 0.2 [sec].