[][] ath   At1g12210 Gene
functional annotation
Function   RPS5-like 1 Plant GARDENPlant GARDEN JBrowse
GO BP
GO:0009617 [list] [network] response to bacterium  (1192 genes)  ISS  
GO CC
GO:0005634 [list] [network] nucleus  (10305 genes)  ISM  
GO MF
GO:0043531 [list] [network] ADP binding  (164 genes)  IEA  
KEGG
Protein NP_001321385.1  NP_001321386.1  NP_172685.1 
BLAST NP_001321385.1  NP_001321386.1  NP_172685.1 
Orthologous [Ortholog page] AT3G15700 (ath)AT4G10780 (ath)RPS2 (ath)AT5G05400 (ath)AT5G43730 (ath)AT5G43740 (ath)AT5G47250 (ath)AT5G47260 (ath)AT5G63020 (ath)RPS5 (ath)SUMM2 (ath)AT1G12290 (ath)AT1G15890 (ath)AT1G51480 (ath)AT1G52660 (ath)AT1G61180 (ath)AT1G61190 (ath)AT1G61300 (ath)AT1G61310 (ath)AT1G62630 (ath)AT1G63350 (ath)AT1G63360 (ath)LOC4325415 (osa)LOC4325862 (osa)LOC4336120 (osa)LOC4346689 (osa)LOC7461677 (ppo)LOC7462354 (ppo)LOC7481694 (ppo)LOC9272234 (osa)LOC11421862 (mtr)LOC11424413 (mtr)LOC18095644 (ppo)LOC18095984 (ppo)LOC18100365 (ppo)LOC25482383 (mtr)LOC25497292 (mtr)LOC100781638 (gma)LOC103830034 (bra)LOC103836174 (bra)LOC103836180 (bra)LOC103836336 (bra)LOC103839625 (bra)LOC103839728 (bra)LOC103840547 (bra)LOC103840924 (bra)LOC103840985 (bra)LOC103843070 (bra)LOC103843072 (bra)LOC103843137 (bra)LOC103843140 (bra)LOC103843147 (bra)LOC103843924 (bra)LOC103862247 (bra)LOC103863856 (bra)LOC103867876 (bra)LOC103871198 (bra)LOC103871262 (bra)LOC103871332 (bra)LOC103871360 (bra)LOC103871361 (bra)LOC103871395 (bra)LOC103872209 (bra)LOC103872210 (bra)LOC103872389 (bra)LOC107275341 (osa)LOC107275558 (osa)LOC107276074 (osa)LOC107278834 (osa)LOC108868774 (bra)LOC109119058 (sly)LOC112325499 (ppo)LOC117125860 (bra)LOC117128534 (bra)LOC123046127 (tae)LOC123047302 (tae)LOC123054006 (tae)LOC123054007 (tae)LOC123054009 (tae)LOC123062280 (tae)LOC123063490 (tae)LOC123071040 (tae)LOC123079413 (tae)LOC123189896 (tae)LOC123427234 (hvu)LOC123444597 (hvu)LOC123445558 (hvu)
Subcellular
localization
wolf
nucl 2,  plas 2,  cysk_nucl 1,  E.R._plas 1,  cyto_plas 1,  chlo 1,  cyto 1,  E.R. 1,  cyto_E.R. 1  (predict for NP_001321385.1)
nucl 2,  plas 2,  cysk_nucl 1,  E.R._plas 1,  cyto_plas 1,  chlo 1,  cyto 1,  E.R. 1,  cyto_E.R. 1  (predict for NP_001321386.1)
chlo 3,  nucl 2,  plas 2,  cysk_nucl 1,  cyto_plas 1  (predict for NP_172685.1)
Subcellular
localization
TargetP
other 8,  mito 3  (predict for NP_001321385.1)
other 8,  mito 3  (predict for NP_001321386.1)
other 4  (predict for NP_172685.1)
Gene coexpression
Network*for
coexpressed
genes
Coexpressed
gene list
[Coexpressed gene list for RFL1]
Gene expression
All samples [Expression pattern for all samples]
AtGenExpress*
(Development)
260996_at
260996_at.png

X axis is samples (pdf file), and Y axis is log2-expression.
"1st Q", "mean" and "3rd Q" indecate the values for all genes on a GeneChip. Q: quartile.

AtGenExpress*
(Stress)
260996_at
260996_at.png

X axis is samples (pdf file), and Y axis is log2-expression.

AtGenExpress*
(Hormone)
260996_at
260996_at.png

X axis is samples (xls file), and Y axis is log-expression.

Link to other DBs
Entrez Gene ID 837774    
Refseq ID (protein) NP_001321385.1 
NP_001321386.1 
NP_172685.1 


The preparation time of this page was 0.1 [sec].