[][] ath   At2g28990 Gene
functional annotation
Function   Leucine-rich repeat protein kinase family protein Plant GARDENPlant GARDEN JBrowse
GO BP
GO:0006820 [list] [network] monoatomic anion transport  (35 genes)  IEA  
GO:0031668 [list] [network] cellular response to extracellular stimulus  (255 genes)  IEA  
GO:1901565 [list] [network] organonitrogen compound catabolic process  (591 genes)  IEA  
GO:0006468 [list] [network] protein phosphorylation  (639 genes)  IEA  
GO:0044248 [list] [network] cellular catabolic process  (1086 genes)  IEA  
GO CC
GO MF
GO:0004674 [list] [network] protein serine/threonine kinase activity  (454 genes)  IEA  
GO:0016301 [list] [network] kinase activity  (1068 genes)  ISS  
GO:0005515 [list] [network] protein binding  (5066 genes)  IPI  
KEGG
Protein NP_001318310.1  NP_180465.1 
BLAST NP_001318310.1  NP_180465.1 
Orthologous [Ortholog page] AT2G04300 (ath)AT2G14440 (ath)AT2G14510 (ath)FRK1 (ath)AT2G19210 (ath)AT2G19230 (ath)AT2G28960 (ath)AT2G28970 (ath)AT2G29000 (ath)AT3G21340 (ath)MEE39 (ath)AT3G46340 (ath)AT3G46370 (ath)AT3G46400 (ath)AT3G46420 (ath)AT4G20450 (ath)RHS16 (ath)AT4G29450 (ath)AT4G29990 (ath)AT5G16900 (ath)AT5G59650 (ath)AT5G59670 (ath)AT5G59680 (ath)AT1G05700 (ath)AT1G07550 (ath)AT1G07560 (ath)AT1G49100 (ath)AT1G51790 (ath)IOS1 (ath)AT1G51805 (ath)AT1G51810 (ath)AT1G51820 (ath)AT1G51830 (ath)AT1G51850 (ath)AT1G51860 (ath)AT1G51870 (ath)RHS6 (ath)AT1G51890 (ath)AT1G51910 (ath)LOC4328315 (osa)LOC4338207 (osa)LOC4339370 (osa)LOC4339371 (osa)LOC4339374 (osa)LOC4339376 (osa)LOC4339378 (osa)LOC4346819 (osa)LOC4346820 (osa)LOC4346821 (osa)LOC4346822 (osa)LOC4346823 (osa)LOC4346825 (osa)LOC4346833 (osa)LOC4346837 (osa)LOC4346841 (osa)LOC7494617 (ppo)LOC9266163 (osa)LOC9267814 (osa)LOC9267979 (osa)LOC9272354 (osa)LOC11421236 (mtr)LOC11422007 (mtr)LOC11425516 (mtr)LOC11429446 (mtr)LOC11433438 (mtr)LOC11434037 (mtr)LOC11437028 (mtr)LOC18108501 (ppo)LOC18108503 (ppo)LOC18108531 (ppo)LOC18110286 (ppo)LOC18110288 (ppo)LOC18110448 (ppo)LOC18110542 (ppo)LOC18110545 (ppo)LOC18110550 (ppo)LOC25497008 (mtr)LOC25500355 (mtr)LOC25500358 (mtr)LOC25500359 (mtr)LOC25500361 (mtr)LOC25500364 (mtr)LOC25500366 (mtr)LOC25500367 (mtr)LOC25500376 (mtr)LOC25500764 (mtr)LOC25502465 (mtr)SIK2 (gma)LOC100775741 (gma)LOC100776284 (gma)LOC100776818 (gma)LOC100778537 (gma)LOC100779102 (gma)LOC100779474 (gma)LOC100779617 (gma)LOC100781084 (gma)LOC100781785 (gma)LOC100785345 (gma)LOC100791717 (gma)LOC100792239 (gma)LOC100793137 (gma)LOC100794504 (gma)LOC100795183 (gma)LOC100818475 (gma)LOC101257947 (sly)LOC101262429 (sly)LOC101266705 (sly)LOC102662730 (gma)LOC102663143 (gma)LOC103829493 (bra)LOC103829497 (bra)LOC103836435 (bra)LOC103843445 (bra)LOC103844100 (bra)LOC103845385 (bra)LOC103850089 (bra)LOC103851563 (bra)LOC103851564 (bra)LOC103851565 (bra)LOC103851763 (bra)LOC103853036 (bra)LOC103853548 (bra)LOC103856616 (bra)LOC103859903 (bra)LOC103861877 (bra)LOC103864933 (bra)LOC103864934 (bra)LOC103868533 (bra)LOC103868536 (bra)LOC103868540 (bra)LOC103868542 (bra)LOC103868543 (bra)LOC103868545 (bra)LOC103868632 (bra)LOC103869180 (bra)LOC103871250 (bra)LOC103871251 (bra)LOC103871253 (bra)LOC103871255 (bra)LOC103873634 (bra)LOC106794186 (gma)LOC106799536 (gma)LOC107275782 (osa)LOC107276230 (osa)LOC107276752 (osa)LOC107278492 (osa)LOC107278845 (osa)LOC112325225 (ppo)LOC112416101 (mtr)LOC112417465 (mtr)LOC112936039 (osa)LOC117125683 (bra)LOC120575758 (mtr)LOC123043522 (tae)LOC123044006 (tae)LOC123044087 (tae)LOC123044243 (tae)LOC123054720 (tae)LOC123063692 (tae)LOC123067573 (tae)LOC123079142 (tae)LOC123080188 (tae)LOC123080196 (tae)LOC123080205 (tae)LOC123080238 (tae)LOC123083057 (tae)LOC123084992 (tae)LOC123085003 (tae)LOC123086249 (tae)LOC123094168 (tae)LOC123094169 (tae)LOC123096526 (tae)LOC123096537 (tae)LOC123096545 (tae)LOC123096554 (tae)LOC123096599 (tae)LOC123096617 (tae)LOC123096813 (tae)LOC123097489 (tae)LOC123103544 (tae)LOC123106972 (tae)LOC123114350 (tae)LOC123114773 (tae)LOC123116086 (tae)LOC123120524 (tae)LOC123124720 (tae)LOC123126207 (tae)LOC123132270 (tae)LOC123132271 (tae)LOC123132273 (tae)LOC123136316 (tae)LOC123136318 (tae)LOC123136319 (tae)LOC123138953 (tae)LOC123140966 (tae)LOC123143830 (tae)LOC123143832 (tae)LOC123143833 (tae)LOC123143893 (tae)LOC123157067 (tae)LOC123160036 (tae)LOC123160179 (tae)LOC123160205 (tae)LOC123160231 (tae)LOC123162979 (tae)LOC123162990 (tae)LOC123173379 (tae)LOC123173395 (tae)LOC123173449 (tae)LOC123179719 (tae)LOC123179738 (tae)LOC123179780 (tae)LOC123180475 (tae)LOC123182688 (tae)LOC123182689 (tae)LOC123395140 (hvu)LOC123398290 (hvu)LOC123401280 (hvu)LOC123401354 (hvu)LOC123401635 (hvu)LOC123404089 (hvu)LOC123404264 (hvu)LOC123404421 (hvu)LOC123404434 (hvu)LOC123404717 (hvu)LOC123408210 (hvu)LOC123416831 (hvu)LOC123416847 (hvu)LOC123416895 (hvu)LOC123440187 (hvu)LOC123442690 (hvu)LOC123448982 (hvu)LOC123450805 (hvu)LOC123450806 (hvu)
Subcellular
localization
wolf
plas 6,  E.R. 2,  mito 1,  vacu 1  (predict for NP_001318310.1)
plas 6,  E.R. 2,  mito 1,  vacu 1  (predict for NP_180465.1)
Subcellular
localization
TargetP
scret 9  (predict for NP_001318310.1)
scret 9  (predict for NP_180465.1)
Gene coexpression
Network*for
coexpressed
genes
LCNloc
[Cytoscape]
KEGG* ID Title #genes Link to the KEGG* map
(Multiple genes)
ath04016 MAPK signaling pathway - plant 2
ath04626 Plant-pathogen interaction 2
Genes directly connected with AT2G28990 on the network
coex z* Locus Function* Coexpression
detail
Entrez Gene ID*
8.4 AT2G28960 Leucine-rich repeat protein kinase family protein [detail] 817445
8.2 AT2G28970 Leucine-rich repeat protein kinase family protein [detail] 817446
8.2 AT1G07560 Leucine-rich repeat protein kinase family protein [detail] 837270
4.9 AT4G07820 CAP (Cysteine-rich secretory proteins, Antigen 5, and Pathogenesis-related 1 protein) superfamily protein [detail] 826263
Coexpressed
gene list
[Coexpressed gene list for AT2G28990]
Gene expression
All samples [Expression pattern for all samples]
AtGenExpress*
(Development)
266787_at
266787_at.png

X axis is samples (pdf file), and Y axis is log2-expression.
"1st Q", "mean" and "3rd Q" indecate the values for all genes on a GeneChip. Q: quartile.

AtGenExpress*
(Stress)
266787_at
266787_at.png

X axis is samples (pdf file), and Y axis is log2-expression.

AtGenExpress*
(Hormone)
266787_at
266787_at.png

X axis is samples (xls file), and Y axis is log-expression.

Link to other DBs
Entrez Gene ID 817448    
Refseq ID (protein) NP_001318310.1 
NP_180465.1 


The preparation time of this page was 0.5 [sec].