[←][→] ath   At5g56420 Gene
functional annotation
Function   F-box/RNI-like/FBD-like domains-containing protein    Plant GARDEN Plant GARDEN JBrowse
GO BP
GO CC
GO MF
KEGG
Protein NP_001318810.1  NP_200453.1  NP_974943.1 
BLAST NP_001318810.1  NP_200453.1  NP_974943.1 
Orthologous [Ortholog page] AT2G04230 (ath)  AT2G26860 (ath)  AT3G26920 (ath)  AT3G26930 (ath)  AT3G49020 (ath)  AT3G49030 (ath)  AT3G50710 (ath)  AT3G51530 (ath)  AT3G52680 (ath)  AT3G52690 (ath)  AT3G54910 (ath)  AT4G09920 (ath)  AT4G10400 (ath)  AT4G10410 (ath)  AT4G10420 (ath)  AT4G13965 (ath)  AT4G15060 (ath)  AT4G00315 (ath)  AT4G00160 (ath)  AT4G26340 (ath)  AT4G26350 (ath)  AT5G38565 (ath)  AT5G38570 (ath)  AT5G38580 (ath)  AT5G38590 (ath)  AT5G50270 (ath)  AT5G56325 (ath)  AT5G56370 (ath)  AT5G56380 (ath)  AT5G56390 (ath)  AT5G56400 (ath)  AT5G56410 (ath)  AT5G56440 (ath)  AT5G56690 (ath)  AT5G56700 (ath)  AT5G56810 (ath)  AT5G56820 (ath)  AT5G60610 (ath)  AT5G62970 (ath)  AT1G32375 (ath)  AT1G50980 (ath)  AT1G55030 (ath)  AT1G55660 (ath)  LOC4345291 (osa)  AT5G56452 (ath)  AT3G26922 (ath)  LOC9266886 (osa)  LOC11413726 (mtr)  LOC11414794 (mtr)  LOC11419777 (mtr)  LOC11419778 (mtr)  LOC11421855 (mtr)  LOC11423075 (mtr)  LOC11423575 (mtr)  LOC11423588 (mtr)  LOC11423589 (mtr)  LOC11423850 (mtr)  LOC11424583 (mtr)  LOC11425125 (mtr)  LOC11425566 (mtr)  LOC11430332 (mtr)  LOC11431961 (mtr)  LOC11432126 (mtr)  LOC11432164 (mtr)  LOC11432426 (mtr)  LOC11432595 (mtr)  LOC11432817 (mtr)  LOC11434685 (mtr)  LOC11435452 (mtr)  LOC11441487 (mtr)  LOC11441934 (mtr)  LOC11442468 (mtr)  LOC11443901 (mtr)  LOC11444775 (mtr)  LOC11444992 (mtr)  LOC25482939 (mtr)  LOC25483444 (mtr)  LOC25485404 (mtr)  LOC25485823 (mtr)  LOC25490043 (mtr)  LOC25492327 (mtr)  LOC25492329 (mtr)  LOC25494331 (mtr)  LOC25497415 (mtr)  LOC25497436 (mtr)  LOC25497437 (mtr)  LOC25497981 (mtr)  LOC25498241 (mtr)  LOC25498279 (mtr)  LOC25498312 (mtr)  LOC25499685 (mtr)  AT3G49040 (ath)  LOC100780535 (gma)  LOC100792817 (gma)  LOC100794386 (gma)  LOC101247567 (sly)  LOC101247617 (sly)  LOC101252019 (sly)  LOC101264417 (sly)  LOC102661462 (gma)  LOC102661539 (gma)  LOC102665056 (gma)  LOC103832496 (bra)  LOC103833442 (bra)  LOC103837190 (bra)  LOC103840156 (bra)  LOC103841196 (bra)  LOC103841399 (bra)  LOC103841400 (bra)  LOC103841402 (bra)  LOC103841456 (bra)  LOC103841459 (bra)  LOC103841726 (bra)  LOC103841937 (bra)  LOC103843504 (bra)  LOC103844442 (bra)  LOC103845079 (bra)  LOC103846132 (bra)  LOC103847623 (bra)  LOC103850768 (bra)  LOC103851807 (bra)  LOC103851809 (bra)  LOC103851827 (bra)  LOC103851828 (bra)  LOC103851829 (bra)  LOC103851831 (bra)  LOC103851832 (bra)  LOC103851835 (bra)  LOC103851921 (bra)  LOC103851923 (bra)  LOC103852111 (bra)  LOC103852136 (bra)  LOC103852138 (bra)  LOC103852139 (bra)  LOC103856768 (bra)  LOC103856796 (bra)  LOC103856797 (bra)  LOC103856799 (bra)  LOC103856923 (bra)  LOC103856925 (bra)  LOC103856926 (bra)  LOC103856929 (bra)  LOC103856930 (bra)  LOC103856935 (bra)  LOC103856936 (bra)  LOC103857150 (bra)  LOC103857151 (bra)  LOC103857152 (bra)  LOC103857209 (bra)  LOC103861622 (bra)  LOC103863449 (bra)  LOC103864657 (bra)  LOC103864754 (bra)  LOC103865921 (bra)  LOC103866077 (bra)  LOC103866090 (bra)  LOC103866312 (bra)  LOC103868551 (bra)  LOC103871084 (bra)  LOC103871266 (bra)  LOC103871677 (bra)  LOC103871678 (bra)  LOC103872138 (bra)  LOC103873678 (bra)  LOC103875264 (bra)  LOC106795655 (gma)  LOC107275344 (osa)  LOC108870128 (bra)  LOC108870344 (bra)  LOC108870613 (bra)  LOC112416630 (mtr)  LOC112420449 (mtr)  LOC117125689 (bra)  LOC117128101 (bra)  LOC117131459 (bra)  LOC117132363 (bra)  LOC117133510 (bra)  LOC120576963 (mtr)  LOC120576964 (mtr)  LOC120576965 (mtr)  LOC120577041 (mtr)  LOC120577073 (mtr)  LOC120579622 (mtr)  LOC120580690 (mtr)  LOC123066405 (tae)  LOC123076506 (tae) 
Subcellular
localization
wolf
nucl 6,  cyto 1,  chlo 1,  mito 1,  plas 1,  pero 1,  chlo_mito 1,  mito_plas 1,  cyto_E.R. 1  (predict for NP_001318810.1)
nucl 6,  cyto 1,  chlo 1,  mito 1,  plas 1,  pero 1,  chlo_mito 1,  mito_plas 1,  cyto_E.R. 1  (predict for NP_200453.1)
nucl 6,  cyto 1,  chlo 1,  mito 1,  plas 1,  pero 1,  chlo_mito 1,  mito_plas 1,  cyto_E.R. 1  (predict for NP_974943.1)
Subcellular
localization
TargetP
other 5  (predict for NP_001318810.1)
other 5  (predict for NP_200453.1)
other 5  (predict for NP_974943.1)
Gene coexpression
Network*for
coexpressed
genes
LCNloc
[Cytoscape]
Genes directly connected with AT5G56420 on the network
coex z* Locus Function* Coexpression
detail		 Entrez Gene ID*
7.4 AT3G59150 F-box/RNI superfamily protein [detail] 825084
6.5 AT5G15710 Galactose oxidase/kelch repeat superfamily protein [detail] 831425
6.3 AT1G19980 cytomatrix protein-like protein [detail] 838587
6.1 AT1G64840 LOW protein: F-box/kelch-repeat protein (DUF295) [detail] 842792
5.9 AT2G14850 transcriptional regulator of RNA polII, SAGA, subunit [detail] 815974
5.6 CF9 Carbohydrate-binding protein [detail] 842241
5.5 AT5G02910 F-box/RNI-like superfamily protein [detail] 831746
5.0 AT1G43770 RING/FYVE/PHD zinc finger superfamily protein [detail] 840971
Coexpressed
gene list		 [Coexpressed gene list for AT5G56420]
Gene expression
All samples [Expression pattern for all samples]
Link to other DBs
Entrez Gene ID 835743      
Refseq ID (protein) NP_001318810.1 
NP_200453.1 
NP_974943.1 


The preparation time of this page was 0.5 [sec].