[][] ath   At3g46520 Gene
functional annotation
Function   actin-12 Plant GARDENPlant GARDEN JBrowse
GO BP
GO:0007010 [list] [network] cytoskeleton organization  (205 genes)  ISS TAS  
GO CC
GO:0005856 [list] [network] cytoskeleton  (230 genes)  TAS  
GO:0009941 [list] [network] chloroplast envelope  (582 genes)  HDA  
GO:0009570 [list] [network] chloroplast stroma  (705 genes)  HDA  
GO:0005829 [list] [network] cytosol  (2559 genes)  HDA  
GO:0005739 [list] [network] mitochondrion  (4228 genes)  HDA  
GO:0005737 [list] [network] cytoplasm  (13880 genes)  ISM  
GO MF
GO:0005200 [list] [network] structural constituent of cytoskeleton  (24 genes)  ISS  
KEGG
Protein NP_001327017.1  NP_190236.1 
BLAST NP_001327017.1  NP_190236.1 
Orthologous [Ortholog page] LOC542814 (tae)LOC543120 (tae)ACT1 (ath)ACT9 (ath)AT2G42100 (ath)AT2G42170 (ath)ACT11 (ath)ACT2 (ath)ACT3 (ath)ACT7 (ath)ACT4 (ath)ACT8 (ath)LOC4325068 (osa)LOC4333919 (osa)LOC4334702 (osa)LOC4337566 (osa)LOC4338914 (osa)LOC4349087 (osa)LOC4349863 (osa)LOC4351585 (osa)LOC4352927 (osa)LOC7458147 (ppo)LOC7467546 (ppo)LOC7479526 (ppo)LOC7483974 (ppo)LOC7489063 (ppo)LOC7490729 (ppo)LOC7492024 (ppo)LOC9269066 (osa)LOC11425201 (mtr)LOC11428527 (mtr)LOC11431140 (mtr)LOC11441933 (mtr)LOC18100314 (ppo)LOC18108099 (ppo)LOC25479628 (mtr)LOC25487878 (mtr)LOC25495077 (mtr)LOC100777460 (gma)LOC100777705 (gma)LOC100778206 (gma)LOC100781142 (gma)LOC100781831 (gma)LOC100787265 (gma)LOC100789000 (gma)LOC100792119 (gma)LOC100797704 (gma)LOC100798052 (gma)SOY69 (gma)LOC100799890 (gma)LOC100806695 (gma)LOC100807341 (gma)LOC100811630 (gma)LOC100813210 (gma)LOC100813437 (gma)LOC100815472 (gma)LOC101249734 (sly)LOC101250165 (sly)LOC101253675 (sly)LOC101255046 (sly)LOC101255728 (sly)actin (sly)LOC101262163 (sly)Tom52 (sly)LOC101264220 (sly)ACT (sly)LOC101264618 (sly)LOC103838412 (bra)LOC103841298 (bra)LOC103845362 (bra)LOC103846860 (bra)LOC103850356 (bra)LOC103851581 (bra)LOC103855835 (bra)LOC103856636 (bra)LOC103857724 (bra)LOC103859774 (bra)LOC103863285 (bra)LOC103865617 (bra)LOC103867177 (bra)ACT1 (bra)LOC103870277 (bra)LOC103873303 (bra)LOC103873596 (bra)LOC103873698 (bra)LOC112325314 (ppo)LOC123048645 (tae)LOC123057740 (tae)LOC123062711 (tae)LOC123071529 (tae)LOC123079869 (tae)LOC123087081 (tae)LOC123090883 (tae)LOC123095909 (tae)LOC123101898 (tae)LOC123102963 (tae)LOC123103657 (tae)LOC123110037 (tae)LOC123111117 (tae)LOC123114174 (tae)LOC123119001 (tae)LOC123120107 (tae)LOC123123661 (tae)LOC123124811 (tae)LOC123179078 (tae)LOC123179877 (tae)LOC123181307 (tae)LOC123182166 (tae)LOC123185737 (tae)LOC123394939 (hvu)LOC123398932 (hvu)LOC123399877 (hvu)LOC123430406 (hvu)LOC123434401 (hvu)LOC123444811 (hvu)LOC123446308 (hvu)LOC123447531 (hvu)
Subcellular
localization
wolf
cysk 10  (predict for NP_001327017.1)
cysk 10  (predict for NP_190236.1)
Subcellular
localization
TargetP
other 8  (predict for NP_001327017.1)
other 8  (predict for NP_190236.1)
Gene coexpression
Network*for
coexpressed
genes
LCNloc
[Cytoscape]
KEGG* ID Title #genes Link to the KEGG* map
(Multiple genes)
ath00040 Pentose and glucuronate interconversions 2
Genes directly connected with ACT12 on the network
coex z* Locus Function* CoexViewer Entrez Gene ID*
6.9 AT5G38760 Late embryogenesis abundant protein (LEA) family protein [detail] 833867
6.7 AT5G61720 hypothetical protein (DUF1216) [detail] 836294
6.5 AT3G28780 transmembrane protein, putative (DUF1216) [detail] 822510
Coexpressed
gene list
[Coexpressed gene list for ACT12]
Gene expression
All samples [Expression pattern for all samples]
AtGenExpress*
(Development)
252531_at
252531_at.png

X axis is samples (pdf file), and Y axis is log2-expression.
"1st Q", "mean" and "3rd Q" indecate the values for all genes on a GeneChip. Q: quartile.

AtGenExpress*
(Stress)
252531_at
252531_at.png

X axis is samples (pdf file), and Y axis is log2-expression.

AtGenExpress*
(Hormone)
252531_at
252531_at.png

X axis is samples (xls file), and Y axis is log-expression.

Link to other DBs
Entrez Gene ID 823805    
Refseq ID (protein) NP_001327017.1 
NP_190236.1 


The preparation time of this page was 0.1 [sec].